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内在性レトロトランスポゾンを用いたミヤコグサの遺伝子タギング系の開発

研究課題

研究課題/領域番号 06J00900
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 育種学
研究機関独立行政法人農業生物資源研究所

研究代表者

深井 英吾  独立行政法人農業生物資源研究所, 基盤研究領域, 特別研究員(PD) (00570657)

研究期間 (年度) 2006 – 2008
研究課題ステータス 完了 (2008年度)
配分額 *注記
3,400千円 (直接経費: 3,400千円)
2008年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2007年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2006年度: 1,200千円 (直接経費: 1,200千円)
キーワードミヤコグサ / レトロトランスポゾン / モデル植物 / 遺伝子タギング / ゲノム動態 / 国際情報交換 / デンマーク
研究概要

本研究ではミヤコグサ内在のレトロトランスポゾンLORE1,2を用い、ミヤコグサで遺伝子タギング系を確立する事を目的としている。
昨年度に、DNAのシトシンメチル化を制御する遺伝子の発現を低下させたミヤコグサの形質転換体においてLORE1が転移していたことを受け、更なる解析を行った。その結果、組織培養を経て再分化させた植物体の後代の集団において、LORE1の活性化が確率論的に生じていることがが分かった。つまり、LORE1の活性化は組織培養を介して誘導でき、活性化に外来遺伝子の導入は必須ではなく、非形質転換体においてもLORE1の転移を誘導できる事が分かった。
活性化されたLORE1の転移様式を解析した。再分化当代個体のゲノムにおけるLORE1のコピー数増加はこれまでに認められておらず、したがって培養期間中にはLORE1の転移は生じないか、その頻度はきわめて低いと考えられた。一方で、LORE1の新規転移コピーは再分化当代の自殖後代において高頻度に検出された。この事から、LORE1が転移する場は植物体であることが分かった。転移は配偶体的に起きており、この事は、独立の転移挿入数を多く蓄積する必要がある遺伝子タギング系の確立にとって、LORE1が非常に適している事を示す。
以上、人為的なLORE1の誘導に成功した事により、LORE1を利用したミヤコグサの遺伝子タギング系確立が実現可能となった。ミヤコグサ遺伝子タギング系は、植物の新しい分子生物学的研究基盤として、またマメ科植物の農学的研究を加速するツールとして、その利用が期待できる。

報告書

(3件)
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 2006 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2009 2008 2007

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件) 学会発表 (6件) 図書 (1件) 産業財産権 (1件)

  • [雑誌論文] A retrotransposon-inserted VvmybAla allele has been spread among cultivars of Vitis vinifera but not North American or East Asian Vitis species2009

    • 著者名/発表者名
      Nobuhito Mitani
    • 雑誌名

      Vitis 48

      ページ: 55-56

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rearrangement of actin cytoskeleton mediates invasion of Lotus japonicus roots by Mesorhizobium loti2009

    • 著者名/発表者名
      Keisuke Yokota
    • 雑誌名

      The Plant Cell 21

      ページ: 267-284

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Transposition of a 600 thousand-year-old LTR retrotransposon in the model legume Lotus japonicus2008

    • 著者名/発表者名
      Eigo Fukai
    • 雑誌名

      Plant Molecular Biology 68

      ページ: 653-663

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] LysM domains mediate lipochitin-oligosaccharide recognition and Nfr genes extend the symbiotic host range.2007

    • 著者名/発表者名
      Raditou, S.
    • 雑誌名

      EMBO Journal 26

      ページ: 3923-3935

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] イネのDNA低メチル化変異体の解析2008

    • 著者名/発表者名
      深井 英吾
    • 学会等名
      日本育種学会113回講演会
    • 発表場所
      明治大学生田キャンパス
    • 年月日
      2008-03-29
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] CNGシトシンメチル化低下がイネゲノムに与える影響2008

    • 著者名/発表者名
      深井 英吾
    • 学会等名
      第49回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター
    • 年月日
      2008-03-21
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Activation of transposable elements for mutation induction2008

    • 著者名/発表者名
      Hirohiko Hirochika
    • 学会等名
      FAO/IAEA International Symposium on Induced Mutations in Plants (ISIM)
    • 発表場所
      Vienna, Austria
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ミヤコグサのレトロトランスポゾンLORE1の転移誘導2008

    • 著者名/発表者名
      深井英吾
    • 学会等名
      植物微生物研究会第18回研究交流会
    • 発表場所
      奈良
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] マメ科モデル植物ミヤコグサのレトロトランスポゾンLORE1の活性化2008

    • 著者名/発表者名
      深井英吾
    • 学会等名
      日本育種学会第114回講演会
    • 発表場所
      彦根
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Activation of LORE1, an endogenous retrotransposon in model legume Lotus japonicus2008

    • 著者名/発表者名
      Eigo Fukai
    • 学会等名
      IV International conference on Legume Genomics and Genetics
    • 発表場所
      Puerto Vallarta, Mexico
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [図書] 細胞工学別冊 植物細胞工学シリーズ24 植物のエピジェネティクス 第2章-1 トランスポゾンの制御と進化2008

    • 著者名/発表者名
      深井 英吾
    • 出版者
      秀潤社
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [産業財産権] ミヤコグサ由来のレトロトランスポゾンLORE1を用いた変異体植物の作成方法2008

    • 発明者名
      廣近洋彦, 深井英吾, 河内宏, 梅原洋佐
    • 権利者名
      独立行政法人農業生物資源研究所
    • 産業財産権番号
      2008-308637
    • 出願年月日
      2008-12-03
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

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公開日: 2006-04-01   更新日: 2024-03-26  

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