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DNAプローブ集積チップによる塩基配列の高速探査

研究課題

研究課題/領域番号 06452442
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 生物物理学
研究機関東京大学

研究代表者

陶山 明  東京大学, 教養学部, 助教授 (90163063)

研究期間 (年度) 1994 – 1995
研究課題ステータス 完了 (1995年度)
配分額 *注記
6,900千円 (直接経費: 6,900千円)
1995年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1994年度: 5,800千円 (直接経費: 5,800千円)
キーワードDNAプローブ / バイオ素子 / 塩基配列 / ハイブリタイゼーション / ハイブリダイゼーション
研究概要

DNAプローブ集積チップは、多種類のDNAオリゴヌクレオチドを微小なドット・マトリックスとして基板上に末端固定したものである。このチップは、ゲノムマッピングにおけるクローンの整列、SBH、遺伝子診断、遺伝子発現パターンの計測などにおいて非常に有用な道具と考えられている。本研究では、あらかじめ合成して精製したDNAオリゴヌクレオチドを、フォトリソグラフィを利用して所定の位置に末端で共有結合固定することことによりDNAプローブ集積チップを製作する方法の開発を試みた。あらかじめ合成して精製したDNAオリゴヌクレオチドを末端固定する方法であるため、塩基配列探査の精度をあげるために必要な長さをもつDNAオリゴヌクレオチドを基板上に集積化することができる。また、cDNAのPCR産物などを微小なドット・マトリックスとして基板上に固定して集積化することも可能である。平成6 年度は、DNAオリゴヌクレオチドを光照射により末端共有結合固定する化学反応系の基本的部分を開発するとともに、フォトリソグラフィによチップを作製するための装置を落射蛍光顕微鏡を基にして製作した。平成7年度はこれらの成果をもとに、ドットの大きさが400μm程度の簡単なDNAプローブ集積チップを製作し、ターゲットのDNAオリゴヌクレオチドとのハイブリダイゼーションにより塩基配列の識別が出来ることを確認した。

報告書

(3件)
  • 1995 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (11件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (11件)

  • [文献書誌] Morimoto,N.and Suyama,A.: "Rapid oligonucleotide hybridization on microfiltration plates." Nucleic Acids Symposium Series. No.31. 119-120 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suyama,A.: "DNA sequencing by oligonucleotide hybridization." Gendai Kagaku. No.274. 8-9 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suyama,A.: "DNA Chips-Integrated Chemical Circuits for DNA Diagnosis and DNA Computers." (to be submitted).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohno,H., Sugiyama,T., Suyama,A.: "Photolithographic integration of presynthesized DNA oligonucleotides on a glass plate." (to be submitted.).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Morimoto, N.and Suyama, A.: "Rapid oligonucleotide hybridization on microfiltration plates." Nucleic Acids Symposium Series. No.31. 119-120 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suyama, A.: "DNA sequencing by oligonucleotide hybridization." Gendai Kagaku. No.274. 8-9 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suyama, A.: "DNA Chips-Integrated Chemical Circuits for DNA Diagnosis and DNA Computers." (to be submitted).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ohno, H., Sugiyama, T.and Suyama, A.: "Photolithographic Integration of presynthesized DNA oligonucleotides on a glass plate using photolithography." (to be submitted).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Morimoto,N.& Suyama,A.: "Rapid oligonucleotide hybridization on microfiltration pla" Nucleic Acids Symposium Series. 31. 119-120 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 陶山明: "オリゴヌクレオチドとのハイブリッド形成によるDNA塩基配列決定" 現代化学. 274. 8-9 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Suyama,A.& Matsuura,M.: "Light-directed terminal immobilization of DNA probes on sol surfaces." DNA Research. (投稿予定).

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1994-04-01   更新日: 2016-04-21  

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