| 研究課題/領域番号 |
06F06244
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| 研究種目 |
特別研究員奨励費
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 応募区分 | 外国 |
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| 研究分野 |
細菌学(含真菌学)
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| 研究機関 | 宮崎大学 |
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研究代表者 |
林 哲也 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 教授
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| 研究分担者 |
ASADULGHANI 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 外国人特別研究員
ASADULGHANI 宮崎大学, フロンティア科学実験総合センター, 外国人特別研究員
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| 研究期間 (年度) |
2006 – 2007
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| 研究課題ステータス |
完了 (2007年度)
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| 配分額 *注記 |
2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
2007年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
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| キーワード | 大腸菌0157 / プロファージ / 遺伝子水平伝達 / DNAマイクロアレイ / Stxファージ / プロファージ間相互作用 / リアルタイム定量PCR / 大腸菌O157 / 水平伝達 / 病原遺伝子 / ゲノム |
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| 研究概要 |
腸管出血性大腸菌O157Sakai株が保有する18種類のプロファージに関して、以下の解析を行った。
1)大腸菌O157堺株が保有する18種類のプロファージのゲノム配列の詳細な再解析
2)誘発可能なファージ検出のためのマイクロアレイ解析
3)染色体から切り出されたファージゲノムのPCRによる検出
4)リアルタイム定量PCRによる細胞内及びファージ粒子内に存在するファージゲノムDNAの定量
5)染色体から切り出されてファージ粒子内にパッケージされると考えられたプロファージへのCp耐性遺伝子の挿入
6)Cp耐性遺伝子を付加したプロファージの大腸菌K-12株への伝達能の解析
以上の解析の結果、明らかな構造的欠陥を有する複数のプロファージが、ゲノムからの切り出し、複製、ファージ粒子内へのパッケージング能を有することが明らかとなった。さらに、少なくとも3種類のプロファージがK-12株に伝達されることも明らかになった。この予想外の結果は、細菌のゲノム上にしばしば存在するdefectiveなプロファージがただの残骸でなく、潜在的な水平伝達能力を持つことを初めて示したものである。同時に、この結果はゲノム上に複数存在するdefectiveなプロファージ間で、遺伝子産物のin transでの供給など、様々な相互作用があることを示すものである。さらに、これらの解析の中で、O157のStx1ファージであるSp15とStx2ファージであるSp5との間で、高頻度の組換えが生じ、新しいStx2ファージが生じることを明らかにし、その組換え部を特定した。また、大腸菌O157の病原性発現を制御すると予想される新規の調節遺伝子や、これまで報告されていない全く新しいタイプのファージの複製タンパク質と発現調節タンパク質を発見した。今後、さらに詳細な解析を行う必要があるが、いずれも重要な発見である。
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