| 研究課題/領域番号 |
08770194
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| 研究種目 |
奨励研究(A)
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| 配分区分 | 補助金 |
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| 研究分野 |
細菌学(含真菌学)
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| 研究機関 | 九州大学 |
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研究代表者 |
藤本 秀士 九州大学, 医学部, 講師 (30199369)
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| 研究期間 (年度) |
1996
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| 研究課題ステータス |
完了 (1996年度)
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| 配分額 *注記 |
1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1996年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
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| キーワード | ヘリコバクターピロリ- / 遺伝子多様性 / DNAポリメラーゼ |
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| 研究概要 |
ヘリコバクターピロリ-の遺伝子多様性の機序を解明するために、この菌のDNAポリメラーゼの解析を試みた。
1、H.pyloriDNAポリメラーゼ遺伝子をクローニングするためのプローブをDegenerated PCRにより作成した。このプローブ作成のためには、Gene bankを検索し、過去に発表されている大腸菌DNAポリメラーゼ遺伝子やTaqDNAポリメラーゼ遺伝子などのアラインメントを行いConserved regionを決定した。その部位を含む最適なPCR primerを選択しdegenerated PCRを行った。その結果、800bpのPCR産物を得た。このPCR産物が目的のものか確認するため塩基配列を決定し、Gene bankのデータベースを用いてホモロジーを検証したところ、大腸菌のDNAポリメラーゼと非常に高い相同性を示し、このPCR産物がDNAポリメラーゼであることが証明された。
2、次に、このPCR産物をプローブとしてH.pylor遺伝子ライブラリーのスクリーニングを行った。ライブラリーはUniversity of WashingtonのBerg博士が作成したコスミドライブラリーを用い、コロニーブロットでサザンハイブリダイゼイションを行い陽性のコロニーを探した。約30〜50KbのH.pylori遺伝子断片をもつクローンを70クローンほど検索した結果、目的遺伝子を含むクローンが見つかった。
3.このクローンを数種類の制限酵素で切断した後、アガロースゲル電気泳動を行い同一プローブを用いてサザンハイブリダイゼーションを行って再確認したところ、XbaIフラグメント(約15-20Kb)に目的遺伝子が存在することをつきとめた。このクローンのサブクローニングと塩基配列の決定を行い、目的遺伝子の部分的な塩基配列決定がなされた。現在、全遺伝子配列の決定を試みている。
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