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末端酸化酵素選択的抗菌剤の開発と基質酸化機構の生化学的解析

研究課題

研究課題/領域番号 07558221
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分試験
研究分野 機能生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

茂木 立志  東京大学, 大学院・理学系研究科, 助手 (90219965)

研究分担者 長村 俊彦  (株)ユニソク, 科学機器開発研究所, 所長
三芳 秀人  京都大学, 農学部, 助教授 (20190829)
研究期間 (年度) 1995 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
1996年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
キーワード抗菌剤 / 末端酸化酵素 / キノール酸化酵素 / キノンアナログ / 大腸菌 / 基質酸化部位 / 置換フェノール / 反応機構 / 基質酸化機構 / 耐性変異 / 置換フェノール類 / ユビキノン / 活性評価システム / カプサイシン
研究概要

好気的呼吸鎖のキノール酸化酵素を標的とする特異的抗菌剤の開発と基質酸化機構の解明を目的とした研究を進め、以下の成果を得た。1)キノール酸化部位:基質認識機構を解明するため、系統的に合成したユビキノン誘導体を用いて置換基の効果を検討した。大腸菌チトクロムboとチトクロムbdは、一次構造に全く相同性が無いにも関わらず、共に2-メトキシ基と5-メチル基の認識部位に立体的な制約を持つことが判明した。チトクロムboでは、6-イソプレニル基が結合親和性に関与することを見い出した。2)キノン結合部位:置換フェノールを用いた研究から、チトクロムboの高親和性キノン結合部位(Q_H)は、キノール酸化部位(Q_L)とは異なる認識機構を持つことが判明した。また、阻害剤での再構成実験と還元型酵素と酸素との反応の解析から、Q_Hは分子内電子移動を媒介することが判明した。3)キノール酸化酵素の新規阻害剤:アンチマイシンA、ロテノン、カプサイシンなどの誘導体を合成し、アンチマイシンA誘導体の中に強い阻害活性を示すものが存在することを見い出した。4)抗菌活性と耐性変異:本研究で同定した新規阻害剤の中で、3種類のキノンアナログが大腸菌の好気的増殖を抑制する抗菌剤として使用できることを確立した。更に、チトクロムboの耐性変異株を取得し、その解析を行った。本研究から、チトクロムboではサブユニットIIのQ_Lで2電子酸化が起こり、Q_HはサブユニットIの低スピンヘムに逐次的に1電子伝達を行うのみならず、リザーバーとして電子移動を調節することが示唆された。5)酵素複合体の構造:サブユニットIVの置換変異と復帰変異の解析、架橋実験から、本酵素の構造は土壌細菌のチトクロムc酸化酵素に類似することを明らかにした。また、6Åの反射を示す結晶を得、現在、構造決定のために結晶化条件を検討している。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (65件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (65件)

  • [文献書誌] M.Sato-Watanabe: "Stabilization of a semiquinone radical at the high affinity quinone binding site of the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase." FEBS Lett.374. 265-269 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y.Orii: "Facilitated intramolecular electron transfer in the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase requires chloride." Biochemistry. 34. 1127-1132 (1995)

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  • [文献書誌] T.Mogi: "Cu_B promotes both binding and reduction of dioxygen at the heme-copper binuclear center in the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase." FEBS Lett.370. 259-263 (1995)

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  • [文献書誌] S.Hirota: "Resonance Raman study on axial ligands of heme irons in cytochrome bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli." Biospectroscopy. 1. 305-311 (1995)

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  • [文献書誌] M.Tsubaki: "Cyanide-binding site of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli." J.Biol.Chem.270. 28565-28569 (1995)

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  • [文献書誌] T.Saitoh: "Comparison of the inhibitory action of synthetic capsicin analogues with various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim.Biophys.Acta. 1273. 21-30 (1995)

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  • [文献書誌] K.Denda: "Characterization of chimeric heme-copper respiratory oxidases using subunits I of Escherichia coli cytochrome bo and Halobacterium salinarium cytochrome ca." Biochem.Biophys.Res.Commun.217. 428-436 (1995)

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  • [文献書誌] 茂木立志: "大腸菌チトクロムbo型ユビキノール酸化酵素の構造と分子生理学" 生化学. 67. 93-107 (1995)

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  • [文献書誌] H.Miyoshi: "A model of antimycin A binding based on structure-activity studies of synthetic antimycin A analogues." Biochim.Biophys.Acta. 1229. 149-154 (1995)

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  • [文献書誌] 三芳秀人: "阻害剤から見た呼吸鎖電子伝達機構" 化学と生物. 33. 151-158 (1995)

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  • [文献書誌] M.Tsubaki: "FT-IR and EPR studies on cyanide-bindings to the heme-copper binuclear center of cytochrome bo-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli : Release of Cu_B-cyano complex in the partially reduced states." J.Biol.Chem.271. 4017-4022 (1996)

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  • [文献書誌] H.Hori: "EPR and NO complex of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli. The proximal ligand of heme d is a nitrogenous amino acid residue." J.Biol.Chem.271. 9254-9258 (1996)

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  • [文献書誌] K.Saiki: "Probing a role of subunit IV of the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase by deletion and cross-linking analyses." J.Biol.Chem.271. 15336-15340 (1996)

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  • [文献書誌] K.Sakamoto: "Probing substrate binding site of the Escherichia coli quinol oxidases using synthetic ubiquinol analogues based upon their electron-donating efficiency." J.Biol.Chem.271. 29897-29902 (1996)

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  • [文献書誌] K.Sakamoto: "Comparison of the structural features of ubiquinone reduction sites between glucose dehydrogenase in Escherichia coli and bovine heart mitochondrial complex I." Eur.J.Biochem.237. 128-135 (1996)

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  • [文献書誌] C.Lim: "Phytotoxic compounds cochlioquinones are inhibitors of mitochondrial NADH-ubiquinone reductase." J.Pesticide Science. 21. 213-215 (1996)

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  • [文献書誌] H.Miyoshi: "Uncoupling mechanisms of glycoside antibiotic aculeximycin in isolated rat-liver mitochondria." J.Biochem.119. 274-280 (1996)

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  • [文献書誌] A.Yamashita: "Direct interaction between mitochondrial succinate-ubiquinone and ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase probed by inhibitor sensitivity." J.Biochem.120. 377-384 (1996)

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  • [文献書誌] T.Satoh: "Comparison of the inhibitory action of synthetic capsaicin analogues with various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim.Biophys.Acta. 1273. 21-30 (1996)

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  • [文献書誌] H.Ueno: "Structural factors of rotenone required for inhibition of various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim.Biophys.Acta. 1276. 195-202 (1996)

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  • [文献書誌] V.Yankovskaya: "Inhibitor probes of the quinone binding sites of mammalian complex II and Escherichia coli fumarate reductase." J.Biol.Chem.271. 21020-21024 (1996)

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  • [文献書誌] T.Mogi: "Molecular structure and physiology of cytochrome bo-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli" Seikagaku. 67. 93-107 (1995)

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  • [文献書誌] H.Miyoshi: "Inhibitors and respiratory electron-transport mechanism." Kagaku to Seibutsu. 33. 151-158 (1995)

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  • [文献書誌] T.Mogi: "Cu_B promotes both binding and reduction of dioxygen at the heme-copper binuclear center in the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase." FEBS Lett.370. 259-263 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Sato-Watanabe: "Stabilization of a semiquinone radical at the high affinity quinone binding site of the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase." FEBS Lett.374. 265-269 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Hirota: "Resonance Raman study on axial ligands of heme irons in cytochrome bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli." Biospectroscopy. 1. 305-311 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Tsubaki: "Cyanide-binding site of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli." J.Biol. Chem.270. 28565-28569 (1995)

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  • [文献書誌] K.Denda: "Characterization of chimeric heme-copper respiratory oxidases using subunit of Escherichia coli cytochrome bo and Halobacterium salinarium cytochrome omega_3." Biochem. Biophys. Res. Commun.217. 428-436 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Saitoh: "Comparison of the inhibitory action of synthetic capsicin analogues with various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim. Biophys. Acta. 1273. 21-30 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Miyoshi: "A model of antimycin A binding based on structure-activity studies of synthetic antimycin A analogues." Biochim. Biophys. Acta. 1229. 149-154 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Tsubaki: "FT-IR and EPR studies on cyanide-bindings to the heme-copper binuclear center of cytochrome bo-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli : Release of Cu_B-cyano complex in the partially reduced states." J.Biol. Chem.271. 4107-4022 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Hori: "EPR and NO complex of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli. The proximal ligand of heme d is a nitrogenous amino acid residue." J.Biol. Chem.271. 9254-9258 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Saiki: "Probing a role of subunit IV of the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase by deletion and cross-linking analyzes." J.Biol. Chem.271. 15336-15340 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Sakamoto: "Probing substrate binding site of the Escherichia coli quinol oxidases using synthetic ubiquinol analogues based upon their electron-donating efficiency." J.Biol. Chem.271. 29897-29902 (1996)

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  • [文献書誌] K.Sakamoto: "Comparison of the structural features of ubiquinone reduction sites between glucose dehydrotgenase in Escherichia coli and bovine heart mitochondrial complex I." Eur. J.Biochem.237. 128-135 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] C.-H.Lim: "Phytotoxic compounds cochlioquinones are inhibitors of mitochondrial NADH-ubiquinone reductase." J.Pesticide Science. 21. 213-215 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Miyoshi: "Uncoupling mechanisms of glycoside antibiotic aculeximycin in isolated rat-liver mitochondria." J.Biochem.119. 274-280 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A.Yamashita: "direct interaction between mitochondrial succinate-ubiquinone and ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase probed by inhibitor sensitivity." J.Biochem.120. 377-384 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Satoh: "Comparison of the inhibitory action of synthetic capsaicin analogues with various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim. Biophys. Acta. 1273. 21-30 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Ueno: "Structural factors of rotenone required for inhibition of various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim. Biophys. Acta. 1276. 195-202 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] V.Yankovskaya: "Inhibitor probes of the quinone binding sites of mammalian complex II and Escherichia coli fumarate reductase." J.Biol. Chem.271. 21020-21024 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Sato-Watanabe: "Cooperation of two quinone binding sites in the oxidation of substrates by cytochrome bo." Oxygen Homeostasis and ts Dynamics (ed. Y.Ishimura). Springer-Verlag, Tokyo.(in press). (1997)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Tsbaki,T.Mogi,H.Hori,M.Sato-Watanabe,and Y.Anraku: "FT-IR and EPR studies on cyanide-bindings to the heme-copper binuclear center of cytochrome bo-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli:Release of CuB-cyano complex in the partially reduced states." J.Biol.Chem. 271. 4017-4022 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] H.Hori,M.Tsubaki.T.Mogi,and Y.Anraku: "EPR and NO complex of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli. The proximal ligand of heme d is a nitrogeneous amino acid residue." J.Biol.Chem. 271. 9254-9258 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] K.Saiki,T.Mogi,and Y.Anraku: "Probingg a role of subunit IV of the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase by deletion and cross-linking analyses." J.Biol.Chem. 271. 15336-15340 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] K.Sakamoto,H.Miyoshi,K.Takegami,T.Mogi,Y.Anraku,and H.Iwamura: "Probing substrate bindings site of the Eschericia coli quinol oxidases using synthetic ubiquinol analogues based upon their electro-donating efficiency." J.Biol.Chem. 271. 29897-29902 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] K.Sakamoto,H.Miyoshi,K.Matsushita,M.Nakagawa,I.Ikeda,M.Ohshima,O.Adachi,T.Akagi,and H.Iwamura: "Comparison of the structural features of ubiquinone reduction sites between glucose dehydrogenase in Escherichia coli and bovine heart mitochondrial complex I." Eur.J.Biochem.237. 128-135 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] C.Lim,H.,H.Ueno,H.Miyoshi,H.Miyagawa,H.Iwamura,and T.Ueno: "Phytotoxic compounds cochlioquinones are inhibitors of mitochondrial NADH-ubiquinone reductase." J.Pesticide Science. 21. 213-215 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] H.Miyoshi,M.Tamaki,H.Murata,T.Ikemoto,T.Shibuya,K.I.Harada,M.Suzuki,and H.Iwamura: "Uncoupling mechanisms of glycoside antibiotic aculeximycin in isolated rat-liver mitochondria." J.Biochem.119. 274-280 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] A.Yamashita,H.Miyoshi,T.Hatano,and H.Iwamura: "Direct interaction between mitochondrial succinate-ubiquinone and ubiquinol-cytochrome c oxidoreductase probed by inhibitor sensitivity." J.Biochem.120. 377-384 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Satoh,H.Miyoshi,K.Sakamoto and H.Iwamura: "Comparison of the inhibitory action of synthetic capsaicin analogues with various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim.Biophys.Acta. 1273. 21-30 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] H.Ueno,H.Miyoshi,M.Inoue,Y.Niidome and H.Iwamura: "Structural factors of rotenone required for inhibition of various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim.Biophys.Acta. 1276. 195-202 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] V.Yankovskaya,V.,S.O.Salbin,R.R.Ramsay,T.P.Singer and H.Miyoshi: "Inhibitor probes of the quinone binding sites of mammalian complex II and Escherichia coli fumarate reductase." J.Biol.Chem. 271. 21020-21024 (1996)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] M. Sato-Watanabe: "Stabilization of a semiquinone radical at the high affinity quinone binding site of the Escherichia coil bo-type ubiquinol oxidase." FEBS Lett.374. 265-269 (1995)

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      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Y. Orii: "Facilitated intramolecular electron transfer in the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase requires chloride" Biochemistry. 34. 1127-1132 (1995)

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  • [文献書誌] T. Mogi: "CuB promotes both binding and reduction of dioxygen at the heme-copper binuclear center in the Escherichia coli bo-type ubiquinol oxidase." FEBS Lett.370. 259-263 (1995)

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      1995 実績報告書
  • [文献書誌] S. Hirota: "Resonance Raman study on axial ligands of heme irons in cytochrome bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli" Biospectroscopy. 1. 305-311 (1995)

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  • [文献書誌] M. Tsubaki: "Cyanide-binding site of bd-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli." J. Biol. Chem.270. 28565-28569 (1995)

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  • [文献書誌] M. Tsubaki: "FT-IR and EPR studies on cyanide-bindings to the heme-copper binuclear center of cytochrome bo-type ubiquinol oxidase from Escherichia coli:Release of CuB-cyano complex in the partially reduced states." J. Biol. Chem.

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  • [文献書誌] K. Denda: "Characterization of chimeric heme-copper respiratory oxidases using subunits I of Escherichia coli cytochrome bo and Halobacterium salinarium cytochrome aa_3." Biochem. Biophys. Res. Commun.217. 428-436 (1995)

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  • [文献書誌] 茂木立志: "大腸菌チトクロムbo型ユビキノール酸化酵素の構造と分子生理学" 生化学. 67. 93-107 (1995)

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  • [文献書誌] K. Sakamoto: "Comparison of the structural features of ubiquinone reduction sites between glucose dehydrogenase in Escherichia coli and bovine heart mitochondrial complex I." Eur. J. Biochem. (印刷中). (1996)

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      1995 実績報告書
  • [文献書誌] T. Saitoh: "Comparison of the inhibitory action of synthetic capsicin analogues with various NADH-ubiquinone oxidoreductases." Biochim. Biophys. Acta. (印刷中). (1995)

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  • [文献書誌] H. Miyoshi: "A model of antimycin A binding based on structure-activity studies of synthetic antimycin A analogues." Biochim. Biophys. Acta. 1229. 149-154 (1995)

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      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 三芳秀人: "阻害剤から見た呼吸鎖電子伝達機構" 化学と生物. 33. 151-158 (1995)

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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