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二成分制御系タンパクとシグマ因子による遺伝子発現調節機構

研究課題

研究課題/領域番号 08454245
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 遺伝
研究機関大阪大学

研究代表者

牧野 耕三  大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (20181620)

研究期間 (年度) 1996 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
7,600千円 (直接経費: 7,600千円)
1997年度: 3,600千円 (直接経費: 3,600千円)
1996年度: 4,000千円 (直接経費: 4,000千円)
キーワード二成分制御系 / PhoB / シグマ因子 / RNAポリメラーゼ / 細胞周期 / ストレス応答 / rpoS / DNA結合 / 転写活性化因子 / リン酸レギュロン / リン酸ボックス / σ^<70>サブユニット / PCRmutagenesis
研究概要

本研究期間中に得られた重要な成果を以下に要約する。
1.二成分制御系タンパク質であるPhoBに着目し、その分子構造を明らかにした。特にRNAポリメラーゼとの相互作用に使われる領域ならびにDNA結合に使われる領域を明らかにした。
2.PhoBのDNA結合ドメインがヘリックス・ターン・ヘリックス構造であり、アミノ酸配列から共通性がないが、多くのヘリックス・ターン・ヘリックス構造を有するDNA結合タンパクと類似性があることを明らかにした。
3.大腸菌全ゲノムのDNA構造をシステマティクな方法を用い明らかにし、そのデータを基にしてゲノム中に存在する二成分制御系に属する遺伝子の検索をおこない、新たな二成分制御系遺伝子を同定した。
4.二成分制御系タンパク質の存在が報告されていない分裂酵母を研究の対象に選び、この生物において二成分制御系の存在をはじめて明らかにした。分裂酵母においては二成分制御系はMAPキナーゼの上流に位置しており、細胞周期やストレス応答に重要な役割をはたしていることが判明した。
5.コレラ菌の病原性に関係があると考えられるRNAポリメラーゼのシグマサブユニット・σ38(RpoS)のクローニングに成功し、その構造と機能の解析をおこなった。
以上のように本研究はこの2年間に一応の目的に達成し、その経過を9編の論文に収めることができた。

報告書

(3件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 研究成果

    (30件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (30件)

  • [文献書誌] Makino, K.: "DNA binding of PhoB and its interaction with RNA polymerase." J.Mol.Biol.259. 15-26 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Oshima, T.: "A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 12.7-28.0 min region on the linkage map." DNA Res.3. 211-223 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, M.: "Multi-helical DNA-binding domains:their structures and modes of DNA-binding." Adv.Biophys.32. 31-52 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shieh J.-C.: "The Mcs4 response regulator coordinately controls the stress-activated Wak1-Wis1-Sty1 MAP kinase pathway and fission yeast cell cycle." Genes.Dev.11. 1008-1022 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiratsu K.: "Molecular cloning and functional analysis of an rpoS homologue gene from Vibrio cholerae N86." Genes Genet.Syst.72. 115-118 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamamoto, Y.: "A 800 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 50.1-68.0 min region on the linkage map." DNA Res.4. 91-113 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 牧野 耕三: "癌研究法ハンドブック" 中外医学社(in press),

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makino K., M.Amemura, T.Kawamoto, S.Kimura, H.Shinagawa, A.Nakata and M.Suzuki.: "DNA binding of PhoB and its interaction with RNA polymerase." J.Mol.Biol.259. 15-26 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Oshima T., H.Aiba, T.Baba, T.Fujita, K.Hayashi, A.Honjo, K.Ikemoto, T.Inada, T.itoh, M.Kajihara, K.Kanai, K.Kashimoto, S.Kimura, M.Kitagawa, K.Makino, S.Masuda, T.Miki, K.Mizobuchi, H.Mori, K.Motomura, Y.Nakamura, H.Nashimoto, Y.Nishio, N.Saito, G.Sampei, Y.Seki, H.Tagami, K.Takemoto, C.Wada, Y.Yamamoto, M.Yano and T.Horiuchi.: "A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 12.7-28.0 min region on the linkage map." DNA Res.3 (Supplement, 211-223). 137-155 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, M., J.Suckow, B.Kisters-Woike, H.Aramaki and K.Makino.: "Multi-helical DNA-binding domains : their structures and modes of DNA-binding." Adv.Biophys.32. 31-52 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Aiba H., T.Baba, K.Hayashi, T.Inada, K.Isono, T.Itoh, H.Kasai, K.Kashimoto, S.Kimura, M.Kitakawa, M.Kitagawa, K.Makino, T.Miki, K.Mizobuchi, H.Mori, T.Mori, K.Motomura, S.Nakade, Y.Nakamura, H.Nashimoto, Y.Nishio, T.Oshima, N.Saito, G.Sampei, Y.Seki, S.Sivasundaram, H.Tagami, J.Takeda, K.Takemoto, Y.Takeuchi, C.Wada, Y.Yamamoto and T.Horiuchi.: "A 570-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 28.0-40.1 min region on the linkage map." DNA Res.3 (Supplement, 435-440). 363-377 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Itoh T., H.Aiba, T.Baba, K.Hayashi, T.Inada, K.Isono, H.Kasai, S.Kimura, M.Kitakawa, K.Makino, T.Miki, K.Mizobuchi, H.Mori, T.Mori, K.Motomura, S.Nakade, Y.Nakamura, H.Nashimoto, Y.Nishio, T.Oshima, N.Saito, G.Sampei, Y.Seki, S,Sivasundaram, H.Tagami, J.Takeda, K.Takemoto, C.Wada, Y.Yamamoto and T.Horiuchi.: "A 460-kb DNA sequence of the Escherichis coli K-12 genome corresponding to the 40.1-50.0 min region on the linkage map." DNA Res.3 (Supplement, 441-445). 379-392 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shieh J.-C., M.G.Wilkinson, V.Buck, B.A.Morgan, K.Makino and J.B.Millar.: "The Mcs4 response regulator coordinately controls the stress-activated Wak1-Wis1-Sty1 MAP kinase pathway and fission yeast cell cycle." Genes Dev.11. 1008-1022 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamamoto Y., H.Aiba, T.Baba, K.Hayashi, T.Inada, K.Isono, Takesgi Itoh, S.Kimura, M.Kitakawa, K.Makino, T.Miki, N.Mitsuhashi, K.Mizobuchi, H.Mori, S.Nakade, Y.Nakamura, H.Nashimoto, T.Oshima, S.Oyama, N.Saito, G.Sampei, Y.Satoh, S.Sivasundaram, H.Tagami, H.Takahashi, J.Takeda, K.Takemoto, K.Uehara, C.Wada, S.Yamagata and T.Horiuchi.: "Construction of a contiguous 874-kb sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 50.0-68.8 min on the linkage map and analysis of its sequence factures." DNA Res.4 (Supplement, 169-178). 91-113 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hiratsu K., K.Yamamoto and K.Makino.: "Molecular cloning and functional analysis of an rpoS homologue gene from Vibrio cholerae N86." Genes Genet.Syst.72. 115-118 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makino, K., K.Ishii, T.Yasunaga, M.Hattori, K.Yokoyama, C.Yutsudo, Y.Kubota, Y.Yamaichi, T.Iida, K.Yamamoto, T.Honda, C.-G.Han, E.Ohtsubo, M.Kasamatsu, T.Hayashi, S.Kuhara and H.Shinagawa.: "Complete nucleotide sequences of 93-kb and 3.3-kb plasmids of an enterohemorrhagic Escherichia coli O157 : H7 derived from Sakai outbreak." DNA Res.(in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Makino,K.: "DNA binding of PhoB and its interaction with RNA polymerase." J.Mol.Biol.259. 15-26 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Oshima,T.: "A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 gen ome corresponding to the 12.7 28.0 min region on the linkage map." DNA Res.3. 211-223 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki,M.: "Multi-helical DNA-binding domains:their structures and modes of DNA-binding." Adv.Biophys.32. 31-52 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Shieh J,-C.: "The Mcs4 response regulator coordinately controls the stress-activated Wak1-Wis1-Sty1 MAP kinase pathway and fission yeast cell cycle." Genes Dev.11. 1008-1022 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Hiratsu K.: "Molecular cloning and functional of an rpoS homologue gene from Vibrio cholerae N86." Genes Genet.Syst.72. 115-118 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Yamamoto,Y.: "A 800 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 50.1-68.0 min region on the linkage map." DNA Res.4. 91-113 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 牧野耕三: "癌研究法ハンドブック" 中外医学社(in press),

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Makino,K.: "DNA binding of PhoB and its interaction with RNA polymerase." J.Mol.Biol.259. 15-26 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Oshima,T.: "A 718-kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 12.7-28.0 min region on the linkage map." DNA Res.3. 211-223 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki,M.: "Multi-helical DNA-binding domains : their structures and modes of DNA-binding" Adv.Biophys.32. 31-52 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Aiba,H.: "A 570 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 28.0-40.7 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Itoh,T.: "A 460 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 40.7-50.1 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Yamamoto,Y.: "A 800 kb DNA sequence of the Escherichia coli K-12 genome corresponding to the 50.1-68.0 min region on the linkage map." DNA Res.(in press).

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 牧野耕三: "癌研究法ハンドブック" 中外医学社(in press),

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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