| 研究分担者 |
愈 栄 住友金属工業株式会社バイオメディカル事業部, 研究主任
長谷川 明生 名古屋大学, 大型計算機センター, 助教授 (20126890)
孫田 信一 愛知県心障害者コロニー, 発達障害研究所, 室長 (00100165)
並河 鷹夫 名古屋大学, 農学部, 教授 (70111838)
小原 良孝 弘前大学, 理学部, 教授 (90003673)
松田 洋一 名古屋大学, 農学部, 助教授 (70165835)
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| 研究概要 |
住友金属社製のカリオビジョン2000をベースに動物用自動解析ソフトを開発することを目的に基本となる多くの動物染色体のGバンド標本を作製し,標準化をおこなった.これらの画像は約100の分裂細胞をコンピュータに記憶させることにより,染色体の自動並べ換えなど,標本解析を可能にした.1)染色体画像解析結果すなわちバンドパターン,長さ,面積など特徴量をファイルに累積保存するソフトおよびインターフェースを作成した.2)データベースの項目名を動物用に変更し,種名,系統名,標本番号,採集者,分析者などを記入できるように設定した.分析用に作成した染色体はスンクス(ジャコウネズミ)やチャイニーズハムスターに続き,家畜ではブタ,ヤギ,ウシ,野性動物ではハントウアカネズミ,ハタネズミ,ヒメヒミズで,コンピュータに取り込みをおこなった.ヒット率(正確に並べ換えができた染色体の割合)は最も高いチャイニーズハムスターの94.5%から最も低いウシの67.5%の間であった.これらの変動要因は言うまでもなく染色体標本がいかにうまくできているか,個々の染色体の特徴がはっきりしているかに依存していた.
今回のシステムを構築するに当たって新しく開発したバンドの特徴を抽出する方法は,次のような利点がある.1)正確さ:染色体のバンドから中軸を描き出す方法になっているため,誤差を減らすことが可能になった.2)柔軟性:染色体の形状は常に同じ形が想定できるものではないのでこの方法によって得られた染色体の中軸は,その形状を十分広くモデル化することができる.3)早さ:染色体を骨格化するという作業を回避することができ,その結果,解析スピードが向上した.このシステムでは染色体の特徴抽出を含めたオートカリオまでの処理を2分以内で行うことができ,時間と費用の大幅な削減が可能となった.
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