分子進化学の新展開の推進

• 研究課題/領域番号: 06273101
• 研究種目: 重点領域研究
• 配分区分: 補助金
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 宮田 隆 京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (20022692)
• 研究分担者: 岡田 典弘 東京工業大学, 生命理工学部, 教授 (60132982) ; 宝来 聡 (宝来 聰) 国立遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 助教授 (40126157) ; 掘 寛 名古屋大学, 大学院理学研究科, 教授 (60116663) ; 長谷川 政美 統計数理研究所, 予測制御研究系, 教授 (60011657) ; 五條掘 孝 (五條堀 孝) 国立遺伝学研究所, 生命情報研究センター, 教授 (50162136) ; 石和 貞男 お茶の水女子大学, 理学部, 教授 (20017205) ; 植田 信太郎 東京大学, 大学院・理学系研究科, 助教授 (20143357) ; 高畑 尚之 総合研究大学院大学, 教育研究交流センター, 教授 (30124217)
• 研究期間 (年度): 1994 – 1997
• 研究課題ステータス: 完了 (1997年度)
• 配分額: 103,400千円 (直接経費: 103,400千円); 1997年度: 2,900千円 (直接経費: 2,900千円); 1996年度: 10,500千円 (直接経費: 10,500千円); 1995年度: 13,500千円 (直接経費: 13,500千円); 1994年度: 76,500千円 (直接経費: 76,500千円)
• キーワード: 分子進化 / 形態進化 / 多様性 / 系統樹 / 絶滅生物のDNA / 真核生物の起源 / ウィルスの進化 / ウイルスの進化 / 遺伝子族 / 遺伝子多様化 / 化石DNA / 眼の進化 / 古細菌 / 分子系統進化学 / 絶滅動物DNA / オルガネラDNA / ウイルス系統進化 / 分子系統樹推定法

研究概要

本重点研究では、形態進化と分子進化の接点、過去に生存した生物のDNA単離と系統進化、太古の生物の進化と真核生物の起源、及びその他の領域研究として、ウィルスの分子進化学的アプローチの確立、並びに分子系統樹推定法と種々の遺伝子解析法の開発・改良、の4つの項目を重点的に研究する組織を組み、分子進化学の新しい展開を試みた。本年度は締めくくりの年であり、過去4年間の研究活動の総括と将来への展望を期して、「生物の多様性と進化」と題する公開シンポジウムを平成10年1月10日-11日の2日間、東京で開催した。分子進化学を中心に形態レベルの進化も含め、16人による講演を行い、多数の参加者と活発な討論に終始した、極めて意義深いシンポジウムであった。本重点研究は、絶滅した生物からのDNAの単離に関しては、一部問題の困難さのため、十分な成果は得られなかったが、全体としては予想以上の成果を上げることができた。加えて、本重点研究メンバーが中核となって、進化学会を来年度発足させることを決議した。現在、その準備を進めているが、これは本重点研究の大きな成果の一つであろう。また、複数の班員による分子進化学の平易な解説書を出版し、成果の公表と普及に努めた。本重点領域研究を通じて、これまでの分子進化学の枠が大きく拡大し、新しい大きな研究グループが出来たこと、形態進化と分子進化の接点という大きな共通のテーマでまとまることが出来たことは、新しい分子進化学の発展の上で有意義であった。

研究成果

• [文献書誌] Nikoh N.et al.: "An estimate of divergence time of Parazoa and Eumetazoa and that of Cephalochordata and Vertebrata by aldolase and triose phosphate isomerase clocks." J.Mol.Evol.45(1). 97-106 (1997)
• [文献書誌] Yamaguchi Y.et al.: "Evolutionary mechanisms and population dynamics of the third variable envelope region of HIV within single hosts." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94(4). 1264-1269 (1997)
• [文献書誌] Hasegawa M.et al.: "Novel Phylogeny of Whales Supported by Total Molecular Evidence." J.Mol.Evol.44(7). 117-120 (1997)
• [文献書誌] Hammer MF.et al.: "The geographic distribution of human Y chromosome variation." Genetics. 145(3). (787-805)
• [文献書誌] Shimamura M.et al.: "Molecular evidence from retroposons that whales from a clade within even-toed ungulates." Nature. 388(6643). 666-670 (1997)
• [文献書誌] Imai H.et al.: "Single amino acid residue as a functional determinant of rod and cone visual pigments." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94(6). 2322-2326. (1997)
• [文献書誌] 宮田 隆: "ゲノム情報を読む" 共立出版, 138 (1997)
• [文献書誌] Iwabe,N.et al.: "Evolution of gene families and relationship with organismal evolution." Mol.Biol.Evol.13. 483-493 (1996)
• [文献書誌] Nikoh,N.et al.: "An estimate of divergence time of Parazoa and Eumetazoa and that of Cephalochordata and Vertebrata by aldolase and triose phosphate isomerase clocks." J.Mol.Evol.(in press) (1997)
• [文献書誌] Kamaishi,T.et al.: "Protein phylogeny of EF-lalpha suggests microsporidians are extremely ancient eukaryotes." J.Mol.Evol.42. 257-263 (1996)
• [文献書誌] Horai,S.et al.: "mtDNA polymorphism in East Asian populations, with special reference to the peopling of Japan." Am.J.Hum.Genet.59. 579-590 (1996)
• [文献書誌] Sumiyama,K.et al.: "Class III POU genes : generation of homopolymeric amino aced repeats under GC pressure in mammals." J.Mol.Evol.43. 170-178 (1996)
• [文献書誌] Endo,T.et al.: "Large-scale search for genes on which positive selection may operate." Mol.Biol.Evol.13. 685-690 (1996)
• [文献書誌] 宮田隆: "眼が語る生物の進化" 岩波書店, 119 (1996)
• [文献書誌] 長谷川政美: "分子系統学" 岩波書店, 257 (1996)
• [文献書誌] Iwabe,N.: "Evolution of gene families and relationship with organismal evolution:Rapid divergence of tissue-specific genes in the early evolution of chordates." Mol.Biol.Evol.13(in press). (1996)
• [文献書誌] Yokoyama,N.: "A giant nucleopore protein which binds Ran/TC4." Nature. 376. 184-188 (1995)
• [文献書誌] Fumihito,A.: "Monophyletic origin and unique dispersal patterns of domestic fowls." Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.93(in press). (1996)
• [文献書誌] Horai,S.: "Recent African origin of modern humans revealed by complete sequences of hominoid mitochondrial DNAs." Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.92. 532-536 (1995)
• [文献書誌] Oota,H.: "A genetic study of 2,000-year-old human remains of Japan (Y ayoi period) using mitochondrial DNA sequences." Amer.J.Phys.Anthropol.98. 133-145 (1995)
• [文献書誌] Kamaishi,T.: "Protein phylogeny of EF-1α suggests microsporidians are extremely ancient eukaryotes." J.Mol.Evol.42(in press). (1996)
• [文献書誌] 宮田隆: "眼が語る生物の進化" 岩波書店(印刷中), (1996)
• [文献書誌] 長谷川政美: "分子系統学" 岩波書店(印刷中), (1996)
• [文献書誌] Miyata,T.: "A possible link between molecular evolution and tissue evolution demonstrated by tissue specific genes." Jpn.J.Genet.69. 473-480 (1994)
• [文献書誌] Kuma,K.: "Functional constrains against variations on molecules from tissue level:Slowly evolving brain specific genes demonstrated by protein kinase and immunoglobulin supergene families." Mol.Biol.Evol.12. 123-130 (1995)
• [文献書誌] Hasegawa,M.: "Accuracies of the simple methods for estimating the bootstrap probability of a maximum likelihood tree." Mol.Biol.Evol.11. 142-145 (1994)
• [文献書誌] Ina,Y.: "Reduction of synonymous substitutions in the core protein gene of hepatic C virus." J.Mol.Evol.38. 50-56 (1994)
• [文献書誌] Saitou,N.: "Evolutionary rete of insertions and deletions in non-coding nucleotide sequences of primates." Mol.Biol.Evol.11. 504-512 (1994)
• [文献書誌] Horai,S.: "Recent african origin of modern humans revealed by complete sequences of hominoid mitochondrial DNAs." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 92. 532-536 (1995)
• [文献書誌] 宮田隆: "分子進化学への招待" 講談社, 280 (1994)
• [文献書誌] 宮田隆: "中立説と分子進化" SUT Bulletin,東京理科大学(印刷中), (1995)