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ゲノミックスキャンニング法を起点とした優良・不良形質遺伝子プローブの開発

研究課題

研究課題/領域番号 08556047
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 基礎獣医学・基礎畜産学
研究機関東京大学

研究代表者

塩田 邦郎  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (80196352)

研究分担者 青野 文仁  協同飼料株式会社, 研究所, 研究員
後飯塚 僚  東京理科大学, 生命科学研究所, 助教授 (60205581)
小川 博之  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (30012016)
佐々木 伸雄 (佐々木 信雄)  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (60107414)
三宅 陽一  岩手大学, 農学部, 助教授 (20002256)
小川 智也  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 教授 (30087572)
研究期間 (年度) 1996 – 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
14,600千円 (直接経費: 14,600千円)
1998年度: 3,000千円 (直接経費: 3,000千円)
1997年度: 3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
1996年度: 8,400千円 (直接経費: 8,400千円)
キーワードCpGアイランド / ゲノミック・スキャンニング(RLGS法)法 / 遺伝性疾患 / 組織特異的脱メチル化 / DNAメチル化酵素 / 形態形成 / FISH法 / イソ染色体構造 / ゲノムメチル化 / RLGS法 / 形質遺伝子
研究概要

家畜動物の人工授精法の普及により広まる結果となってしまった遺伝性疾患などの不良形質を、少ない手間で効率よく検索する方法の確立が求められており,本研究計画では、家畜や実験動物の遺伝性疾患や形態形成のランドマークプローブを開発することを目的とした研究を行った。申請者らは,国内で広く飼育されている黒毛和種牛に特異的な遺伝性疾患である1/29型転座に関する研究を雌牛側および雄牛側の両面から行った。また、牛のXY性腺発育不全症の病因をPCRを主体とする手法で明らかにしたのに加え、XY female 牛における Y染色体の構造以上をFISH法で解析し、同牛のY染色体はイソ染色体構造となっていることを明らかにした。制限酵素ランドマークを二次元電気泳動で展開する、新しい概念に基づいたRLGS法では、ゲノムDNA断片がそのコピー数を反映した濃さのスポットとして可視化されるため、1コピー/ハプロイドゲノムの精度での解析が可能である。この厳密な正確性と再現性をもってゲノム全体を一挙に検索することにより、突然変異によるDNA増幅、染色体欠質などの異常の検出に威力を発揮する。申請者らは、ラットを実験モデルとして用いたRLGS法の確立およびRLGS法による各組織のゲノムDNAの解析を行い、その結果、組織特異的に脱メチル化されているCpGアイランドの検出に成功した。さらに、胎盤で脱メチル化されているゲノム領域にあたるゲノム断片を単離することに成功した。そのひとつが、ミトコンドリアのC3トランスポーターをコードする遺伝子領域であることを明らかにし、各組織におけるC3トランスポーター遺伝子の発現量とゲノムの脱メチル化状態との相関性を解析した。これらの結果は、RLGS法が、ゲノムDNAを検索し変化の認められる領域を効率よく同定・単離する方法として有効であることを示した。

報告書

(4件)
  • 1998 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1997 実績報告書
  • 1996 実績報告書
  • 研究成果

    (37件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (37件)

  • [文献書誌] K.Kawakura et al.: "Deletion of the SRY region on the Y chromosome detected in bovine gonadal hypoplasia(XY female)by PCR." Cytogenet.Cell Genet.72. 183-184 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 坂本 岳志 ら: "黒毛和種雄牛の繁殖効率に及ぼすロバートソン型転座の影響" 東北家畜臨床研試. 19. 10-17 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 似鳥 和子ら: "黒毛和種雌牛におけるロバートソン型転座と繁殖能力の関連" 東北家畜臨床研試. 19. 18-24 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Ohgane and K.Shiota: "Methylation profiles of CpG island : Analysis of rat placental cells by restriction landmark genomic scannnig." J.Reprod.Develop.43(Spl). 167-168 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Shiota et al.: "Construction of Genomic DNA of Trophoblast Giant Cells : Analysis of CpG islands by Restriction Landmark Genomic Scanning." In “8th Lake Shirakaba Placenta Conference",T.Nakayama,T.Makino(eds),Keiseisha,Tokyo. 37-44 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Ogawa et al.: "Clinical,morphologic,and biochemical characteristics of Chediak-Higashi syndrome in fifty-six Japanese" AJVR.58(11). 1221-1226 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Satoh et al.: "The possibility of early estimation for fertility in bovine heterosexual twin females." J.Vet.Med.Sci.59. 221-222 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Kawakura et al.: "Abnormal structure of the Y chromosome detected in bovine gonadal hypoplasia(XY female)by FISH." Cytogenet.Cell Genet.76. 36-38 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y-I.Miyake et al.: "Chromosomal analysis of cases with chimerism that consisted of normal ce〓 and cells with 1/29 translocation in homosexual twin cows and their calves." Reprod.Dom.Anim.32. 175-177 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Sagoh et al.: "Detection of the bovine Y specific DNA by in situ hybridization." Chromosome Reserch 1. 1. 101-10331 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 三宅 陽一: "染色体異常による家畜の繁殖障害に関する研究." 岩獣会報. 23. 73-78 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 三宅 陽一: "黒毛和種と先天異常の諸問題" 獣畜新報. 50. 865-868 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Kimura et al.: "Expression of rat DNA(cytosine-5)methyltransferase(DNA MTase)in rodent trophoblast giant cells : molecular cloning and characterization of rat DNA MTase." Biochem Biophys Res Commun. 253(2). 495-501 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Ohgane et al.: "Analysis of CpG islands of trophoblast giant cells by restriction landmark genomic scanning." Developmental Genetics. 22(2). 132-140 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Shiraishi et al.: "Impaired cytosolic calcium mobilization and aggregation in response to collagen in platele from Japanese Black cattle with Chediak-Higashi syndorome." AJVR.59(6). 744-749 (1998)

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    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Kawakura et al.: "Deletion of the SRY region on the Y chromosome detected in bovine gonadal hypoplasia (XY female) by PCR." Cytogenet.Cell Genet.72. 183-184 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Sakamoto et al.: "The effect of the 1/29 Robertsonian translocation upon fertility in the herd of Japanese Black Cattle." The Tohoku Journal of Veterinance Clinics. 19 (1). 10-17 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Nitodori et al.: "The relationship between Robertsonian translocation and fertility in the head of Japanese Black bulls." The Tohoku Journal of Veterinace Chlinics. 19 (1). 18-24 (1996)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Ohgane, K.Shiota: "Methylation profiles of CpG island : Analysis of rat placental cells by restriction landmark genomic scanning." J.Reprod.Develop.43 (Spl). 167-168 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Ogawa et al.: "Clinical, morphologic, amd biochemical characteristics of Chediak-Higashi syndrome in fifty-six Japanese." AJVR. 58 (11). 1221-1226 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Satoh et al.: "The possibility of early estimation for fertility in bovine heterosexual twin females." J.Vet.Med.Sci.59. 221-222 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Kawakura et al.: "Abnormal structure of the Y chromosome detected in bovine gonadal hypoplasia (XY female) by FISH." Cytogenet.Cell Genet.76. 36-38 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y-I.Miyake et al.: "Chromosomal analysis of cases with chimerism that consisted of normal cells and cells with 1/29 translocation in homosexual twin cows and their calves." Reprod.Dom.Anim.32. 175-177 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Sagoh et al.: "Detection of the bovine Y specific DNA by in situ hybridization." Chromosome Research 1. 1. 101-103.31 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y-I.Miyake: "Study on impaired fertility caused by chromosomal abnormalities in linestock animal. (in Japanese)" Iwate.Vet.23 (3). 73-78 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y-I.Miyake: "The inkerized abnormalities in the Japanese Black Cattle bread. (in Japanese)" JVM. 50 (10). 865-868 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Kimura et al.: "Expression of rat DNA (cytosine-5) methyltransferase (DNA MTase) in rodent trophoblast giant cells : molecular cloning and characterization of rat DNA MTase." Biochem Biophys Res Commun. 253 (2). 495-501 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Ohgane et al.: "Analysis of CpG islands of trophoblast giant cells by restriction landmark genomic scanning." Developmental Genetics. 22 (2). 132-140 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Shiraishi et al.: "Impaired cytosolic calcium mobilization and aggregation in response to collagen in platelets from Japanese Black cattle with Chediak-Higashi syndrome." AJVR.59 (6). 744-749 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Shiota et al.: Construction of Genomic DNA of Trophoblast Giant Cells : Analysis of CpG islands by Restriction Landmark Genomic Scanning. In "8th Lake Shirakaba Place* Conference", T.Nakayama, T.Makino (eds). Keiseisha, Tokyo, 37-44 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Kimura et al.: "Expression of rat DNA (cytosine-5) methyltransferase (DNA MTase) in rodent trophoblast giant cells: molecular cloning and characterization of rat DNA MTase" Biochem Biophys Res commun. 253(2). 495-501 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] J.Ohgane et al.: "Analysis of CpG islands of trophoblast giant cells by restricition landmark genomic scanning" Development Genetics. 22(2). 132-140 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] J.Ohgane and K.Shiota: "Methylation profiles of CpG island:Analysis of rat placental cells by restriction landmark genomic scanning." J.Reprod.Develop.43(Spl). 167-168 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Shiota et al.: "Construction of Genomic DNA of Trophoblast Giant Cells:Analysis of CpG islands by Restriction Landmark Genomic Scanning." In″8th Lake Shirakaba Placenta Conference″,T.Nakayama,T.Makino (eds),Keiseisha,Tokyo. 37-44 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Kawakura et al.: "Abnormal structure of the Y chromosome detected in bovine gonadal hypoplasia (XY female) by FISH." Cytogenet.Cell.Genet.76. 36-38 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Y-I.Miyako et al.: "Chromosomal analysis of cases with chimerism that consisted of normal cells and cells with 1/29 translocation in homosexual twin cows and their calves." Reprod.Dom.Anim.32. 175-177 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] J.Ohgane and K.Siota: "Methylation profiles of CpG island:Analysis of rat placental cells by restriction landmark genomic scanning." J Reprod Develop.43(in press).

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      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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