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バクテリオロドプシンのプロトントランスポータとチャネル

研究課題

研究課題/領域番号 07276218
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関京都大学

研究代表者

前田 章夫  京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (20012370)

研究期間 (年度) 1995
研究課題ステータス 完了 (1995年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
1995年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードバクテリオロトプシン / トランスポータ / チャネル / シッフ塩基 / L中間体 / 水分子 / プロトン / 光
研究概要

バクテリオロドプシンは、そのシッフ塩基を中心としたトランスポータが、先ず、細胞外にプロトンをだし、その後、細胞内からプロトンをとりこむための二つのチャネルに構造変化を与えて、プロトンを一方向に運ぶ。光で誘導される中間体、特にマイクロ秒の時間帯に生じるL中間体、それに続くM中間体の構造を、フーリエ変換赤外スペクトル法(FTIR)と変異蛋白質を用いて解析し、トランスポータとチャネルの関連を明らかにしてゆくのが、本研究の目的である。
(1)トランスポータ活性発現への最初の段階であるL中間体の生成に伴い、細胞外チャネルにつながるAsp85に配位した水分子が、その近くにあるAsp212、およびシッフ塩基と強い水素結合を作ることを示した。またTrp182がアロステリックに、レチナ-ルの9メチル基を通じて、トランスポーターの機能に影響を与えていることも示した。これらの構造体の形成が、そのあとのシッフ塩基からAsp85へのプロトン移動を起こす原動力である。
(2)L中間体の生成に伴い、Asp85に配位した水分子からVal49のC=0に配位した水分子、さらに細胞内側チャネル部分にあるThr46とAsp96の間にある水分子の水素結合変化が起こり、Asp96を中心にした細胞内チャネルが活性化することが示された。
(3)トランスポータ部分を構成するAsp85の負の電荷をなくすと、シッフ塩基からのプロトンが受容できなくなるので、プロトンをポンプできなくなる。それに塩素イオンを入れると、他の部分はまったくバクテリオロドプシンのままで、塩素イオンを、プロトンとは反対の方向に運搬できるようになる。

報告書

(1件)
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (12件)

  • [文献書誌] Yamazaki,Y.: "Interaction of tryptophan-182 with the retinal 9-methyl group in the L intermediate of bacteriorhodopsin." Biochemistry. 34. 577-582 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Ohkita, Y.J.: "Changes in structure of the chromophore in the photochemical process of bovine rhodopsin as revealed by FTIR spectroscopy for hydrogen-outof-planev ibrations." Biophys.Chem.56. 71-78 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Cao,Y.: "Relationship of proton release at the extracellular surface to deprotonation of the Schiff base in the bacteriorhodopsin photocycle." Biophys.J.68. 1518-1530 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kandori,H.: "Water-mediated proton transfer in proteins:An FTIR study of bacteriorhodopsin." J.Am.Chem.Soc.117. 2118-2119 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Sasaki,J.: "Nanosecond time-resolved infrared spectroscopy distinguishes two K species in the bacteriorhodopsin photocycle." Biophys.J.68. 2073-2080 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Yamazaki,Y.: "Water structural changes at the proton uptake site (the Thr46-Asp96 domain) in the L intermediate of bacteriorhodopsin." Biochemistry. 34. 7088-7093 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Sasaki,J.: "Conversion of bacteriorhodopsin into a chloride ion pump." Science. 269. 73-75 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Brown,L.S.: "The complex extracellular domain regulates the deprotonation and reprotonation of the retinal Schiff base during the bacteriorhodopsin photocycle." Biochemistry. 34. 12903-12911 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Varo,G.: "Light-driven chloride ion transport by halorhodopsin from Natronbacterium pharaonis.I.The photochemical cycle." Biochemistry. 34. 14490-14499 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Brown,L.S.: "Glutamic acid 204 is the terminal proton release group at the extracellular surface of bacteriorhodopsin" J.Biol.Chem.270. 27122-27126 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kandori,H.: "ETIR spectroscopy reveals microscopic structural changes of the protein around the rhodopsin chromophore upon photoisomerization." Biochemistry. 34. 14220-14229 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Nishimura,S.: "Structural changes in the lumirhodopsin-to-metarhodopsin I conversion of air-dried bovine rhodopsin." Biochemistry. 34. 16758-16763 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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