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クロマツ葉緑体のRNAエディティングに関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 06740596
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 植物生理
研究機関名古屋大学

研究代表者

若杉 達也  名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助手 (10212317)

研究期間 (年度) 1994
研究課題ステータス 完了 (1994年度)
配分額 *注記
900千円 (直接経費: 900千円)
1994年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードRNAエディティング / 遺伝子発現 / 葉緑体ゲノム / 裸子植物 / クロマツ
研究概要

裸子植物のクロマツの葉緑体においてRNAエディティングが起きているかどうかを検証するために、コンピューター解析から予想されたエディティング部位を含む断片をクロマツの全DNAと全RNAから合成したcDNAからPCRによって増幅した。それらのDNAとcDNAの断片の塩基配列を決定し、両者の間で比較した。その結果、解析した10種のクロマツ葉緑体遺伝子(atpA、atpF、petD,petG、psaB、psbB、rps14、ORF62、ORF320)の前駆体RNAにおいて、24ヶ所でRNAエディティングが起きていることが明らかとなった。そのRNAエディティングのタイプはすべてC→U変換によるものだった。RNAエディティングによるコドンの変化のパターンは、これまで被子植物の葉緑体ではコドンの2文字目が変化するのがほとんどであったのに対し、クロマツではコドンの1文字目が変化している例が多くみられ、被子植物葉緑体では報告のなかったタイプのコドン置換も7種見つかった。それらのなかで特殊なものとして終止コドンが形成される例が2例(petD、ORF62)見つかった。なかでもORF62についてはRNAエディティングによって開始コドンと終止コドンの両方が形成されることにより、ORF62から植物間で保存されたサイズのORF33に変化することが明らかになった。このような例は動植物をつうじて初めての報告である。以上のように裸子植物のクロマツにおいて葉緑体でのRNAエディティングの機構が獲得されていること、そのRNAエディティングのパターンは被子植物のものとは異なっていることが明らかとなった。

報告書

(1件)
  • 1994 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] Tatsuya Wakasugi: "Loss of all ndh genes as determined by sequencing the entire chloroplast genome of black pine,Pinus thunbergii" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 91. 9794-9798 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Tatsuya Wakasugi: "A physical map and clone bank of the black pine(Pinus thunbergii)chloroplast genome." Plant Mol.Biol.Rep.12. 227-241 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Tetsuro Hirose: "RNA editing of tobacco petB mRNAs occurs both in chloroplasts and non-photosynthetic proplastids." Plant Mol.Biol.26. 509-513 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Junko Tsudzuki: "A gene encoding tRNA^<Pro>(GGG) is present in the chloroplast genome of black Pine:a complilation of 32 tRNA genes from black pine chloroplast" Curr.Genet.26. 153-158 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Sanjay Kapoor: "An atpE spexific promoter within the coding region of atpB gene in tobacco chloroplast DNA." Curr.Genet.26. 263-268 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書
  • [文献書誌] Masakazu Fukuta: "Nucleotide sequence of a putative sensovy kinase gene from the cyanobacterium,Anacystis nidulans 6301" DNA Res.1. 99-100 (1994)

    • 関連する報告書
      1994 実績報告書

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公開日: 1994-04-01   更新日: 2016-04-21  

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