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チミンダイマー特異抗体によるDNAの認識機能

研究課題

研究課題/領域番号 07044214
研究種目

国際学術研究

配分区分補助金
応募区分共同研究
研究分野 医薬分子機能学
研究機関北海道大学

研究代表者

井上 英夫 (1996-1997)  北海道大学, 薬学部, 助教授 (80088856)

大塚 栄子 (1995)  北海道大学, 薬学部, 教授 (80028836)

研究分担者 STEWART Jon  Dept. of Chemistry, The University of Flor, Assistant
BENKOVIC Ste  Dept. of Chemistry, The Pennsylvania State, Professor
松永 司  北海道大学, 薬学部, 助教授 (60192340)
小松 康雄  北海道大学, 薬学部, 助手 (30271670)
森岡 弘志  北海道大学, 薬学部, 助手 (20230097)
二階堂 修  金沢大学, 薬学部, 教授 (60019669)
井上 英夫  北海道大学, 薬学部, 助教授 (80088856)
研究期間 (年度) 1995 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
10,200千円 (直接経費: 10,200千円)
1997年度: 3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
1996年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
1995年度: 3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
キーワード紫外線損傷DNA / モノクローナル抗体 / 一本鎖抗体 / チミンダイマー / (6-4)光産物 / Dewar型異性体 / ELISA法 / Dewar型変性体
研究概要

紫外線によって生ずるDNA中のピリミジンダイマーにはいくつかの種類があり,変異の原因となることが知られている.これらを識別する抗体の抗原認識機構を明らかにするため,抗体遺伝子のクローニングを行い,可変領域のアミノ酸配列の比較した.さらに,H鎖およびL鎖の可変領域をフレキシブルペプチド[(GGGGS)3]で連結させた一本鎖抗体(scFv)遺伝子を構築し,大腸菌を用いてその発現を行った.この際,蛋白質のC末端にヒスチジンタグを繋げ,Ni-NTAカラムによるアフィニティ精製を計画した.scFv抗体遺伝子をT7 RNAポリメラーゼのプロモーターを用いて発現させた場合,封入体形成がみられたので,蛋白質のrefoldingを行い,単量体scFv抗体を得た.また,抗原となる紫外線損傷塩基を含むオリゴヌクレオチドは,シクロブタン型チミンダイマーまたは(6-4)光産物を含むダイマーユニットを合成した後,DNA自動合成機を用いて得た.各オリゴヌクレオチドの3′末端には,結合実験に抗原として用いるために必要なビオチン残基をアルキルリンカーを介して結合させた.ハイブリドーマ細胞より調製したFab抗体,および上記のscFv抗体の結合反応速度定数をバイオセンサー(BlAcore)を用いて速度論的に解析した。その結果,組換え型scFv抗体は天然型のFab抗体と同様の抗原結合特性を示すことが明らかなった.また,塩濃度変化の実験から、scFv抗体の抗原結合には静電相互作用が重要であり,疎水的相互作用が結合を安定化していた.コンピューターモデリングにより(6-4)光産物認識scFv抗体の立体構造を構築し,抗原結合に重要と考えられる部位に適当な変異を導入した.変異型scFv抗体の結合活性を測定し,抗原結合様式について考察した.

報告書

(4件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (20件)

  • [文献書誌] Yasuo Komatsu: "Antigen structural requirements for recognition by a cyclobutane thymine dimer-specific monoclonal antibody" Nucleic Acids Res.25. 3889-3894 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasuo Komatsu: "Preliminary studies for interaction of a cyclobutane thymine dimer region with its cognate antibody" Nucleic Acids Symposium Series. 37. 281-282 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takeshi Todo: "Flavin adenine dinucleotide as a choromophore of the Xenopus(6-4)photolyase." Nucleic Acids Res.25. 764-768 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroyuki Kobayashi: "Specificities and rates of binding of anti-(6-4)photoproduct antibody fragments to synthetic thymine photoproducts." J.Biochem.123. 182-188 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroshi Morioka: "Antibodies specific for(6-4)DNA photoproducts:Cloning,antibody modeling and construction of a single-chain Fv derivative." Biochim.Biophys.Acta. (in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mihoko kai: "A new drosophila ultraviolet light-damaged DNA recognition endonuclease that selectivel nicks a(6-4)photoproduct site." Biochim.Biophys.Acta. (in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasuo Komatsu: "Antigen structural requirements for recognition by a cyclobutane thymine dimer-specific monoclonal antibody" Nucleic Acids Res.25. 3889-3894 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasuo Komatsu: "Preliminary studies for interaction of a cyclobutane thymine dimer region with its cognate antibody" Nucleic Acids Symposium Series.37. 281-282 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takeshi Todo: "Flavin adenine dinucleotide as a choromophore of the Xenopus (6-4) photolyase" Nucleic Acids Res.25. 764-768 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroyuki Kobayashi: "Specificities and rates of binding of anti- (6-4) photoproduct antibody fragments to synthetic thymine photoproducts" J.Biochem.123. 182-188 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiroshi Morioka: "Antibodies specific for (6-4) DNA photoproducts : Cloning, antibody modeling and construction of a single-chain Fv derivative" Biochim.Biophys.Acta.(in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mihoko Kai: "A new drosophila ultraviolet light-damaged DNA recognition endonuclease that selectively nicks a (6-4) photoproduct site" Biochim.Biophys.Acta.(in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yasuo Komatsu.: "Antigen structural requirements for recognition by cyclobutane thymine dimer-specific monoclonal antibody." Nucleic Acids Res.25. 3889-3894 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Yasuo Komatsu: "Preliminary studies for interaction of a cyclobutane thymine dimer region with its cognate antibody" Nucleic Acids Symposium Series. 37. 281-282 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Takeshi Toda: "Flavin adenine dinucleotide as a choromophore of the Xenopus(6-4)photolyase." Nucleic Acids Res.25. 764-768 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroyuki Kobayashi: "Specificities and rates of binding of anti-(6-4) photoproduct antibody fragments to synthetic thymine photoproducts." J.Biochem.123. 182-188 (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroshi Morioka: "Antibodies specific for (6-4) DNA photoproducts:Cloning,antibody modeling and construction of a single-chain Fv derivative." Biochim.Biophys.Acta. (in press).

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Mihoko Kai: "A new drosophila ultraviolet light-damaged DNA recognition endonuclease that selectively nicks a (6-4) photoproduct site." Biochim.Biophys.Acta. (in press).

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 森岡 弘志: "Construction and expression of single chain Fv genes for pyrimidine (6-4) photoproduct" (発表予定).

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 森岡 弘志: "Cloning of genes for monoclonal antibodies of (cis-syn) cyclobutane thyminedimer using a phage display system" (発表予定).

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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