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新型リボザイムにおける構造-活性相関及び非標準型塩基対形成能のNMRによる研究

研究課題

研究課題/領域番号 05780473
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 生物物理学
研究機関横浜国立大学

研究代表者

片平 正人  横浜国立大学, 工学部・物質工学科, 専任講師 (70211844)

研究期間 (年度) 1993 – 1994
研究課題ステータス 完了 (1994年度)
配分額 *注記
900千円 (直接経費: 900千円)
1993年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードリボザイム / NMR / 構造 / 塩基対 / 活性 / DNA / ラマン
研究概要

ハンマーヘッド型リボザイム及び新型リボザイムである鉛リボザイムの塩基配列にもとずいたモデルDNA、RNAを作成し、その立体構造、特に非標準型塩基対A:G塩基対が形成されているのかどうかを、NMRを用いて明らかにした。
A:G塩基対は標準型塩基対ではないにもかかわらず、研究した4種のモデルDNA及びRNAのいずれにおいても塩基対の形成が見い出された。さらに塩基対の様式は、塩基配列に依存して、異なったものになる事がわかった。
モデルRNAで見出されたA:G塩基対の構造は、塩基の横に塩基が配置されるside by side型という、非常にきわだったものである事がわかった。この特徴的な構造が、新型リボザイム・鉛リボザイムにおける切断反応のメカニズムと密接に結びついている可能性が示唆された。
さらに新型リボザイムそのものの構造研究より、同様なA:G塩基対形成が強く示唆された。

報告書

(1件)
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (3件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (3件)

  • [文献書誌] Masato Katahira: "NMR studies of G:A mismatches in oligodeoxynucleotide duplexes modeled after ribozymes" Nucleic Acids Research. 21. 5418-5424 (1993)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Masato Katahira: "A Raman spectroscopic study on conformations of DNA oligomers" Nucleosides and Nucleotides. (印刷中). (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Masato Katahira: "Drastic difference in G:A base pairing between two consecutive G:A mismatches and a single G:A mismatch in DNA" Nucleosides and Nucleotides. (印刷中). (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1993-04-01   更新日: 2018-06-07  

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