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核リボゾームRNA遺伝子のITS領域を用いたラン科セッコク連の系統解析

研究課題

研究課題/領域番号 08740673
研究種目

奨励研究(A)

配分区分補助金
研究分野 系統・分類
研究機関国立科学博物館

研究代表者

遊川 知久  国立科学博物館, 筑波研究資料センター, 研究官 (50280524)

研究期間 (年度) 1996
研究課題ステータス 完了 (1996年度)
配分額 *注記
900千円 (直接経費: 900千円)
1996年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
キーワード分子系統学 / 核リボゾームRNA遺伝子 / 分岐分類 / ラン科 / セッコク属 / ITS
研究概要

核リボソームRNA遺伝子のITS(internal transcribed spacer)領域の塩基配列を、ラン科セッコク連(tribe Dendrobieae)の姉妹群候補、14属、23種について比較し、系統解析をおこなった。その結果を、葉緑体DNAの制限酵素断片、およびrbcL遺伝子の塩基配列の情報にもとづいて構築した分岐図と比較したところ、信頼区間の高い部分についてよく一致し、従来の分類体系の再検討が必要であることが分かった。
すなわち、(1)セッコク亜連が偽系統群であること、(2)Pseuderiaがセッコク亜連でなくオサラン連のメンバーであること、(3)Pseuderiaを除くセッコク亜連はクレイド1(Dendrobiumの一部,Cadetia,Diplocaulobium,Flickingeria)、クイレド2(Dendrobiumの一部)、クレイド3(Epigeneium)の3群からなること、(4)その結果Dendrobiumが偽系統群となること、以上の諸点を明らかにした。
他方、一部の分類群のITS領域は遺伝子重複を起こしており、orthologousな塩基配列を比較していることを確実にするためには、さらに研究を進める必要のあることが明らかになった。

報告書

(1件)
  • 1996 実績報告書

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公開日: 1996-04-01   更新日: 2016-04-21  

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