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マウスIL-12p40及びp35のcDNAをプローブに用いマウス(129/Sv)肝臓由来のGenomicライブラリーをスクリーニングした結果、それぞれ全長の遺伝子を含むGenomicクローンを得た。FISH(Fluoresence in situ Hybridization)、PCR、Southern Blot Hybridization、Sequencing等を用いた手法によりそれら遺伝子構造を解析した結果、p40遺伝子は第11染色体5A-B2に位置し約14kbにわたり8つのエキソンと7つのイントロンからなり、また、p35遺伝子は第6染色体Cに位置し約8kbにわたり7つのエキソンと6つのイントロンからなることが明らかとなった。Primer Extention法を用いた解析により、p40の5'上流領域には転写開始点が1つ存在しさらに上流にはTATA及びCAAT Boxがあるが、p35の5'上流領域には複数の転写開始点が存在しTATA Boxはなく、両者のプロモーター領域はかなり異なることが示され、これらの違いがそれぞれの発現様式の違いを裏付けることが示唆された。さらに、各々のプロモーター領域のCAT (Chloramphenycol Acetyltansferase) Constructを作製し、p40の場合はマウスマクロファージ様細胞RAW264にトランスフェクト後LPSで刺激し、p35の場合はマウスBリンパ腫瘍細胞A20.2JにトランスフェクトしCAT活性を測定することにより、プロモーター活性を有することを確かめた。
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