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セリウム触媒を利用した人工制限酵素の高機能化および遺伝子操作への応用

研究課題

研究課題/領域番号 07J03030
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 生体関連化学
研究機関東京大学

研究代表者

愛場 雄一郎  東京大学, 大学院・工学系研究科, 特別研究員(DC1) (10581085)

研究期間 (年度) 2007 – 2009
研究課題ステータス 完了 (2009年度)
配分額 *注記
2,700千円 (直接経費: 2,700千円)
2009年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2008年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2007年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワードDNA / セリウム(IV) / 位置選択的切断 / 遺伝子組換え / 制限酵素 / PNA / 加水分解 / セシウム(IV)
研究概要

遺伝子組換え技術は、遺伝子の本体であるDNAを位置選択的に切断し、他の遺伝子と連結することで達成される。しかし、DNA切断に用いられる天然制限酵素は、切断位置が限定されたり、選択性が不十分であったりと、ゲノムなどの巨大DNAを扱うツールとしては不十分であった。これに対し我々は、DNA加水分解触媒Ce(IV)/EDTAとPNA(ペプチド核酸)を併用し、天然を超える高い位置特異性と自由度を有した人工制限酵素の構築を行ってきた。
本研究では、さらに高度な遺伝子操作に向けた汎用的なツールとして完成させるべく、切断効率・選択性をより向上させた次世代の人工制限酵素の構築を目指した。今年度は、DNA配列認識部位であるPNAにリンカーを導入し、その認識能が配列全体として向上していることを明らかにした(投稿作業中)。さらに本系を発展させ、機能性リンカーを用いたPNAへの新機能付与にも成功した(論文1、2)。また、EDTP配位子とCeとの相互作用を利用して切断効率の大幅な向上に成功し、その切断機構の解明も行った(論文3)。
現在は、PNAへの配位子修飾へと展開が行われている。EDTP以外にもCeとの強い相互作用を示すポリアミン系錯体のPNA導入に成功し、切断の高効率化が確認されており、今後のさらなる展開が期待される。
上記の結果はいずれも、本系を次世代の遺伝子操作ツールとして今後展開していく上で非常に重要な知見である。巨大DNAを対象とし長鎖PNAを用いる場合では、複数のリンカーを導入してミスマッチ識別能を向上させたり、EDTPなどの配位子を修飾したPNAを用いたりすることで、さらなる切断効率の向上が期待される。このように本人工制限酵素をさらに発展させ、より高い活性・選択性でDNAを位置選択的に切断する技術が確立されることで、従来は達成が困難であった遺伝子操作などへの応用が期待される。

報告書

(3件)
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 2007 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2010 2009 2008 2007 その他

すべて 雑誌論文 (8件) (うち査読あり 7件) 学会発表 (11件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Oxidation of Oligonucleotide-bound CeIII/Multiphosphonate Complex for Site-Selective DNA Scission2010

    • 著者名/発表者名
      T.Lonnberg, Y.Aiba, Y.Hamano, Y.Miyajima, J.Sumaoka, M.Komiyama
    • 雑誌名

      Chemistry-A European Journal 16

      ページ: 855-859

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Chemical and enzymatic stability of amino acid derived phosphoramidates of antiviral nucleoside 5'-monophosphates bearing a biodegradable protecting group2010

    • 著者名/発表者名
      A.Leisvuori, Y.Aiba, T.Lonnberg, P.Poijarvi-Virta, L.Blatt, L.Beigelman, H.Lonnberg
    • 雑誌名

      Organic & Biomolecular Chemistry (掲載確定, In press)

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Handy and Prompt DNA Separation Using PNA with Internal Disulfide Bond2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Aiba, M.Komiyama
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp.Ser. 53

      ページ: 175-176

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Introduction of Disulfide Bond to the Main Chain of PNA to Switch Its Hybridization and Invasion Activity2009

    • 著者名/発表者名
      Y.Aiba, M.Komiyama
    • 雑誌名

      Organic & Biomolecular Chemistry 7

      ページ: 5078-5083

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Introduction of linkers into PNA for versatile applications2008

    • 著者名/発表者名
      Y. Aiba, M. Komiyama
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp. Ser. 52

      ページ: 143-144

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Solid-phase synthesis of pseudo-complementary peptide nucleic acids2008

    • 著者名/発表者名
      Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Nature Protocols 3

      ページ: 646-654

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Artificial restriction DNA cutter for site-selective scission of doqble-stranded DNA with tunable scission-site and specificity2008

    • 著者名/発表者名
      Makoto Komiyama
    • 雑誌名

      Nature Protocols 3

      ページ: 655-662

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] スーパー制限酵素ARCUTによる新規遺伝子操作法の開発2007

    • 著者名/発表者名
      愛場 雄一郎
    • 雑誌名

      細胞工学 26

      ページ: 1296-1302

    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] リン酸系配位子による人工DNAカッターARCUTの高効率化2009

    • 著者名/発表者名
      愛場雄一郎・小宮山眞
    • 学会等名
      The 6th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry, 2009
    • 発表場所
      Gifu, Japan
    • 年月日
      2009-09-28
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] リン酸系配位子による人工DNAカッターARCUTの高効率化2009

    • 著者名/発表者名
      愛場雄一郎・濱野悠也・河邉明博・鈴木裕太・Tuomas Lonnberg・徐岩・須磨岡淳・小宮山眞
    • 学会等名
      第19回バイオ・高分子シンポジウム
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2009-07-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ジスルフィド結合を導入したPNAによるDNAの認識とその制御2009

    • 著者名/発表者名
      愛場雄一郎, 小宮山眞
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      日本大学
    • 年月日
      2009-03-27
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Novel functionalization of PNA by using linkers for versatile applications2009

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Aiba, Makoto Komiyam
    • 学会等名
      U-Tokyo/Yonsei U GCOE Joint Symposium "Chemistry Innovation"
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2009-01-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Novel modification of Peptide Nucleic Acid(PNA)by functional linkers for versatile applications2009

    • 著者名/発表者名
      愛場雄一郎・小宮山眞
    • 学会等名
      2nd Switzerland-Japan Biomolecular Chemistry Symposium 2009
    • 発表場所
      Tokyo, Japan
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] ジスルフィド結合導入PNAによるインベージョンとその制御2008

    • 著者名/発表者名
      愛場雄一郎, 須磨岡淳, 小宮山眞
    • 学会等名
      第3回バイオ関連化学合同シンポジウム2008
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2008-09-19
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Introduction of linkers into PNA for versatile applications2008

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Aiba, Makoto Komiyama
    • 学会等名
      Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids and 35th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • 発表場所
      京都大学
    • 年月日
      2008-09-09
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] リン酸系配位子導入によるDNA位置選択的切断の高率化と遺伝子操作2008

    • 著者名/発表者名
      愛場雄一郎, Tuomas Lonnberg, 鈴木裕太, 小宮山眞
    • 学会等名
      生体機能関連化学若手の会サマースクール
    • 発表場所
      宮城県
    • 年月日
      2008-08-06
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] リン酸系配位子導入によるDNA切断の効率化とその応用2008

    • 著者名/発表者名
      愛場 雄一郎
    • 学会等名
      日本化学会第89春季年会
    • 発表場所
      立教大学
    • 年月日
      2008-03-29
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Ce(IV)/EDTAとpcPNAを用いた2本鎖DNAの位置選択的切断2007

    • 著者名/発表者名
      愛場 雄一郎
    • 学会等名
      東京大学生命科学研究ネットワークシンポジウム2007
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2007-09-15
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [学会発表] Rapid site-selective hydrolysis of double-stranded DNA by use of Ce(IV)/EDTA and PNA bearing phosphate group2007

    • 著者名/発表者名
      Yuichiro Aiba
    • 学会等名
      International Symposium Series of NanoBio Molecular Assemblies, Yonsei University-The University of Tokyo Joint Symposium
    • 発表場所
      Yonsei University(韓国)
    • 年月日
      2007-09-07
    • 関連する報告書
      2007 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.mkomi.rcast.u-tokyo.ac.jp/member/aiba.html

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

URL: 

公開日: 2007-04-01   更新日: 2024-03-26  

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