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塩基損傷を含むDNAのミクロ構造変化と遺伝子機能への影響

研究課題

研究課題/領域番号 07680740
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関広島大学 (1996)
京都工芸繊維大学 (1995)

研究代表者

井出 博  広島大学, 理学部, 教授 (30223126)

研究期間 (年度) 1995 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
1996年度: 500千円 (直接経費: 500千円)
1995年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
キーワードDNA損傷 / 構造変化 / 熱力学的安定性 / DNAポリメラーゼ / 突然変異 / オリゴヌクレオチド / α-デオキシアデノシン / アベイシックサイト / 核酸構造
研究概要

DNAは生体の一次遺伝情報を担う分子であるため、その損傷は突然変異やDNA合成阻害を引き起こし、細胞死や発癌が起こることが明かにされている。本研究では、損傷に起因するDNAのミクロ構造変化とその突然変異性・DNA合成阻害効果の関連を分子レベルで解明することを目的に以下の研究を行った。、
1.ミクロ構造変化を誘発するDNA損傷の同定に関しては、γ線及びセカンドメッセンジャーとして注目されている一酸化窒素(NO)によるDNA損傷を検討した。前者では、グアニンとアミノ酸(セリン)のアダクト、また、後者では、オキザノシンが生成することを明らかにした。
2.紫外融解曲線とCDスペクトルの測定に基づき、abasic site及びα-deoxyadenosine(α)を含む二重鎖DNAの熱力学的安定性と構造を検討した。さらに、αを含む二重鎖DNAついては分子力場計算により、構造モデルを構築した。その結果、abasic siteはDNAを局所的に不安定化させ構造を著しく変化させるのに対し、αの場合は、対合する塩基の種類によりDNAの安定性及び構造が異なることが明らかとなった。以上の結果は、次の3に述べるDNA損傷に対するDNAポリメラーゼの挙動と密接な関連があることが示された。
3.α及びabasic siteを導入したオリゴヌクレオチドをM13ベクターに組み込み、大腸菌にトランスフェクションし、得られたprogeny phageのトランスフェクション効率とシーケンスの解析を行った。αを含むM13ベクターのトランスフェクション効率は、正常なadenineを同じ位置に含むベクターのの約20%であった。この結果は、αが、正常な塩基と強いDNA合成阻害効果を示すabasic siteの中間の複製阻害効果をもつことを示している。また、シーケンスの解析の結果、abasic siteは主に塩基置換を誘発するのに対し、αは選択的に一塩基欠失を誘発し、その頻度は塩基配列に依存することが明らかとなった。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (19件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (19件)

  • [文献書誌] Ide,H.: "On the mechanism of preferential incorporaton of dAMP at abasic Sites in translesional DNA synthesis" Nucleic Acids Research. 23. 123-129 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide,H.: "Influences of α-deoxyadenosine on the stability and structure of DNA. Thermodynamic and molecular mechanics studies" Biochemistry. 34. 6947-6955 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki,T.: "Isolation and characterization of a novel product,2'-deoxyoxanosine,from 2'-dexyguanosine,oligonucleotide,and calf thymus DNA treated by nitrous acid and nitric oxide" Journal of American Chemical Society. 118. 2515-25 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Terato,H.: "Highly fluorescent product in the gamma-ray induced reaction between 2'-deoxyguanosine and serine" Nucleic Acids Research Symposium Series. 35. 241-242 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shimizu,H.: "Replication bypass and mutagenic effect of α-deoxyadenosine site-specifically incorporated into single-stranded vectors" Nucleic Acids Research. 25. 597-603 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide,H.: "Antibodies to oxidative DNA damages : Characterization of antibodies to 8-oxopurines" Cell Biology and Toxicology. (印刷中). (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide, H., Murayama, H., Sakamoto, S., Makino, K., Honda, K., Nakamuta, H., Sakai, M., and Sugimoto, N.: "On the Mechanism of Preferential Incorporation of dAMP at Abasic Sites in Translesional DNA Synthesis. Role of Proofreading Activity of DNA Polymerase and Thermodynamic Characterization of Model Template-Primers Containing Abasic Site." Nucleic Acids Res.23. 123-129 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide, H., Shimizu, H., Kimura, Y., Sakamoto, S., Makino, K., Glackin, M., Wallace, S.S., Nakamuta, H., Sakaki, M.and Sugimoto, N.: "Influences of alpha-Deoxyadenosine on the Stability and Structure of DNA.Thermodynamic and Molecular Mechanics Studies." Biochemistry. 34. 6947-6955 (1995)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T., Yamaoka, R., Nishi, M., Ide, H.and Makino, K.: "Isolation and Characterization of a Novel Product, 2'-Deoxyoxanosine, from 2'-Deoxyguanosine, Oligonucleotide, and Calf Thymus DNA Treated by Nitrous Acid and Nitric Acid." J.Am.Chem.Soc.118. 2515-2516 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Terato, H., Yoshimura, M., Ohyama, Y., Ide, H,and Yamamoto, O.: "Highly Fluorescent Product in the Gamma-Ray Induced Reaction between 2'-Deoxyguanosine and Serine." Nucleic Acids Res.Symp.Ser.35. 241-242 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shimizu, H., Yagi, R., Kimura, Y., Makino, K.and Ide, H.: "Replication Bypass and Mutagenic Effect of alpha-Deoxyadenosine Site-Specifically Incorporated into Single-Stranded Vector." Nucleic Acids Res.25. 597-603 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide, H., Kow, Y.W., Chen, B., Erlanger B.F.and Wallace S.S.: "Antibodies to Oxidative DNA Damages : Characterization of Antibodies to 8-Oxopurines." Cell Biol.and Toxicol.(in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T.: "Isolation and characterization of a novel product, 2′-deoxyoxanisine, from 2′-deoxyguanosine, oligonucleotide, and calf thymus DNA treated by nitrous acid and nitric oxide" Journal of American Chemical Society. 118. 2515-2516 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshida, M.: "Preparation and characterization of DNA containing 5-formyluracil" Nucleic Acids Research Symposium Series. 35. 239-240 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Terato, H.: "Highly fluorescent product in the gamma-ray induced reaction between 2′-deoxyguanosine and serine" Nucleic Acids Research Symposium Series. 35. 241-242 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Shimizu, H.: "Replication bypass and mutagenic effect of α-deoxyadenosine site-specificallt incorporated into single-stranded vectors" Nucleic Acids Research. 25. 597-603 (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshida, M.: "Substrate and mispairing properties of 5-formyl-2′-deoxyuridine 5′-triphosphate assessed by in vitro DNA polymerase reactions" Nucleic Acids Research. (印刷中). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Ide, H.: "Antibodies to oxidative DNA damages : characterization of antibodies to 8-oxopurines" Cell Biology and Toxicology. (印刷中). (1997)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroshi Ide: "Structure and stability of DNA containing α-deoxyadenosine" Nucleic Acids Res.Sym.Ser.34. 81-82 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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