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微小蛋白質結晶のX線回析データ測定のための全自動高輝度光学系調整システム

研究課題

研究課題/領域番号 07554059
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分試験
研究分野 物理化学
研究機関名古屋大学

研究代表者

山根 隆  名古屋大学, 工学部, 教授 (80030055)

研究分担者 片山 忠二  (株)マックサイエンス, 技術開発本部・本部長研究室
白井 剛  名古屋大学, 工学部, 助手 (00262890)
鈴木 淳巨  名古屋大学, 工学部, 助教授 (40196788)
芦田 玉一  名古屋大学, 工学部, 教授 (10029936)
研究期間 (年度) 1995 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
700千円 (直接経費: 700千円)
1996年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワード結晶構造解析 / X線回析 / 自動化 / 集光光学系 / タンパク質 / 微小結晶 / X線回折 / 蛋白質結晶構造解析 / 微小蛋白質結晶 / ミラーミラー集光 光学系 / 高輝度X線 / 自動調整光学系
研究概要

X線源の単位面積当りの強度(輝度)を強めるために、ミラーミラー光学系をコンピュータ制御することにより全自動調整システムを作製をし、(株)マックサイエンスの迅速X線回析装置DIP100と組み合わせ、性能を評価した。計算からは、X線の輝度は従来より4-5倍高まるはずであるが、実質8-10倍と大幅な改良が見られた。従来のミラーミラー光学系の調整を手動で行う方式では、微妙なミラーの湾曲調整は経験と時間を必要としたが、ステッピングモーターの使用によるコンピューター制御により調整時間が半分以下に短縮がされ、再現性も向上した。
蛋白質のX線結晶構造解析の最大のネックは結晶化であるが、比較的得易い0.2x0.2x0.1mm程度の微小結晶では、DIP100で集光系を用いない場合には、解析に使用できる精度のデータ収集はできなかった。この集光系と組み合わせた実験結果を以下に示す。1)アルカリセルラーゼ ; 0.15X0.10X0.08mmという従来ではデータ収集不可能な微小結晶でも、3.3A分解能でほぼ放射光での実験に匹敵するデータを収集できた。2)モジュール置換キメラヘモグロビン ; 0.9X0.1X0.1mmの針状結晶を用いて、放射光に匹敵する2.5A分解能のデータを収集できた。3)アミダーゼCwlC ; 0.8×0.3×0.08mmの結晶から、3.5A分解能までの反射約31,000(孤立な反射数約11,000)を収集し、Rmerge=0.10程度と精度の良いデータを収集できた。以上、通常のX線源でも集光系とDIP100を用いれば、撮影時間は20倍程度要するが、従来は放射光でしか測定できなかった微小サイズの結晶でもデータ収集が可能なことが明らかになった。本システムは、初心者にも使いやすく、蛋白質結晶構造解析のためのデータ収集に能率良く利用でき、当初の目的を十分に達成できたと考えられる。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (18件)

  • [文献書誌] A. Suzuki, T. Yamane, T. Ashida: "Crystallographic refinement of Bowman-Birk type protease inhibitor A-II from Peanut (Arachis hypogaea) at 2.3 A resolution." J. MOI. Biol.234. 722-734 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Suzuki, T. Yamane, T. Ashida: "Crystallization and preliminary X-ray studies on the trypsin inhibitor 1-2 from wheat germ and its complex with trypsin." Acta Crystallogr.D49. 594-596 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Yamane, A. Suzuki, T. Ashida: "Crystal structure of a new aikaline serine protease (M-protease) from Bacillus sp. KSM-K16" Acta Crystallogr.D51. 199-206 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Suzuki, T. Yamane, T. Ashida: "Crystal structure analysis of phospholipase A2 from Trimeresurus flavoviridis (Habu snake) venom at 1.5A resolution." J. Biochem. 117. 730-740 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Yamane, A. Suzuki, T. Ashida: "Crystal structure of Streptomyces erythraeus trypsin at 1.9A resolution." J. Biochem. 118. 882-894 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Shirai, A. Suzuki, T. Yamane, T. Ashida: "High-resolution crystal structure of M-protease : phylogeny aided analysis of the high-alkaline adaptation mechanism." Protein Engineering. (in press). (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Suzuki, T.Yamane, T.Ashida, S.Norioka, S.Hara & T.Ikenaka: "Crystalloraphic Refinement of Bowman-Birk Type Protease Inhibitor A-II from Peanut (Arachis Hypogaea) at 2.3* Resolution." J.Mol.Biol.234. 722-734 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Suzuki, T.Kurasawa, C.Tashiro, K.Hasegawa, T.Yamane & T.Ashida: "Crystallization and Preliminary X-Ray Studies on the Trypsin Inhibitor I-2 from Wheat Germ and Its Complex with Trypsin." Acta Crystallogr.D49. 594-596 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yamane T.Kani, T.Hatanaka, A.Suzuki, T.ashida, T.Kobayashi, S.Ito & O.Yamashita.: "Structure of a new a lkaline serine protease(M-protease)from Bacillus sp.KSM-K16." Acta Crystallogr.D51. 199-206 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Suzuki, E.Matsueda, T.Yamane, T.ashida, H.Kihara, & M.Ohno: "Crystal Structure Analysis of Phospholipase A2 from Trimeresurus flavoviridis(Habu Snake)Venom at 1.5* Resolution." J.Biochem.117. 730-740 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Yamane, A.Iwasaki, A.Suzuki, T.ashida, Y.Kawata &F.Sakiyama: "Crystal Structure of Streptomyces erythraeus Trypsin at 1.5* Resolution." J.Biochem.118. 882-894 (1995)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Shirai, A.Suzuki, T.Yamane, & T.Ashida: "High-Resolution crystal structure of M-Protease : Phylogeny Aided Analysis of the High-Alkaline Adaptation Mechanism." Protein Engineering. (in press). (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Suzuki,T.Yamane,T.Ashida: "Crystallographic refinement of Bowman-Birk type protease inhibitor A-II from Peanut (Arachis hypogaea) at 2.3A resolution。" J.MOl.Biol.234. 722-734 (1993)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] A.Suzuki,T.Yamane,T.Ashida: "Crystallization and preliminary X-ray studies on the trypsin inhibitor I-2 from wheat germ and its complex with trypsin." Acta Crystallogr.D49. 594-596 (1993)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yamane,A.Suzuki,T.Ashida: "Crystal structure of a new aikaline serine protease (M-protease) from Bacillus sp.KSM-K16" Acta Crystallogr.D51. 199-206 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] A.Suzuki,T.Yamane,T.Ashida: "Crystal structure analysis of phospholipase A2 from Trimeresurus flavoviridis (Habu snaka) venom at 1.5A resolution." J.Biochem.117. 730-740 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yamane,A.Suzuki,A.Ashida: "Crystal structure of Streptomyces erythraeus trypsin at 1.9A resolution." J.Biochem.118. 882-894 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Shirai,A.Suzuki,T.Yamane,T.Ashida: "High-resolution crystal structure of M-protease:phylogeny aided analysis of the high-alkaline adaptation mechanism." Protein Engineering. (in press). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2025-11-19  

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