• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

DNAの関与する超分子形成と機能

研究課題

研究課題/領域番号 06240104
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関京都大学

研究代表者

杉浦 幸雄  京都大学, 化学研究所, 教授 (40025698)

研究分担者 石田 寿昌  大阪薬科大学, 薬学部, 教授 (00111021)
高橋 孝志  東京工業大学, 工学部, 教授 (80110724)
平間 正博  東北大学, 理学部, 教授 (30165203)
研究期間 (年度) 1994 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
61,600千円 (直接経費: 61,600千円)
1996年度: 20,600千円 (直接経費: 20,600千円)
1995年度: 21,000千円 (直接経費: 21,000千円)
1994年度: 20,000千円 (直接経費: 20,000千円)
キーワード超分子 / DNA / エンジイン / クロモプロテイン / 2本鎖切断 / 作用発現 / 分子設計 / モデリング / 多重相互作用
研究概要

本研究では天然活性分子として構造と活性の両面から注目を浴びているエンジイン型抗癌抗生物質に焦点を当て、何故このような化合物が強い生物活性を示すのかを分子レベルで明らかにすることを目指している。今年度は、特に新規エンジイン型クロモホア-を含む抗癌抗生物質C-1027の活性発現の分子機序を解明するため、オリゴヌクレオチドb(GTATAC)_2とC-1027クロモホア-との相互作用を高分解能NMRスペクトルによって詳細に検討し、本エンジイン型クロモホア-のDNA複合体とその塩基配列認識において、エンジイン核と共にベンゾキサゾリン芳香環のインターカレーションとアミノ糖鎖部の静電的相互作用が重大に関与していることを始めて明らかにした。さらに、NMRスペクトルデータを基礎に分子動力学計算を行い、C-1027エンジイン型クロモホア-によるDNA結合様式を詳細に解析・考察した。他方、エスペラミン、ダイナミシン、ネオカルチノスタチン、C-1027などによるDNA切断反応を各種オリゴヌクレオチドを用いて検討し、エンジイン化合物に共通の二本鎖同時切断や特有の塩基配列特異性を見い出した。さらに、これらの知見を生かして、C-1027やケダルシジンのエンジイン型クロモホア-類似の人工エンジイン化合物を設計・合成し、期待通り高いDNA切断活性を示すことを明らかにした。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書
  • 1995 実績報告書
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (13件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (13件)

  • [文献書誌] Y.Okuno: "Interaction of C-1027 chromophore with d(GTATAC)_2 : A binding model based on NMR experiments" J.Am.Chem.Soc.118・19. 4729-4730 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] E.Nakamura: "Biological activity of water-soluble fullerenes" Bull.Chem.Soc.Jpn.69・8. 2143-2151 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] L.L.Guan: "Specific interaction with guanine residues of z-form DNA by bleomycin-nickel(III) complex" Biochim.Biophys.Acta. 1308・2. 169-176 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Morii: "Cooperative oligomerization enhances sequence-selective DNA bindig by a short peptide" J.Am.Chem.Soc.118・42. 10011-10017 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Takahashi: "DNA cleavage by a nine-membered masked enediyne an analogue of the kedarcidin and C-1027 chromophores" Angew.Chem.Int.Ed.Engl.35・16. 1835-1837 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] M.Uesugi: "Hydrophobic DNA binding of esperamicin requires conformational distortion of the host DNA" Biochim.Biophys.Acta. 1261. 99-106 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] K.Iida: "Synthesis and characterization of nine-membered cyclic enediynes,models of C-1027 and kedarcidin chromophore" J.Am.Chem.Soc.117. 8875-8876 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] T.Takahashi: "Synthesis of dynamicin A analogue and its Bergman-type cycloaromatization" Angew.Chem.Int.Ed.Engl.34. 1345-1348 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Okuno: "Computer modeling analysis for enediyne chromophore-apoprotein complex of chromoprotein C-1027" J.Med.Chem. 37. 2266-2267 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] M.Nagaoka: "A novel zinc finge-based DNA cutter:Biosynthetic design and highly selective DNA cleavage" J.Am.Chem.Soc.116. 4085-4086 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] T.Matsumoto: "Alteration of binding mode and cutting site by G→I replacement in 5'AGG of Chromoprotein C-1027" Biochem.Biophys.Res.Commun.205. 1533-1538 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] K.Iida: "Efficient route to the 9-membered cyclic diyne system" J.Am.Chem.Soc.116. 10310-10311 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] S.Kawata: "Ten-membered neocarzinostatin chromophore analogs leading to α,α-biradical via a cumulene intermediate" Tetrahedron Lett.35. 4595-4598 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

URL: 

公開日: 1994-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi