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細菌のD-アミノ酸代謝関連酵素の阻害剤開発を目的とした構造と機能の解析

研究課題

研究課題/領域番号 08456052
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関関西大学

研究代表者

左右田 健次  関西大学, 工学部, 教授 (30027023)

研究分担者 江崎 信芳  京都大学, 化学研究所, 教授 (50135597)
老川 典夫  関西大学, 工学部, 講師 (80233005)
研究期間 (年度) 1996 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
8,000千円 (直接経費: 8,000千円)
1997年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
1996年度: 5,200千円 (直接経費: 5,200千円)
キーワードD-アミノ酸トランスアミナーゼ / アラニンラセマーゼ / ペプチドグリカン / グルタミン酸ラセマーゼ / 反応機構 / D-アミノ酸
研究概要

D-アミノ酸は、細胞壁ペプチドグリカンの構成成分として細菌には必須であるが、高等動物ではその生理作用は知られていない。そのため、これらD-アミノ酸の生合成に関連するD-アミノ酸アミノトランスフェラーゼ(D-AAT)、アラニンラセマーゼ(AlaR)、グルタミン酸ラセマーゼ(GluR)などの特異的阻害剤は、細菌に特異性の高い新規抗生物質として作用しうる。本研究ではこのような阻害剤開発の基礎として、これら酵素の構造と機能の関係について検討した。まず、部位特異的変異により好熱性枯草菌由来のD-AATの活性中心Arg98の役割について検討し、Arg98が基質結合部位であるとともに、D-AAT反応における基質α-ケト酸の阻害効果に関与することを明らかにした。また細菌のD-アラニン生合成に関与するアラニンラセマーゼの反応機構を明らかにするため、X線結晶解析の結果から基質α-水素の引き抜きの触媒基と予想された、補酵素ピリドキサルリン酸(PLP)結合リジン残基(K39)と、PLPを挟んでこれと反対側に位置するチロシン265(Y265A)をそれぞれアラニンに変換した、K39AおよびY265A変異酵素を作製した。K39Aはメチルアミン存在下でラセミ化反応を触媒するが、この際D-アラニンを基質にした場合にのみ基質アイソトープ効果が観察された。野生型AlaRは、D-およびL-アラニンに対して、弱いアミノ基転移活性を示すが、Y265AはL-アラニンに対してのアミノ基転移活性を失った。以上の結果、AlaR反応はK39とY265による複塩基機構によって進行し、それぞれの残基はD-およびL-アラニンからのα-水素引き抜き、および両アミノ酸が生成する際に水素を付加する触媒基であることを明らかにした。本研究ではまた、E.coli由来のGluRのUDP-N-アセチルムラミルL-アラニンによる活性化の機構や、発現調節などについても検討した。

報告書

(3件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 研究成果

    (23件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (23件)

  • [文献書誌] 吉村,徹: "D-アミノ酸の役割 生理作用と代謝をめぐって" 現代化学. 12号. 14-19 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimura, T.: "Stereospecificity for the Hydrogen Transfer and Molecular Evolution of Pyridoxal Enzymes" Biosci.Biotech.Biochem.60巻2号. 181-187 (1996)

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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 吉村,徹: "細菌のD-アミノ酸代謝関連酵素の構造と機能の特性" 日本農芸化学会誌. 70巻1号. 15-20 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Liu, L.: "Cloning and Expression of the Glutamate Racemase Gene of Bacillus pumilus" Journal of Biochemistry. 121巻6号. 1155-1161 (1997)

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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Liu, L.: "Compensation for D-Glutamate Auxotrophy of Escherichia coli WM335 by D-Amino Acid Aminotransferase Gene and Regulation of murI expression" Bioscience Biotechnology Biochemistry. 62巻1号. 193-195 (1998)

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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Lim, Y.-H.: "Nonstereospecific Transamination Catalyzed by Pyridoxal Phosphatedependent Amino Acid Racemases of Broad Substrate Specificity" The Journal of Biological Chemistry. 273巻7号. 4001-4005 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimura, T.et al.: "Role of D-Amino Acids" Gendai Kagaku. 12 (309). 14-19 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimura, T.et al.: "Stereospecificity for the Hydrogen Transfer and Molecular Evolution of Pyridoxal Enzymes" Biosci.Biotech.Biochem.60 (2). 181-187 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yoshimura, T.: "Structure and Function of Bacterial D-Amino Acid-Related Enzymes Enzymes" Nippon Nougeikagaku kaishi. 70 (1). 15-20 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Liu, L.et al.: "Cloning and Expression of the Glutamate Racemase Gene of Bacillus pumilus" J.Biochem.121 (6). 1155-1161 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Liu, L.et al.: "Compensation for D-Glutamate Auxotrophy of Escherichia coli WM335 by D-Amino Acid Aminotransferase Gene and Regulation of murI Expression" Biocsci.Biotech.Biochem.62 (1). 193-195 (1998)

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    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Lim, Y.-H.: "Nonstereospecific Transamination Catalyzed by Pyridoxal Phosphate-dependent Amino Acid Racemases of Broad Substrate Specificity" J.Biol.Chem.273 (7). 4001-4015 (1998)

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      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 吉村,徹: "D-アミノ酸の役割 生理作用と代謝をめぐって" 現代化学. 12号. 14-19 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Yoshimura,T.: "Stereospecificity for the Hydrogen Transfer and Molecular Evolution of Pyridoxal Enzymes" Biosci.Biotech.Biochem.60巻2号. 181-187 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 吉村,徹: "細菌のD-アミノ酸代謝関連酵素の構造と機能の特性" 日本農芸化学会誌. 70巻1号. 15-20 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Liu,L.: "Cloning and Expression of the Glutamate Racemase Gene of Bacillus pumilus" Journal of Biochemistry. 121巻6号. 1155-1161 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Liu,L.: "Compensation for D-Glutamate Auxotrophy of Escherichia coli WM335 by D-Amino Acid Aminotransferase Gene and Regulation of murI expression" Bioscience Biotechnology Biochemistry. 62巻1号. 193-195 (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Lim,Y.-H.: "Nonstereospecific Transamination Catalyzed by Pyridoxal Phosphate-dependent Amino Acid Racemases of Broad Substrate Specificity" The Journal of Biological Chemistry. 273巻7号. 4011-4005 (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 左右田健次: "D-アミノ酸代謝とビタミンB6酵素" ビタミン. 70・3. 103-113 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] T.Yoshimura: "Stereospecificity for the Hydrogen Transfer and Molecular Evolution of Pyridoxal Enzymes" Biosci. Biotech. Biochem.60・2. 181-187 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Kwang-Hwan Jhee: "Stereospecificity of Thermostable Ornithine 5-Aminotransferase for the Hydrogen Transfer in the L-and D-Ornithine Transamination" Biochemistry. 35・30. 9792-9796 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] 吉村徹: "D-アミノ酸の役割・生理作用と代謝をめぐって" 現代化学. 12. 14-19 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書
  • [文献書誌] Hyeon-Su Ro: "Site-directed Mutagenesis of the Amino Acid Residues in β-strand III [Val30Val36]of D-amino Acid Aminotransferase of Bacillus sp. YM-1" FEBS Letters. 398. 141-145 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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