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細菌アルギン酸リアーゼX線結晶構造解析と反応機構

研究課題

研究課題/領域番号 07660111
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関京都大学

研究代表者

村田 幸作  京都大学, 食糧科学研究所, 教授 (90142299)

研究分担者 三上 文三  京都大学, 食糧科学研究所, 助教授 (40135611)
研究期間 (年度) 1995 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
1996年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
1995年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
キーワード難治性細菌感染症 / 緑膿菌 / アルギン酸 / X線結晶構造解析 / アルギン酸リアーゼ
研究概要

アルギン酸は、マンヌロン酸とグルヌロン酸の2種類の糖から成る高粘性へテロ多糖であり、様々な細菌感染症の原因物質となっている。慢性炎症疾患や異物挿入などに伴う感染では、緑膿菌がアルギン酸を産生し、複雑なバイオフイルムを形成する。いわゆるバイオフィルム感染症であり、難治性である。慢性呼吸器疾患、心内膜炎、骨髄炎、尿路感染症、歯周病、皮膚感染症など医学全般に渡る。白人特有の遺伝病である嚢胞性線維性の致死性も、緑膿菌アルギンによる気道閉塞による。従って、難治性細菌感染症の効果的な治療においては、バイオフイルムを如何に処理するかが重要な問題となる。本研究は、細菌由来のアルギン酸低分子化酵素(アルギン酸リアーゼ)を利用した難治性細菌感染症治療法の開発とアルギン酸リアーゼの高次構造と反応機構の解析を目的として行い、以下の成果を得た。
(1)アルギン酸リアーゼのX線結晶構造解析(プリセッション)を行い、結晶学的定数(格子定数、空間群)を決定した。しかし、X線結晶構造解析において最も大きな問題点は、重原子置換が期待通りに行かないことにあった。水銀化合物(pCMB、メチル水銀、塩化水銀)と白金、金化合物について広範に検討したが、良好な置換体の調製は不可能であった。(2)アルギン酸リアーゼの反応機構については、活性中心のアミノ酸及びその近傍の部分的構造を明らかにした。(3)本酵素をポリエチレングリコールで化学修飾することにより、無(低)抗原性酵素を作製し、難治性細菌感染症治療に応用できることを明らかにした。(4)完全無抗原性酵素を調製するため、低分子量酵素断片を得た。(5)本酵素生産菌は、微生物史上で初めて見出された体腔(細胞表層上の穴構造)を有する細菌であることを明らかにした。(5)体腔欠損変異株の機能解析、並びに、体腔の微細(電子顕微鏡)構造と高分子資化の関係を解析し、高分子物質取り込みに関する新たな機構を提出した(平成8年度日本生物工学会論文賞受賞)。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (22件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (22件)

  • [文献書誌] 村田,幸作: "細菌の多糖リアーゼ:酵素学的、遺伝学的側面と医薬への応用" 日本応用酵素協会誌. (印刷中) (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Pit structure on bacterial cell surface" Biochemical and Biophysical Research Communication. 220. 979-982 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wataru Hashimoto: "Purification and characterization of microbial gellan lyase" Applied and Environmental Microbiology. 62(4). 1475-1477 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Direct uptake of alginate molecule through a pit on bacterial cell surface : a novel mechanism to take up macromolecules." Journal of Fermentation and Bioengineering. 79(6). 538-544 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 村田幸作: "アルギン酸分解の新しい分子機構" バイオサイエンスとインダストリー. 53(5). 36-38 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 村田幸作: "アルギン酸分解の新しい分子機構" バイオサイエンスとインダストリー. 53(5). 36-38 (1995)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Bunzo Mikami, Tomohiro Hisano, Tetsuo Yamashita, Tomoko Inose, Masahiro Takagi, Kenji Sakaguchi, Akira Kimura, Tadayuki Imanaka and Kousaku Murata: "Crystalization and Preliminary X-Ray Diffraction Studies of Bacterial Al-ginate Lyase" Journal of Fermentation and Bioengineering. 77. 691-692 (1994)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kousaku Murata: "Bacterial Polysaccharide lyases : Enzymatic and genetic aspects and its application" Japanese Society for Applied enzymology. No.31. 28-39 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Wataru Hashimoto: "Purification and characterization of microbial gellan lyase." Applied and Environmental Microbiology. Volume 62 (4). 1475-1477 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Direct uptake of alginate molecule through a pit on bacterial cell surface : a novel mechanism to take up macromolecules." Journal of Fermentation and Bioengineering. Volume 79 (6). 538-544 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Pit structure on bacterial cell surface." Biochemical and Biophysical Research Communication. Volume 220. 979-982 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kousaku Murata: "Novel mechanism for alginate depolymerization" Bioscience & Industry. Volume 53 (5). 36-38 (1996)

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    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 田村幸作: "細菌の多糖リアーゼ:酵素学的、遺伝学的側面と医薬への応用" 日本応用酵素協会誌. (印刷中). (1997)

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      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Pit structure on bacterial cell surface." Biochemical and Biophysical Research Communication. 220. 979-982 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Wataru Hashimoto: "Purification and characterization of microbial gellan lyase." Applied and Environmental Microbiology. 62(4). 1475-1477 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Direct uptake of alginate molecule through a pit on bacterial cell surface : a novel mechanism to take up macromolecules." Journal of Farmentation and Bioengineering. 79(6). 538-544 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 村田幸作: "アルギン酸分解の新しい分子機構。" バイオサイエンスとインダストリー. 53(5). 36-38 (1995)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 村田幸作: "細菌多糖リアーゼのバイオフィルム感染症治療への応用" 平成8年度厚生省特定疾患調査研究班. (印刷中). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 村田幸作: "アルギン酸分解の新しい分子機構" バイオサイエンスとインダストリー. 53. 36-38 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Mikami Bunzo: "Crystalization and Preliminary X-Ray Diffraction Studies of Bacterial Alginate Lyase" Journal of Fermentation and Bioengineering. 77. 691-692 (1994)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 村田幸作: "細菌によるアルギン酸分解の分子機構とバイオフイルム" Bulletin of the Research Institute for Food Science, Kyoto University. 58. 32-33 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Tomohiro Hisano: "Pit Structure on Bacterial Cell Surface" Biochemical and Biophysical Research Communications. (in press). (1996)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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