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シングルローカスVNTRマーカーによる黒毛和種の育種改良

研究課題

研究課題/領域番号 06454116
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用動物科学
研究機関神戸大学

研究代表者

辻 荘一 (辻 壮一)  神戸大学, 農学部, 教授 (10031220)

研究分担者 万年 英之  神戸大学, 農学部, 助手 (20263395)
向井 文雄 (向井 文男)  神戸大学, 農学部, 助教授 (50093323)
研究期間 (年度) 1994 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
6,600千円 (直接経費: 6,600千円)
1996年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
1995年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
1994年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
キーワード黒毛和種 / VNTR遺伝子座 / マーカー遺伝子 / 反復配列 / クローニング
研究概要

我々は黒毛和種の有効利用を図るため,肉質の優れている但馬牛の集団を対象に,種々の集団遺伝学的分析を加えてきた。その分析にDNA多型マーカーを取り込む事は今後の育種にとって不可欠である。そこで、本研究では黒毛和種を対象として,ミニサテライトやミクロサテライト遺伝子座等のシングルローカスVNTRマーカー遺伝子座のクローニングを行い,形質選抜のDNAマーカーの検索を行った。マーカーと形質との連鎖が明らかになれば、連鎖関係を利用して優良形質の選抜や形質を支配する遺伝子座を究明出来る。平成6年から平成8年の3年度にわたりミニサテライトとマイクロサテライト遺伝子座のクローニングを行った。ミニサテライトのクローニングではウシゲノムライブラリーからポジティブ・クローンを得た。その内、数個の多型性の高い遺伝子座に注目して、PCR分析が可能なプライマーを設計中である。一方、マイクロサテライトのクローニングでは黒毛和種のゲノムライブラリーから(GT)nの反復配列を持つのポジティブ・クローンが多数得られた。しかしながら、そのPCR産物の分析は技術的に困難を伴うため、3塩基以上の反復配列のクローニングを試みた。(GGAT)nの4塩基の反復配列では20個のクローンの塩基配列を決めた。その結果、それらは(GGAT)nの配列を含んではいるものの、完全な反復配列は発見されず、また、それらの遺伝子座における多型は顕著ではなかった。そこで、3塩基反復配列の(GTG)nを新たに分析対象に加えてクローニングを行った。その結果(GTG)nに関しては1個ではあるが極めて有望な遺伝子座がクローニングされた。その遺伝子座での多型性は平均ヘテロ接合度が87%に達し、しかも、その多型がアガロース・ゲル電気泳動で簡易に識別できるなどの特徴を備えていた。以上、本研究の結果、PCR法とアガロース・ゲル電気泳動で識別できる多型性の高い遺伝子座が数個発見された。それらについては、近々、学術誌に報告する予定である。

報告書

(4件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (19件)

  • [文献書誌] 薫仕ら: "DNAフィンガープリントとアイソザイムパターンによるギンブナクローンの識別" 日本水産学会誌. 62. 747-753 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 費莎ら: "PCR法による食肉・肉製品の肉種鑑別" 日本畜産学会報. 67. 901-905 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Fumio Mukai et. al.: "A comparison of actual and estimated selection responces from selectic indices for desired gains in layer chicken lines" Animal Science and Technology. 67. 941-948 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Danbaro Gariba et. al.,: "Estimation of genetic parameters by restricted maximum likelihood under multi-trait analysis in selected layer lines" Japanese Poultry Science. 33. 185-192 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Toshiki Sudo et. al.: "Identification and minisatellite linkage analysis of SMXA recombinant inbred strains of mice by DNA fingerprinting" Experimental Animals. 44. 87-93 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 辻 荘一: "アニマル・ジェネテイクス(動物の免疫・分子遺伝学)" 岡田育穂 編著 養賢堂, 329 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 董仕ら: "DNAフィンガープリントとアンソザイムパターンによるギンブナクローンの識別" 日本水産学会誌. 62. 747-753 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 費莎ら: "PCR法による食肉・肉製品の肉腫鑑別" 日本畜産学会報. 67. 901-905 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Fumio Mukai et.al.: "A comparison of actual and estimated selection responces from selection indices for desired gains in layer chicken lines" Animal Science and Technology. 67. 941-948 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Danbaro Gariba et.al.: "Estimation of genetic parameters by restricted maximum likelihood under multi-trait analysis in selected layer lines" Japanese Poultry Science. 33. 185-192 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Toshiki Sudo et.al.: "Identification and minisatellite linkage analysis of SMXA recombinant inbred strains of mice by DNA fingerprinting" Experimental Animals. 44. 87-93 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Danbaro Gariba et.al.: "Heritabilities and genetic correlations from a selection experiment in broiler breeders using restricted maximum likelyhood." Japanese Poultry Science. 32. 257-266 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Toshiki Sudo et. al.: "Identification and minisatellite linkage analysis of SMXA recombinant inbred strains of mice by DNA fingerprinting" Experimental Animals. 44. 87-93 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Danbaro Gariba et al.,: "Heritbilities and genetic correlations from a selection experiment in broiler breeders using restricted maximum likelyhood." Japanese Poultry Science. 32. 257-266 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Danbaro Gariba et al.,: "Genetic trands from a selection experiment in broiler breeder lines using best linear unbiased prediction methodology." Japanese Poultry Science. 32. 379-386 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 辻荘一: "家畜のジーンマッピングに関する最近の研究動向" 日本畜産学会報. 66. 1047-1057 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 辻荘一: "DNAフィンガープリントとその利用" Techno Innovation. 5. 21-26 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Tsuji,S.,: "Evolutionary relationships of lactate dehydrogenase(LDHs)from mammals,birds,amphibian,fish,barley,and bacteria:LDH cDNA sequences from" Proc.Natl.Acad.Sci.,USA. 91. 9392-9396 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Mannen,H.,: "Identification of sublines of inbred strains of mice and assessment of genetic relationships between sublines or substrains." Experimental Animals. 43. 521-526 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1994-04-01   更新日: 2016-04-21  

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