• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

スピンモデルによる適応的進化の統計力学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 08J10778
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 数理物理・物性基礎(理論)
研究機関東京大学

研究代表者

坂田 綾香  東京大学, 大学院・総合文化研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2008 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
2010年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2009年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2008年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
キーワードスピングラス / 進化 / レプリカ法 / Partial Annealing / ランダム系 / フラストレーション / 理論進化 / 交換モンテカルロ法 / 相転移 / 二重平均の統計力学
研究概要

本年度は、スピン模型を用いた適応的進化の研究についてスピングラス理論を用いた解析を行い、これまでの三年間にわたる研究をまとめた。採用一年目の研究においては、断熱的二温度系の進化モデルが、ある中間温度のノイズ環境下において特徴的な振る舞いを示すことを数値的に確認した。二年目の研究においては、一年目とは異なる断熱的二温度系の模型を導入して解析を行った。この模型では、中間温度領域は存在せず、温度が減少するほど安定な表現型発現が得られるという結果であった。したがって、一年目の研究で見られた結果を得るためには、模型に対してある条件を課すことが必要であることが明らかになった。具体的には、断熱的二温度系は遅い変数である遺伝子型(相互作用配位)の時間発展を支配する関数と、表現型(スピン配位)のエネルギーの相関により分類されるということである。この結果踏まえ本年度は、初年度に導入した模型について、ある変形を行うことでレプリカ法による解析が可能になることに着目し、変形模型を導入して解析を行った。研究の結果、初年度の研究と同様の、ある中間温度のノイズ環境下における特殊な振る舞いが見られ、さらにその温度領域はレプリカ対称な相として特徴付けられることが明らかになった。これまで数値的に確認されていた、中間温度領域における特徴的な進化に対して、スピングラス理論におけるレプリカ対称性という概念を通して説明を与えた。初年度に得られていた結果は、レプリカ対称な系が持つと期待される一般的な件質と矛盾無く一致するものであり、本年度の研究は進化と適応を熱力学的な転移と関係付けて理論的に説明したことに大きな価値があると考えている。
ここまで、本研究では遺伝子型から表現型が発現する過程におけるノイズの効果が進化に及ぼす影響を議論してきた。断熱的な二温度系のスピングラス模型において遺伝子型と表現型の進化を表し、スピングラス理論による解析を行うことで、レプリカ対称性という概念を進化的に解釈した。本研究が示したことは、表現型発現過程においてある程度の揺らぎが存在する場合、変異に対する頑健性が進化を通して獲得されるという可能性である。この点は、今後実験的にも再現されるであろうと期待される。また模型の解析において、断熱的二温度系におけるレプリカ法の解析を拡張した。この拡張された理論は、推定の問題をはじめとして、様々な工学的な応用研究で用いられると考えている。

報告書

(3件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 2008 実績報告書
  • 研究成果

    (24件)

すべて 2011 2010 2009 2008

すべて 雑誌論文 (6件) (うち査読あり 6件) 学会発表 (18件)

  • [雑誌論文] Partial annealing of a coupled mean-field spin-glass model with an embedded pattern2011

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata, Koji Hukushima
    • 雑誌名

      Physical Review E

      巻: 83

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Funnel landscape and mutational robustness as a result of evolution under thermal noise2009

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata, Koji Hukushima, Kunihiko Kaneko
    • 雑誌名

      Physical Review Letters 102

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Statistical-mechanical study of evolution of robustness in noisy environment2009

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata, Koji Hukushima, Kunihiko Kaneko
    • 雑誌名

      Physical Review E 80

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] A statistical-mechanical study of evolution of robustness : An approach from two-temperature models2009

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata, Koji Hukushima, Kunihiko Kaneko
    • 雑誌名

      Journal of Physics : Conference Series 197

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Funnel landscape and mutational robustness as a result of evolution under thermal noise2009

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata
    • 雑誌名

      Physical Review Letters (印刷中, 掲載確定)

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] スピンモデルによる適応的進化の統計力学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 雑誌名

      物性研究 2008年9月号

      ページ: 825-859

    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 結合ランダム系の統計力学2011

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      第一回空間結合符号とその周辺ワークショップ
    • 発表場所
      東京工業大学(東京都)
    • 年月日
      2011-02-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 進化の統計力学モデルのレプリカ解析2010

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香, 福島孝治
    • 学会等名
      日本物理学会2010年秋季大会
    • 発表場所
      大阪府立大学(大阪府)
    • 年月日
      2010-09-23
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Phase transition with respect to replica number in spin-glass model with a locally embedded pattern2010

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata, Koji Hukushima
    • 学会等名
      STATPHYS24
    • 発表場所
      Convention Centre, (オーストラリア, ケアンズ)
    • 年月日
      2010-07-19
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 二変数のスピングラス模型における相互作用の構成問題2010

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      大阪大学サイバーメディアセンター待兼山コロキウム
    • 発表場所
      大阪大学(大阪府)
    • 年月日
      2010-07-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 疎結合スピングラス模型の自己平均性の破れ2010

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香, 福島孝治
    • 学会等名
      日本物理学会 2010年年次大会
    • 発表場所
      岡山大学
    • 年月日
      2010-03-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] A Statistical Mechanical Study of Evolution of Robustness2010

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      YSM-SPIP 2010
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2010-03-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 局所的にパターンを埋め込んだ有限レプリカ数の系における転移2009

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      DEX-SMI2009研究成果発表会
    • 発表場所
      東京工業大学
    • 年月日
      2009-12-23
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Partial Annealing 模型と, 進化モデルへの適用2009

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      東北大学大学院情報科学研究科 情報数物研究会
    • 発表場所
      東北大学
    • 年月日
      2009-11-06
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 二温度系におけるロバストネスの進化の統計力学的研究2009

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香, 福島孝治, 金子邦彦
    • 学会等名
      第47回日本生物物理会年会
    • 発表場所
      徳島文理大学・アスティ徳島
    • 年月日
      2009-10-31
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Funnel landscape and mutational robustness as a result of evolution under thermal noise2009

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香, 福島孝治, 金子邦彦
    • 学会等名
      International Symposium on Complex Systems Biology
    • 発表場所
      東京大学
    • 年月日
      2009-10-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Partial Annealing 系における local な Mattis state2009

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香, 福島孝治
    • 学会等名
      日本物理学会2009秋季大会
    • 発表場所
      熊本大学
    • 年月日
      2009-09-27
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Frustration of a finite replicated spin glass system2009

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata
    • 学会等名
      SciSSP2009
    • 発表場所
      東京大学物性研究所
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Partial Annealing 系でのフラストレーションのレプリカ数依存性2009

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      日本物理学会第64回年次大会
    • 発表場所
      立教大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] A statistical mechanical study of evolution of robustness under noisy environment2008

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata
    • 学会等名
      SigmaPhi2008
    • 発表場所
      Orthodox Academy of Crete, Greece
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 長距離相互作用のある系での Partial Annealing2008

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      日本物理学会2008年秋季大会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] ターゲット配置を適応度として進化するスピン系での相転移2008

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      日本物理学会2008年秋季大会
    • 発表場所
      岩手大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] Partially annealed spin system with long range interactions2008

    • 著者名/発表者名
      Ayaka Sakata
    • 学会等名
      International Workshop on "Novel Aspects of Phase Transitions with Long-range Interactions"
    • 発表場所
      東京大学
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書
  • [学会発表] 揺らぐ環境下でのロバストネスの進化の統計力学的研究2008

    • 著者名/発表者名
      坂田綾香
    • 学会等名
      日本生物物理学会第46回年会
    • 発表場所
      福岡国際会議場
    • 関連する報告書
      2008 実績報告書

URL: 

公開日: 2008-04-01   更新日: 2024-03-26  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi