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合成ユビキノール類縁体と変異酵素を用いた大腸菌ユビキノール酸化酵素の構造解明

研究課題

研究課題/領域番号 08660136
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物生産化学・応用有機化学
研究機関京都大学

研究代表者

三芳 秀人  京都大学, 農学研究科, 助教授 (20190829)

研究期間 (年度) 1996 – 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
1997年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
1996年度: 1,600千円 (直接経費: 1,600千円)
キーワード呼吸鎖 / ユビキノン / 末端酸化酵素 / 構造活性相関
研究概要

大腸菌末端酸化酵素(bo型及びbo型ユビキノール酸化酵素)のユビキノール酸化部位の構造及び機能持性を解明する目的で、系統的に構造修飾した一連のユビキノール類縁体の構造活性相関研究を行った。まず、bo型ユビキノール酸化酵素について検討したところ、側鎖構造の如何に関わらず、2位エトキシ体の活性が3位エトキシ体よりも顕著に低下したことから、キノール環上の2位メトキシ基は3位メトキシ基よりも酵素によってより厳密に認識されていることがわかった。また同様に、5位メチル基を無置換あるいはエチル基にそれぞれ改変しても活性が低下したことから、5位メチル基は酸化反応に重要な役割を果たしていることがわかった。以上のことから、酵素によるキノール環上の置換基の認識はアルキル側鎖の構造によって影響を受けないことが判明し、基質の酸化反応にはキノール環部と側鎖部がそれぞれ独立に関与していることが明らかになった。
また、キノール環部の置換基パターンが同じ場合には、Q_2H_2類の方がDBH_2類よりも反応の親和性が高かったことから、天然型側鎖のイソプレノイド構造は酵素との親和性を高めるような特異的な相互作用に関与していることがわかった。従来、キノン類の側鎖の機能としてはキノン分子の疎水性の増大を保証しているものと考えられてきたが、本研究の結果は、少なくともbo型ユビキノール酸化酵素においては側鎖が疎水性を増大する効果以上の機能性を持っていることが示された。
さらに、bo型ユビキノール酸化酵素について同様の検討を行ったところ、キノール環部の置換基効果はbo型酵素とほぼ同様であり、親和性を上昇させる側鎖ゲラニル基の特異的な効果も同様に認められた。この結果は、一次構造上の相同性の低い両酵素において、ユビキノール酸化部位の構造特性が極めて類似していることを強く示唆するものである。

報告書

(3件)
  • 1997 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1996 実績報告書
  • 研究成果

    (4件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (4件)

  • [文献書誌] K.Sakamoto et al.: "Probing substrate binding site of the Escherichia coliquinol oxidases" Journal of Biological Chemistry. 271. 29897-29902 (1996)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Sakamoto et al.: "Probing substrate binding site of the Escherichia coli quinol oxidases using synthetic ubiquinol analoques." Journal of Biological chemistry. vol.271. 29897-29902

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1997 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Sakamoto et al: "Probing substrate binding site of the Escherichia coli quinol oxidases" Journal of Bioloqical Chemistry. 271. 29897-29902 (1996)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Sakamoto et al.: "Probing substrate binding site of the Escherichia coli quinol oxideses" Journal of Brological Chemistry. 271. 29897-29902 (1996)

    • 関連する報告書
      1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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