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RLGS法を用いたマウスインプリント遺伝子の系統的探索

研究課題

研究課題/領域番号 07282222
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関理化学研究所

研究代表者

林崎 良英  理化学研究所, ゲノム科学研究室, 主任研究員 (70192705)

研究期間 (年度) 1995
研究課題ステータス 完了 (1995年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
1995年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
キーワードゲノムインプリンティング / RLGS / CpG island / くり返し配列 / cdc25Mm / U2afbp-ts
研究概要

本年度はメチル化インプリント座位のスクリーニングを行った。前年度までに報告した結果に加え、更にlandmark座位にNotI,Bss-II,EagIを、C57BL/6JとPWK(Mus musculus musculus)の交配を用いて全CpG islandの約35%まで範囲を拡げスクリーニングを行った。その結果、新たな5つのcandidate imprinted spotsを同定した。
また、これまでにスクリーニングの結果を報告したcandidate spotsの内、マウス第9染色体にマップされたIrlgs3よりインプリント遺伝子cdc25Mmを同定した。Irlgs3は母方由来で脱メチル化し父方由来でメチル化するNotI座位であった。Irlgs3に相当するゲノムDNA断片をRLGSゲルからクローニングし、この領域を含むcosmid,P1クローンを単離し転写単位の検索を行った。exon trapの結果ras activatorであるマウスcdc25Mm遺伝子を同定し、その発現が父方由来の染色体特異的であることを示した。また、Irlgs3のNotI座位の近傍には41bp単位のtandem repeatが40回見出され、U2afbp-rsと共通構造としてメチル化インプリント座位近傍のくり返し配列がインプリントの制御に重要であると示唆された。このRLGS法を用いた系統的探索により、これまで2つマウスインプリント遺伝子を同定しており有効なストラテジーと考えられる。

報告書

(1件)
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (7件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (7件)

  • [文献書誌] Okazaki Y.: "An expanded system of restriction landmark genomic scanning(RLGS Ver.1.8)" Electrophoresis. 16. 197-202 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Ohsumi T.: "A spot cloning method for restriction landmark genomic scanning" Electrophoresis. 16. 203-209 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Watanabe s.: "Accessibility to tissue-specific genes from methylation profiles of mouse brain genomic DNA" Electrophoresis. 16. 218-226 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Okuizumi H.: "Genetic mapping of restriction landmark genomic scanning loci in the mouse" Electrophoresis. 16. 233-240 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Okuizumi H.: "A single gel analysis of 573 dominant and codominant restriction landmark genomic scanning loci in mice interspecific backcross progeny" Electrophoresis. 16. 253-260 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Plass C.: "Comparative analysis of mouse NotI linking clones with mouse and human genomic sequences and transcripts" DNA Res.2. 27-35 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Plass C.: "Identification of CDC25^<Mm> on mouse chromosome 9 as an imprinted gene by RLGS-M" Nature Genetics. (in press).

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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