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FISHによるMHC遺伝子領域の複製パターンの描出

研究課題

研究課題/領域番号 06660099
研究種目

一般研究(C)

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関三重大学

研究代表者

奥村 克純  三重大学, 生物資源学部, 助教授 (30177183)

研究期間 (年度) 1994 – 1995
研究課題ステータス 完了 (1995年度)
配分額 *注記
400千円 (直接経費: 400千円)
1995年度: 400千円 (直接経費: 400千円)
キーワードFISH / MHC / DNA replication / Chromosoirc Structure / GC content / Chromosome structure
研究概要

ヒトMHC領域の複製タイミングを2Mb以上にわたって詳細に解析し、DNAの複製のパターンを明らかにした。その結果、MHC領域のDNA複製はClassIIとClassIIIの間にこの領域内で最も遅く複製する領域が存在し、この領域を境にして少なくとも2つのレプリコンクラスターを形成していると推定された。また、プロモデオキシウリジン(BrdU)を取り込ませた細胞からExtended Chromatin Fiber(ECF)調製し、マルチカラーFISHを行ったところ、早く複製するでDNAセグメントはBrdUが検出されるFiber上に多く検出される一方、ClassIIとClassIIIの境界付近のDNAクローンはBrdUき検出されないFiber上に検出されることから、FISHによって決定したこの領域の複製タイミング過程を検証できた。さらに、立体構造を保持した細胞核についてこの領域が少なくとも2つのレプリコンクラスターから形成されることを示すための実験を進めている。
一方、画像解析FISH法の組み合わせによって、一個の細胞核のS期の中でのステージと複製タイミングの決定法を開発した。すなわち、RNase処理した細胞核標本について調べたいクローンを用いてFISHを行い、propidium iodide(PI)染色を行い,その蛍光イメージを低倍率でCCDカメラを通してデジタル信号に変換しコンピュータに取り込む一方、個々の核のFISHシグナルのパターンを高倍率で調べる。画像解析により、PI染色による蛍光量から個々の核のDNA量を算出し、S期のどの位置にある核かを決定する。一方でDNAのFISHシグナルのパターンから調べたいクローンの複製タイミングを決定できる。これは、核内ゲノムの動態に関する研究を行う基礎的技術を提供した。さらに、ゲノム解析の基礎である各種遺伝子のマッピング等を行った。

報告書

(3件)
  • 1995 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (28件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (28件)

  • [文献書誌] Kaisuzumi Okumura: "The Genes for the α-Type HC3 (PSMA2) and β-Type HC5 (PSMBI) Subunits of Human Proteasomes Map to Chromosomes 6q27 and 7p12-p13 by Fluorescence inSitu Hybridization."

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Genomics. 27. 377-379 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Shiratori: "Assignmnt of the 49-kDa(RPIM1)and 58-kDa(PRIM2A and PRIM2B) Subunit Genes of the Human DNA Primase to Chromosome Bands 1q44 and 6p11,1-p12." Genomics. 28. 350-353 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Klyoyuki Torlgoe: "YAC-based 1.5 Mb Contig Spanning the Human Multidrug Resistance Gene Region and Delineating the Amplification Unit in Two Human Multidrug Resistant Cell Lines." Genome Research. 5. 233-244 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hitoshi Kusaba: "Functional Expression of Yeast Artificial Chromosome (YAC)-Human Multidrug Resistance Genes in Mouse Cells." Genome Research. 5. 245-258 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tatso Fukagawa: "Human Pseudoautosomal Boundary-Like Sequences (PABLs) : Expression and a Model of Formation of Present-day Pseudoautosomal Boundary of Sex Chromosomes." Human Molecular Genetics. 5. 23-32 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nobuhisa Mizuki: "Isolation of cDNA and Genomic Clones for a Human Ras-related GTP-Binding Protein and lts Chromosomal Localization to the Long Arm of Chromosome 7,7q36" Genomics. (印刷中). (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katsuzumi Okumura, et al: "The Genes for the alpha-Type HC3 (PSMA2) and beta-Type HC5 (PSMB1) Subunits of Human Proteasomes Map to Chromosomes 6q27 and 7p12-p13 by Fluorescence in Situ Hybridization :" Genomics. 27. 377-379 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akiko Shiratori, et al: "Assignment of the 49-kDa (RPIM1) and 58-kDa (PRIM2A and PRIM2B) Subunit Genes of the Human DNA Primase to Chromosome Bands 1q44 and 6p11.1-p12 :" Genomics. 28. 350-353 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kiyoyuki Torigoe, et al: "YAC-based 1.5Mb Contig Spanning the Human Multidrug Resistance Gene Region and Delineating the Amplification Unit in Two Human Multidrug Resistant Cell Lines :" Genome research. 5. 233-244 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hitoshi Kusaba, et al: "Functional Expression of Yeast Artificial Chromosome (YAC)-Human Multidrug Resistance Genes in Mouse Cells :" Genome Research. 5. 245-258 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tatsuo Fukagawa, et al: "Human Pseudoautosomal Boundary-Like Sequences (PABLs) : Expression and a Model of Formation of Present-day Pseudoautosomal Boundary of Sex Chromosomes :" Hum.Mol.Genet.5(1). 23-32 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nobuhisa Mizuki, et al: "Isolation of cDNA and Genomic Clones for a Human Ras-related GTP-Binding Protein and Its Chromosomal Localization to the Long Arm of Chromosome 7,7q36 :" Genomics. (in press). (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1995 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katsuzumi Okumura: "The Genes for the α‐Type HC3(PSMA2) and β‐Type HC5(PSMB1) Subunits of Human Proteasomes Map to Chromosomes 6q27 and 7p12‐p13 by Fluorescence in Situ Hybridization." Genomics. 27. 377-379 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Akiko Shiratori: "Assignment of the 49‐kDa(RPIM1) and 58‐kDa(PRIM2A and PRIM2B) Subunit Genes of the Human DNA Primase to Chromosome Bands 1q44 and 6p11.1‐p12." Gencmics. 28. 350-353 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kiyoyuki Torigoe: "YAC‐based 1.5 Mb Contig Spanning the Human Multidrug Resistance Gene Region and Delineating the Amplification Unit in Two Human Multidrug Resistant Cell Lines." Genome Research.5. 233-244 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Hitoshi Kusaba: "Functional Expression of Yeast Artificial Chromosome (YAC)‐Human Multidrug Resistance Genes in Mouse Cells." Genome Research. 5. 245-258 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Tatso Fukagawa: "Human Pseudoautosomal Boundary‐Like Sequences (PABLs): Expression and a Model of Formation of Present‐day Pseudoautosomal Boundary of Sex Chromosomes." Human Molecular Genetics. 5. 23-32 (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nobuhisa Mizuki: "Isolation of cDNA and Genomic Clones for a Human Ras‐related GTP‐Binding Protein and Its Chromosomal Localization to the Long Arm of Chromosome 7,7q36." Genomics. (印刷中). (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 奥村克純: "FISHによるDNA複製タイミングの解析とゲノム・インプリンティング." 組織培養. 21. 131-134 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Masayuki Seki: "Molecular Cloning of cDNA Encoding Human DNA Helicase Q1 Which Has Homology to Escherichia coli Rec Q He licase and Localization of the Gene at Chromosome 12p12" Nucleic Acid Research. 22. 4566-4573 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroshi Akioka: "Isolation and Characterization of the HC8 Subunit Gene of the Human Proteasome" Biochem.Blophys.Res.Commn.207. 318-323 (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Katsuzumi Okumura: "Assignment of the 36.5kDa(RFC5),37kDa(RFC4),38kDa(RFC3),and 40 kDa(RFC2)Subunit Genes of Human Replication Facter C to Chromosome Bands 12q24.2-q24.3,3q27,13q12.3-q13,and 7q11.23" Genomics. (印刷中). (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Tatsuo Fukagawa: "A boundary of long-range G+C% mosaic domains in the human MHC locus:Pseudoautosomal boundary-like sequence exists near the boundary" Genomics. (印刷中). (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Katsuzumi Okumura: "The Genes for the α-Type HC3 and β-Type HC5 Subunits of Human Proteasomes Map to Chromosomes 6q27 and 7p12-p13by Fluorescence in Situ Hybridization" Genomics. (印刷中). (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 奥村克純: "FISHによるDNA複製タイミングの解析とゲル・インプリンティング" 組織培養. (印刷中). (1995)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] 松原謙一: "FISH実験プロトコール-ヒト・ゲノム解析から染色体・遺伝子診断まで-" 秀潤社, 219 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Takesi Kobayashi: "Animal Cell Technology:Basic & Applied Aspects,Vol.6" Kluwer Academic Publishevs,Netherland, 615 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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