研究課題/領域番号 |
07F07732
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研究種目 |
特別研究員奨励費
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配分区分 | 補助金 |
応募区分 | 外国 |
研究分野 |
分子生物学
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研究機関 | 大阪大学 |
研究代表者 |
米崎 哲朗 大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授
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研究分担者 |
LEMIRE Sebastien 大阪大学, 大学院・理学研究科, 外国人特別研究員
SEBASTIEN Lemire 大阪大学, 大学院・理学研究科, 外国人特別研究員
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研究期間 (年度) |
2007 – 2008
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研究課題ステータス |
完了 (2008年度)
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配分額 *注記 |
2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
2008年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
2007年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
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キーワード | RNase LS / エンドリボヌクレアーゼ / rn1A / rn1B / dmd / 大腸菌 / T4ファージ / rnlA / rnlB |
研究概要 |
大腸菌K12株のrn1Aとrn1Bこ相同な遺伝子として、大腸菌0157株のプラスミドpOSAK1に存在する1soAと1soBをクローン化してK12株のΔrn1AB変異体に導入したところ、野生型と同様にT4ファージdmd変異体の増殖を阻害した。したがって、1soAと1soBはrn1Aとrn1Bの機能ホモログであることが判明した。同様に、発光バクテリアが有するrn1Aとrn1Bの本目同遺伝子もクローン化したが、dmd変異体の増殖阻害活性は示さなかった。発光バクテリアの増殖は10〜20℃か至適であるので、相同遺伝子がコードするタンパク質は大腸菌の生育温度30〜37℃で失活している可能性が考えられる。 RNase LSとdmdの関係のように、T4ファージファミリーの宿主特異性を決定する仕組みをさらに深く探索するために、Tulouse大学に保管されているT4ファージファミリーコレクションについてdmd領域の塩基配列解析を行ったところ、いくつかのものはdmd様遺伝子をもたないにも関わらずK12株で増殖可能であることがわかった。そこで、相補性テストによってDmdの機能ホモログを探索したが検出できなかった。このことはDmdのようなトランス因子が関与しないRNase LS活性調節機構の存在を示唆する。 T4ファージファミリー宿主特異性という観点において過去70年間の研究歴史で見落とされていた事実を発見した。T6ファージは同じK12株で共に野生型として利用されているMG1655では増殖可能であるのに、W3110では増殖できない。その理由は大腸菌表層に存在するT6の吸着タンパクTsxがW3110では殆ど発現していないためであった。発現の違いをもたらす原因は転写因子Crpが両株間で1アミノ酸置換しているためであることが示唆された。
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