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細菌細胞壁構成D-アミノ酸合成関連酵素の構造、機能の解析と特異的阻害剤の開発

研究課題

研究課題/領域番号 06454077
研究種目

一般研究(B)

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関京都大学

研究代表者

左右田 健次  京都大学, 化学研究所, 教授 (30027023)

研究分担者 栗原 達夫  京都大学, 化学研究所, 助手 (70243087)
江崎 信芳  京都大学, 化学研究所, 助教授 (50135597)
吉村 徹  京都大学, 化学研究所, 助手 (70182821)
研究期間 (年度) 1994 – 1995
研究課題ステータス 完了 (1995年度)
配分額 *注記
7,900千円 (直接経費: 7,900千円)
1995年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
1994年度: 5,500千円 (直接経費: 5,500千円)
キーワードペプチドグリカン / アラニンラセマーゼ / D-アミノ酸アミノトランスフェアーゼ / グルタミン酸ラセマーゼ / D-アミノ酸 / 酵素自殺基質 / UDP-N-アセチルムラミル-L-アラニン / ピリドキサルリン酸 / D-アミノ酸トランスアミナーゼ / セリンO-スルフェート / 酵素阻害剤
研究概要

細菌細胞壁には、高等動物には存在しない種々のD-アミノ酸が必須成分として含まれる。これらD-アミノ酸の生合成に関与する微生物酵素の特異的阻害剤は、選択性の高い新規抗生物質への応用が可能である。本研究では、これら酵素の構造と触媒機構の関連を明らかにし、これに立脚した特異的阻害剤を開発することを目的としている。このような酵素の一つであるグルタミン酸ラセマーゼは、ペプチドグリカンの構成成分であるD-グルタミン酸生合成に関与する。本研究では、E.coli由来の同酵素がペプチドグリカン生合成の中間体であるUDP-N-アセチルムラミル-L-アラニンにより活性化される現象について検討し、酵素タンパク質がこの活性化因子により構造変化を起こすこと、またこの活性化には酵素のN-末端領域が関与することを明らかにした。また、Bacillus pumlisの同酵素遺伝子をクローニングし、その発現が転写レベルでの調節を受けることを見い出した。また同じくペプチドグリカンの構成成分であるD-アラニンを供給するアラニンラセマーゼについて、X線結晶解析の結果から補酵素の両面に空隙が存在することを明らかにし、同酵素が他のピリドキサル酵素とは異なり、補酵素の両面で水素転移反応を触媒することを裏付けた。さらに、活性中心リジン残基をアラニン残基に転換した変異型酵素に対する1級アミンと2級アミンの活性化効果の違いから、アラニンラセマーゼ反応にはアルジミン転移の過程が必須であることを明らかにした。

報告書

(3件)
  • 1995 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (18件)

  • [文献書誌] Choi. Soo-Young: "Bacterial Glutamate Racemase has High Sequence Homology with Myoglobins and Forms an Equimolar Inactive Complex with Hemin." Proc. Natl. Acad Sci., USA,. 91. 10144-10147 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishimura Katsushi: "A Simple Method for Detemination of Stereospecificity of Aminotransferase for C-4′Hydrogen Transfer of the Coenzyme." Bioorganic & Medical Chemistry. 2. 605-607 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Toyama Hirohide: "Reconstitute of Fragmentary Form of Themostable Alanine Racemase" Biosci. Biotech. Biochem.59. 1118-1120 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kishimoto Kazuhisa: "Role of Leucine 201 of Thermostable D-Amino Acid Aminotransferase from Thermophile, Bacillus sp. YM-1" J. Biochem.117. 691-696 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ashiuchi Makoto: "In Vivo Effect of GroESL on the Folding of Gltamate Racemase of Eschirichia coli." J. Biochem.117. 495-498 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimura Tohru: "Alanine Racemase-Structure and Function" KODANSHA, 244 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Choi, Soo-Young: "Bacterial Glutamate Racemase has High Sequence Homology with Myoglobins and Forms an Equimolar Inactive Complex with Hemin." Proc.Natl.Acad.Sci., USA. 91. 10144-10147 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nishimura, Katsushi: "A Simple Method for Determination of Stereospecificity of Aminotransferase for C-4'Hydrogen Transfer of the Coenzyme." Bioorganic & Medical Chemistry. 2. 605-607 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimura Tohru: "Alanine Racemase - Structure and Function" (T.Fukui ed.) KODANSHA. 147-163 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Toyama Hirohide: "Reconstitute of Fragmentary Form of Thermostable Alanine Racemase" Biosci.Biotech.Biochem.59. 1118-1120 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kishimoto Kazuhisa: "Role of Leucine 201 of Thermostable D-Amino Acid Aminotransferase from Thermophile, Bacillus sp.YM-1" J.Biochem.117. 691-696 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ashiuchi Makoto: "In Vivo Effect of GroESL on the Folding of Glutamate Racemase of Eschirichia coli." J.Biochem.117. 495-498 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Toyama et al.: "Reconstitute of Fragmentary Form of Thermostable Alanine Racemase" Biosci. Biotech. Biochem.59. 1118-1120 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] M. Ashiuchi, M et al.: "In Vivo Effect of GroESL on the Folding of Glutamate Racemase of Eschirichia coli" J. Biochem.117. 495-498 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] W.M.Jones et al.: "Determination of Free D-Amino Acids with a Bacterial Transaminase:Their Depletion Leads to Inhibition,of Bacterial Growth" Anal.Biochem.218. 204-209 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kishimoto et al.: "Role of Leucine 201 of Thermostable D-Amino Acid Aminotrasferase from a Thermophile." J.Biochem.(印刷中). (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] H.Toyama et al.: "Reconstitution of Fragmentary Form of Thermostable Alanine Racemase" Biosci.Biotech.Biochem.

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] S.Sawada et al.: "Kinetics of Thermostable Alanine Racemase of bacillus stearothermophilus" Biosci.Biotech.Biochem.

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1994-04-01   更新日: 2016-04-21  

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