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DNA塩基配列に基づく有孔虫殻形態の評価

研究課題

研究課題/領域番号 06454002
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 層位・古生物学
研究機関静岡大学

研究代表者

北里 洋  静岡大学, 理学部, 教授 (00115445)

研究分担者 吉永 光一  静岡大学, 理学部, 教授 (70021954)
千葉 聡  静岡大学, 理学部, 助手 (10236812)
研究期間 (年度) 1994 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
8,100千円 (直接経費: 8,100千円)
1996年度: 1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
1995年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
1994年度: 4,500千円 (直接経費: 4,500千円)
キーワード底生有孔虫類 / 形態進化 / 分子進化 / 形態解析 / 分子生物学 / DNA / 塩基配列 / PCR法
研究概要

本研究は、DNAの塩基配列に基づいて底生有孔虫の殻形態が持つ意味を分子生物学的見地から評価することを目的とする。研究は、有孔虫の殻の形態的な特徴と、その形態変更の実態を理解することと、DNA解析を行うことの2方向から解析を進めた。化石記録が豊富な有孔虫類の中から,形態解析を詳細に行ったGlabratella属とBolivina属のDNA解析を行った。有孔虫からのDNA抽出およびPCR法による増幅はPawlowske et al. (1995)の方法に従い,核のribosomal DNAのlarge subunitの約650塩基の増幅を行った。プライマーは,有孔虫に対して特有に働くspecific primerを用いたところ,極めて効率よく有孔虫のDNA断片を得ることが出来,かなり小さい個体からもDNAの抽出が可能になった。増幅したDNA断片はプラスミドベクターに導入してクローニングした後,シークエンサーを用いてシークエンシングを行った。
DNA解析を行った属グループ内の遺伝的変異は,固生群内での遺伝子の交流が頻繁に起こるような粗放的な生殖様式を持つAmmoniaやBolivina属は大きく,細胞質融合をして生殖を行うために遺伝子の交流が少ないGlabratella属は小さかった。塩基配列から節約法あるいはNJ法を用いて計算して求めた分子系統樹は,従来の形態分類とは異なる系統関係を描き出した。しかし,仮足の伸展を支持する機能を持つ口孔の周りのradial grooveなどのように機能的な意味を持った形態に注目して再分類を行うと,その結果は分子系統樹と整合的になった。一方、Glabratella opercularisの地域個体群の中には,従来の形態分類では区別できないが,遺伝的には種を越えた変異を個体群が存在する。以上の結果から,有孔虫の形質を機能形態的な側面に注目して見直すことによって,分子系統学の結果と整合的な形態分類ができるようになると結論する。

報告書

(4件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (22件)

  • [文献書誌] Pawlouski,J.,Bolivar,I., Fahrni.J.,ZanineH :, L and Kitazato,H.: "Partial LSU rDNA sequences of Trochammina spp. (Foraminiferida)" Proc. 4th IWAF,Cracor Pol and Grzybouski Fowdatin Special Publication22GD01:no.3. 227-232 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hemleben C. and H.Kitazato: "Deep Sex foraminifera under long time observation in the loboratory" Deep-Sea Research. V.42. 827-832 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato,H.: "Recolonization by deep-Sea benthic forminifera possikle substrate preterences" Marine Micropaleontology. 26. 65-74 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato,H. and Y. Shirayama: "Rapid creation of a vednced environment and an eavly stage of chemosynthetic community on coffle bores ot the deep sea bottom in Sagami Boy,nirol Japan." Vie et Milien. V.46. 1-5 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato,H. and S. Matsushita: "Laboratory observations of sexnal and asexual reproduction of Trochammira hadar Vclio" Trans. Proc. Palaeontol. Soc. Japan. no 182. 454-466 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sunouchi,M.,F. Sasaki S. Chiba and M.Kawata: "Morphological change and phylogemetic relationships in Tadpole shrimps (Triops)" Biol. Jour. Linnean Soc.(印刷中). (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Pawlowski, J., I.Boliver, J.Fahrni, L.Zaninetti and H.Kitazato: "Partial LSU rDNA sequences of Trochammina spp. (Foraminiferida)." Proc.4th IWAF,Cracow, Poland, Grzybowski Found.Spec.Pub.no.3. 227-232 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato, H.and Ohga, T.: "Seasonal changes in deep-sea benthic foraminiferal population : Results from long term observations at Sagami Bay, Japan." in Sakai, H.and Y.Nozaki, (eds.), Biogeographical Processes and Ocean Flux in the Western Pacific. Terra Scientific Pub., Tokyo. 331-342 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hemleben, Ch. and H.Kitazato: "Deep sea foraminifera under long time observation in the laboratory." Deep-sea Res.v.42. 827-832 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato, H.: "Recolonization by deep-sea benthic foraminifera : possible substrate preferences." Marine Micropaleont. v.26. 65-74 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato, H.and Y.Shirayama: "Rapid creation of a reduced environment and an early stage of chemosynthetic community on cattle bones at the deep-sea bottom in Sagami Bay, Central Japan--An experimental approach to test the stepping stone hypothesis for chemosynthetic community dispersion-." Vie et Milieu. v.46. 1-5 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato, H.and S.Matsushita: "Laboratory observations of sexual and asexual reproduction of Trochammina hadai Uchino." Trans.Proc.Palaeontol.Soc.Japan.N.S.no.182. 454-466 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato, H.: "Benthic foraminifera associated with cold seepages : Discussion of their faunal characteristics and adaptations." FOSSILS. no.60. 48-52 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Toyofuku, T., H.Kitazato and H.Kawahata: "Experimental evaluation of the use of Mg/Ca and Sr/Ca ratios of benthic foraminiferal tests as sea water temperature proxies." Proc.Techno-Ocean '96. vol.II. 561-566 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sunouchi, M., F.Sasaki, S.Chiba and M.Kawata: "Morphological change and phylogenetic relationships in Tadpole shrimps (Triops)." Biol. Jour., Linnean Soc. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kitazato,H and S.Matsushita: "Laboratory observations of sexual and asexual reproduction of Trochammina hadai Vchio" Trans.Proc.Palaeontol.Soc.Japan,N.S.no 182. 454-466 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 北里 洋: "冷湧水に伴う底生有孔虫-特徴と適応機構についての考察" 化石. no.60. 48-52 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 豊福高志、北里 洋、川幡穂高: "海水温指標としての底生有孔虫殻Mg/Ca比、Sr/Ca比の実験的評価" テクノオーシャン'96 論文集. II. 561-566 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Sunouchi,M,F.Sasaki,S.Chiba and M.Kawata: "Morphelogical change and phylogenetic relationships in Tadpole shrimps (Triops)" Biol.Jour.,Linnean Soc.(印刷中). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Pawlowski,J. et al.,: "Partial LSU rDNA sequences of Trochammina spp. (Foraminifevida)" Proc. 4th Int. Workshop Agglutinated Foraminifera. 227-232 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kitazato,H. and Shirayama,Y.: "Rapid creation of a veduced enriromnent and an early stages of a chemosynthefic community on a cattle bones of the deep‐sea botton in Sagami Bag, Central Japan" Vie et Milien. (印刷中).

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Pawlowski,J.et al.: "Taxonomic vevision of Glabratella spp,based on the sequence of LSU rDNA Diver gont domain D7" Journal of Foraminiferal Research. (発表予定).

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1994-04-01   更新日: 2016-04-21  

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