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キャピタリー電気泳動とPCRを組み合わせた遺伝子診断法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 07672326
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理系薬学
研究機関昭和大学

研究代表者

荒川 秀俊  昭和大学, 薬学部, 助教授 (70129807)

研究分担者 前田 昌子  昭和大学, 薬学部, 教授 (00053869)
研究期間 (年度) 1995 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
1996年度: 800千円 (直接経費: 800千円)
1995年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードキャピラリー電気泳動 / 遺伝子診断 / PCR / 二本鎖DNA / 一本鎖DNA高次構造多型 / 日本鎖DNA / 2本鎖DNA
研究概要

本研究により次のような成果がえられた。ポリマー溶液及びキャピラリーゲル電気泳動による二本鎖DNA(72〜1300bp)及びPCR生成物(70〜500bp相当)の分離系を確立し、PCR生成物を精製することなく直接分析することを可能にした。さらに高感度検出を可能にするためレーザー蛍光検出によるフェニルケトン尿症及び中鎖アシルCoA脱水素酵素欠損症のAllele Specific Polymerase chain reaction並びにPCR-Restriction fragment length polymorphismの分析を行った。次に高分解能キャピラリーゲル電気泳動による一本鎖高次構造多型(SSCP)検出法の開発を行った。電気泳動条件、PCR生成物の塩基数について検討した。その結果、ゲル濃度8%、分離温度25℃、PCR生成物の塩基の長さ59塩基から359塩基で、一塩基変異からなる癌遺伝子のSSCP解析が可能になった。
実際の臨床検体においては、ヒト遺伝子を対象とするため高感度化が必要不可欠である。また、SSCP解析では二本鎖DNAから二本以上の一方差DNAの多型が検出されるため、泳動パターンは複雑になる。そこでSSCPの高感度化と選択性の向上化について検討した。PCRにより増幅と蛍光(テキサスレッド)標識を行う。このものを一本鎖に解離後、He-Neレザー蛍光検出装置を備えたキャピラリー電気泳動装置により解析した。その結果K-ras遺伝子の7つの変異を容易に検出することができた。本法は260nmでのUV検出より1000倍以上高感度であった。さらに本研究では一度に多数の分析を可能にするため、レーザー蛍光検出とマルチキャピラリー(20本のキャピラリーを用いて20検体を同時分析)による方法を開発した。この方法は多検体分析を必要とする臨床診断法として有用である。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (15件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (15件)

  • [文献書誌] 荒川秀俊: "キャピラリー電気泳動によるPCR生成物の解析" 生物物理化学. 39. 355-361 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "Analysis of single strand conformation polymorphism by capillary electrophoresis" Journal of chromatography. 722. 359-368 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "Analysis of Single-Strand Conformation Polymorphisms by Capillary Electrophoresis with Laster Induced Fluorescence Detection" J.Pharm.Biomed.Anal. (in press). (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "デキストラン硫酸を分離増強剤とするキャピラリー電気泳動による二本鎖DNAの分離" 分析化学. (in press). (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hidetoshi Arakawa: "Analysis of polymerase chain reaction product by capillary electrophoresis and its application to the detection of single base substitution in genes" J.Chromatogr. 664. 89-98 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hidetoshi Arakawa: "Analysis of polymerase chain reaction-product by capillary electrophoresis with laser induced fluoresence detection and its application to the diagnosis of Medium-chain alyl-Coenzyme A dehydrogenase deficiency" J.Chromatogr.A. 680. 517-523 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akio Tsuji: "Rcent Advances of Chemiluminescent and Bioluminescent Assay" Jpn J.Electroph. 39. 301-309 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hidetoshi Arakawa: "Analysis of polymerase chain reaction-product by capillary electrophoresis" Jpn J.Electroph. 39. 355-361 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hidetoshi Arakawa: "Analysis of Single-Strand DNA Conformation Polymorphism by Capillary Electrophoresis" J.Chromatogr A. 722. 359-368 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hidetoshi Arakawal: "Analysis of Single-Strand Conformation Polymorphisms by Capillary Electrophoresis with Laser Induced Fluoresence Detection" J.Pharm.Biomed.Anal. (in press). (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hidetoshi Arakawa: "Enhanced resolution in capillary electrophoresis separation of double strand DNA using dextran sulfate"

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "Analysis of Single-Strand Conformation Polymorphisms by Capillary Electrophoresis with Laser Induced Fluorescence Detection" J. Pharm.Biomed.Anal.(in press). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "デキストラン硫酸を分離増強剤とするキャピラリー電気泳動による二本鎖DNAの分離" 分析化学. (in press). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "キャピラリー電気泳動によるPCR生成物の解析" 生物物理化学. 39. 355-361 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 荒川秀俊: "Analysis of single strand conformation polymorphism by capillary electrophoresis" Journal of Chromatography A. 722. 359-368 (19965)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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