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新規キメラ酵素作製法の開発とその応用

研究課題

研究課題/領域番号 07558224
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 機能生物化学
研究機関大阪大学

研究代表者

倉光 成紀  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60153368)

研究分担者 増井 良治  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助手 (40252580)
加藤 龍一  大阪大学, 大学院・理学研究科, 助手 (50240833)
研究期間 (年度) 1995 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
1,500千円 (直接経費: 1,500千円)
1997年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
1996年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードキメラ酵素 / キメラ遺伝子 / 相同的組換え / 蛋白質工学 / 基質認識機構 / 基質特異性 / 高度好熱菌 / Thermus thermophilus / アミノ基転移酵素 / 酵素反応機構 / 一酵素二基質 / ゆらぎ / ダイナミックス / 安定性 / アスパラギン酸アミノ基転移酵素 / 芳香族アミノ酸アミノ基転移酵素
研究概要

キメラ酵素を作製する方法には様々な方法が知られている。その中で,相同的組換え法によるキメラ作製法は,制限酵素部位やプライマーDNAを必要とせずに一連のキメラ遺伝子を作製できるという特徴がある。このキメラ酵素作製法の蛋白質工学への適用範囲を調べた。用いた遺伝子は,大腸菌アスパラギン酸アミノ基転移酵素(AspAT)と芳香族アミノ酸アミノ基転移酵素(AroAT)である。これらは,アミノ酸配列の相同性が44%,塩基配列の相同性が約50%の相同な酵素である。両酵素は,様々な相同性領域を持っているので,"相同的組換え法を利用したキメラ酵素作製法"の適用範囲を調べる系として適している。そこで,AspATをコードするaspC遺伝子とAroATをコードするtyrB遺伝子とを,プラスミド上で直列につなぎ,数百個のキメラ遺伝子を解析した。その結果,"相同的組換え法によるキメラ作製法"を利用すれば,全体の塩基配列の相同性が50%以下でも,部分的に相同性の高い箇所(10塩基中8塩基以上の相同性)があれば,キメラ遺伝子の得られることが明らかになった。さらに,この結果を基にして,制限酵素部位とは無関係に2つの遺伝子をつなぐ"Homologous Ligation法"を開発した。
得られたキメラ酵素の基質特異性を解析した結果,2つの基質結合ポケットを持ち,基質によって2つのポケットを使い分ける「1酵素-2基質」酵素の存在が明らかになった。また,疎水性基質の認識には,酵素分子の揺らぎが重要な役割をはたしていること,さらに,この揺らぎは耐熱性酵素の耐熱化と基質認識に巧妙に利用されていることなど,今まで知られていなかった酵素分子設計原理が次々と明らかになった。

報告書

(4件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (27件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (27件)

  • [文献書誌] Kawaguchi, S.,: "Enzyme Flexibility:New Concept in Recognition of Hydrophobic Substrates" J.Biochem.55. 55-63 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Putukhov, M.,: "Insights into Thermal Resistance of Proteins from Intrinsic Stability of Their α-Helices" Proteins:Structure,Function,and Genetics. 29. 309-320 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nakai, T.,: "Structural Study of Extremely Thermophilic Bacterium Aminotransferase" Protein Science. 6. 94-94 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Okamoto, A.,: "An Aspartate Aminotransferase from an Extremely Thermophilic Bacterium,Thermus thermophilus HB8" J.Biochem.119. 135-144 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 倉光 成紀: "好熱菌丸ごと一匹プロジェクト" バイオサイエンスとインダストリー. 54. 644-646 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kawaguchi, S.: "Homologous Ligation" Protein Eng.8. 965- (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 河口 真一: "シリーズ分子生物学 6.構造生物学" 朝倉書店,東京, 11 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.,: "Enzyme Flexibility:New Concept in Recognition of Hydrophobic Substrates" J.Biochem.55. 55-63 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Putukhov,M.,: "Insights into Thermal Resistance of Proteins from Intrinsic Stability of Their α-Helices" Proteins:Structure,Function,and Genetics. 29. 309-320 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.,: "New Concept of the Enzymatic Recognition of Hydrophobic Substrates" Protein Science. 6. 66-66 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Nakai,T.,: "Structural Study of Extremely Thermophilic Bacterium Aminotransferase" Protein Science. 6. 94-94 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀: "「高度好熱菌丸ごと一匹プロジェクト-基本的生命現象の系統的解析-」へ向けてのボランティア" 生産と技術. (印刷中).

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀: "アミノ基転移酵素" 朝倉書店,東京, 11 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Okamoto,A.: "An Aspartate Aminotransferase from an Extremely Thermophilic Bacterium,Thermus thermophilus HB8" J.Biochem.119・No.1. 135-144 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Takamatsu,S.: "Mismatch DNA Receognition Protein from an Extremely Thermophilic Bacterium,Thermus thermophilus HB8" Nucleic Acids Res.24・No.4. 640-648 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀: "高度好熱菌丸ごと1匹プロジェクト" バイオサイエンスとインダストリー. 54・No.9. 644-646 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.: "Broad Substrate Specificity of Aminotransferase toward Hydrophobic Substrates" Protein Eng.9・No.9. 813-813 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.: "New Concept of the Enzymatic Recognition of Hydrophobic Substrates" Protein Science. Vol.6(印刷中). (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.: "Enzyme Flexibility : New Concept in Recognition of Hydrophobic Substrates" J.Biochem.(印刷中). (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀(共著): "生化学辞典(第3版)" 東京化学同人,東京(印刷中), (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.: "Separation of Heat-Stable Proteins from Thermus thermophilus HB8 by Two-Dimensional Electrophoresis" Electophoresis. 16. 1060-1066 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kuramitsu,S.: "Database of Heat-Stable Proteins from Thermus thermophilus HB8" Protein Eng.8. 964- (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kawaguchi,S.: "Homologous Ligation" Protein Eng.8. 965- (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Okamoto,A.: "An Aspartate Aminotransferase from an Extremely Thermophilic Bacterium,Themus thermophilus HB8" J.Biochem.119. 135-144 (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Takamatsu,S.: "Mismatch DNA Recognition Protein from an Extremely Thermophilic Bacterium,Thermus thermophilus HB8" Nucleic Acids Res.24. 640-648 (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kato,R.: "ATPase Activity of UvrB Protein from Thermus thermophilus HB8,and Its Interaction with DNA" J.Biol.Chem.(in press). (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 倉光成紀: "分子生物学の展開,第6巻「アミノ基転移酵素」" 朝倉書店,東京(印刷中),

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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