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FISH法を用いた実験動物のゲノム解析技術の開発と比較ゲノム地図の作製

研究課題

研究課題/領域番号 07680926
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 実験動物学
研究機関名古屋大学 (1996)
放射線医学総合研究所 (1995)

研究代表者

松田 洋一  名古屋大学, 農学部, 助教授 (70165835)

研究期間 (年度) 1995 – 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
1996年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1995年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワードFISH / cDNA / 染色体マッピング / 染色体地図 / マウス / ラット / ハムスター / スンクス / 遺伝子マッピング / R-バンディング / DNAクローン / シリアンハムスター
研究概要

昨年度までにすでに完成し、実用段階に達した齧歯類染色体のダイレクトR-バンディングFISH法を用いて、マウス、ラット、ハムスターの機能遺伝子の染色体マッピングを行った。この二年間にマッピングされた機能遺伝子の総数は、マウス、ラット、ハムスターでそれぞれ、121、70、46遺伝子であり、ダイレクトR-バンディングFISH法を用いることによって極めて迅速に染色体マッピングを行うことが出来た。マウスcDNAクローンを用いた異種間の染色体マッピング効率は、マウス-ラット間で98%以上、マウス-シリアンハムスター間で91%以上と非常に高く、マウスcDNAクローンがラット、ハムスター染色体へのFISHマッピングに非常に有用であることが判明した。本研究によって、未だ機能遺伝子の染色体地図が存在しないシリアンハムスターにおいて、マウス染色体との間に16の染色体相同領域が同定され、FISH法が実験動物の比較染色体地図の作製に非常に有用であることが示された。また、本研究でラット染色体上にマップされた機能遺伝子の数(70)は、1994年度までにマップされたラット遺伝子の総数169の約2.5分の1という迅速さであった。
さらに、新たに食虫類に属するスンクス(Suncus murinus)においてもダイレクトR-バンディングFISH法による高精度染色体マッピングシステムの確立を試みた。その結果、スンクスにおいても良好なreplicatio R-bandが得られ、ヒト、マウス、ラットのcDNAクローンを用いて、機能遺伝子を直接スンクス染色体にFISH法でマッピング出来たことから、今後は、この方法を用いて、スンクスにおいても機能遺伝子の染色体地図が迅速に作製されていくものと思われる。

報告書

(3件)
  • 1996 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1995 実績報告書
  • 研究成果

    (36件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (36件)

  • [文献書誌] Suzuki, H., Sakurai, S. & Matsuda, Y.: "Rat 5S rDNA spacer sequences and chromosomal assignment of the gene to the extreme terminal region of chromosome 19" Cytogenetics and Cell Gentics. 72. 1-4 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y. et al: "Chromosome mapping of human (ZNF179), mouse and rat genes for brain finger protein (bfp), a member of the RING finger protein" Genomics. 33. 325-327 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y. et al: "Comparative genome mapping of ataxia telangiectasia region in the mouse, rat and hamster" Genomics. 34. 347-352 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y. et al: "Comparative mapping of the reeler gene on human chromosome 7q22, rat chromosome 4q11.2 and mouse chromosome 5A3-B1" Mammalian Genome. 7. 468-469 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y. et al: "Chromosomal assignment of the Bdl2-related genes, Bcl2l abd Bax, in the mouse and rat" Cytogenetics and Cell Genetics. 74. 107-110 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takada S., Okazaki, Y. & Matsuda, Y.: "Exclusion of candidate genes for hamster cardiomyopathy by FISH analysis" DNA Research. 3. 273-276 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 松田洋一(分担): "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術第3版」" 朝倉書店, 11 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y.and Chapman, V.M.: "Application of fluorescence in situ hybridization in genome analysis of the mouse." Electrophoresis. 16. 261-272 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Harada, Y,-N., Matsuda, Y.Shiomi, N.and Shiomi, T.: "Complementary DNA sequence and chromosomal localization of xpg, the mouse counterpart of human repair gene XPG/ERCC5." Genomics. 28. 59-65 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Honma, N., Matsuda, Y.Ishii, Y., Sato, M., Tomura, T., et al: "Molecular cloning and chromosomal localization of the mouse glycosylation inhibiting factor gene and four homologous genes." Mammal.Genome. 7. 51-59 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, H., Sakurai, S.and Matsuda, Y.: "Rat 5S rDNA spacer sequences and chromosomal assignment of the gene to the extreme terminal region of chromscome 19." Cytogenet.Cell Gent.72. 1-4 (1995)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Nara, K., Watanabe, Y., Saito, T.and Sanai, Y.: "Chromosome mapping of the GD3 synthase gene in man and mouse." Genomics. 32. 137-139 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Inoue, S., Seki, N., Hosoi, T., Orimo, A., et al.: "Chromosome mapping of human(ZNF179), mouse and rat genes for brain finger protein(bfp), a member of the RING finger protein." Genomics. 39. 325-327 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Takahara, T., Kusakabe, M.and Hayashizaki, Y.: "Comparative mapping of the reeler gene on human chromosome 7q22, rat chromosome 4q11.2 and mouse chromosome 5A3-B1." Mammal.Genome. 7. 468-469 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Imai, T., Shiomi, T., Saito, T., Yamauchi.W., et al.: "Comparative genome mapping of ataxia telangiectasia region in the mouse, rat and hamster." Genomics.34. 347-352 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Enomoto, H., Saito, T.and Sakiyama, S.: "Chromosome mapping of the mouse and rat homologs of the human DAN gene, DlSl733E." Mammal.Genome. 7. 709-710 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Kusano, H.and Tsujimoto, Y.: "Chromosomal aasignment of the Bc12-related genes, Bcl2l abd Bax, in the mouse and rat." Cytogenet.Cell Genet.74. 107-110 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takada, S., Okazaki, Y., Kamiya, M., Ohsumi, T.and Matsuda, Y.: "Five candidate genes for hamster cardiomyopathy did not map to the cardiomyopathy locus by FISH analysis." DNA Research. 3. 273-276 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Hamatani, K., Itoh, M., Takahashi, E., Araki, R.and Abe, M.: "Localization of the importin-beta gene to mouse chromosome 11D and rat chromosome 10q32.1" Genomics. 36. 213-215 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Akao, Y.and Matsuda, Y.: "Identification and chromosome mapping of the mouse homologue of the human gene (DDX6) that encodes a putative RNA helicase of the DEAD box proteinfamily." Cytogenet. Cell Genet.75. 38-44 (1996)

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Saito, T., Fujimoto, J.and Yamamoto, T.: "Chrmosomal mapping of the mouse and rat brt genes." Genomics. (in press).

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      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, Y., Hori, T.and Morita, T.: "Chrmosome mapping of the mouse homologues of DMCl, the yeast meiosis-specific homologous recombination gene." Chromosome Res.(in press).

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    • 関連する報告書
      1996 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki,H.,Sakurai,S.& Matsuda,Y.: "Rat 5S rDNA spacer sequences and chromosomal assignment of the gene to the extreme terminal region of chromosome 19" Cytogenetics and Cell Gentics. 72. 1-4 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuda,Y.et al: "Chromosome mapping of human (ZNF179),mouse and rat genes for brain finger protein (bfp),a member of the RING finger protein" Genomics. 33. 325-327 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuda,Y.et al: "Comparative genome mapping of ataxia telangiectasia region in the mouse,rat and hamster" Genomics. 34. 347-352 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuda,Y.et al: "Comparative mapping of the reeler gene on human chromosome 7q22,rat chromosome 4q11.2 and mouse chromosome 5A3-B1" Mammalian Genome. 7. 468-469 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuda,Y.et al: "Chromosomal assignment of the Bc12-related genes,Bcl2l abd Bax,in the mouse and rat" Cytogenetics and Cell Genetics. 74. 107-110 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Takada S.,Okazaki,Y.& Matsuda,Y.: "Exclusion of candidate genes for hamster cardiomyopathy by FISH analysis" DNA Research. 3. 273-276 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 松田洋一(分担): "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術 第3版」" 朝倉書店, 11 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Matsuda, Y. and Chapman, V. M.: "Application of fluorescence in situ hybridization in genome analysis of the mouse." Electrophoresis. 16. 261-272 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Yen,C. -H., Matsuda, Y. et al.: "A genomic clone containing a telomere array maps near the centromere of mouse Chrmosome6." Mammalian Genome. 6. 96-102 (1955)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Shimokawa, N., Matsuda, Y. and Yamaguchi,M.: "Genomic cloning and chromosomal assignment of rat regucalcin gene." Molecular and Cellular Biochemistry. 151. 57-163 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Harada, Y. -N., Matsuda, Y., Shiomi, N. and Shiomi, T.: "Complementary DNA sequence and chromosomal localization of xpg, the mouse counterpart of human repair gene XPG/ERCC5." Genomics. 28. 57-65 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] lnoue, S., Orimo, A., Matsuda,Y.,et al.: "Chromosomal mappings of human and mouse genes for estrogen-responsive finger protein (efp), a member of RING finger family." Genomics. 25. 581-583 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] Kaul, S.c., Wadhwa, R., Matsuda,Y. et al.: "Mouse and human chromosomal assignments of mortalin, a novel member of the murine hsp70 family of proteins." FEBS Letters. 361. 269-272 (1995)

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書
  • [文献書誌] 松田洋一: "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術 第3版」" 朝倉書店(印刷中),

    • 関連する報告書
      1995 実績報告書

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公開日: 1995-04-01   更新日: 2016-04-21  

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