研究分担者 |
根井 正利 米国ペンシルバニア州立大学分化進化遺伝研究所, 教授
大野 乾 米国ベックマン研究所, 終身研究員
BECK Stephan The Sanger Centre Human Chromosome 6 Seq, Senior Gro
TROWSDALE Jo Cambridge University Department of Immun, Professor
安藤 麻子 東海大学, 医学部, 講師 (40101935)
大野 進 米国ベックマン研究所, 終身研究員
TILANUS Marc University Hospital Utrecht Department o, 教授
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研究概要 |
ヒトの第6染色体6p21.3領域に位置するHLA領域と相同性を有する遺伝子が多数みいだされるヒト第9染色体9q33-34領域、第1染色体1q21-25領域のゲノム構造をHLA領域と比較、解析することにより、MHCの進化の起源と進化の過程を解明することを目的として、まずHLA領域のなかで塩基配列が未決定のクラスI全領域(1.8Mb)の塩基配列を決定し、新遺伝子の同定を試みた。その結果、この領域に16個の発現新規遺伝子、22個のESTと一致する領域、3個の発現可能な塩基配列などの計124個の遺伝子あるいは遺伝子候補領域を見い出した。さらに5対の領域について倍化によると考えられる遺伝子重複が見られた。第9染色体9q33-34領域と第1染色体1q22-23については、相同遺伝子の配列順序を明らかにするためにこれらの領域を含むと考えられるYACクローンを用いて、この領域に座位する遺伝子とSTSマーカーのPCR解析を行った。その結果、9q33-34領域については、セントロメア側からHXB-C5-GRP78の順序にHLA領域と相同性を有する遺伝子が位置することが明らかになった。1q22-23領域については、CDl遺伝子を含む1.8Mbの領域のYACとPAC,BACコンティグを作成した。このコンティグには、セントロメア側からCD1D-CD1A-CDIC-CD1B-CD1E-SPTA1-MNDA-IFI-16-FY1-FCERIA-KRTC7-CRP-CRPP1-APCS-KIAAO120の順序に15遺伝子が位置することが明らかになった。さらにYACクロ-ンを用いたPCR解析から、KIAA0120遺伝子のテロメア側には、PBXl,RXRG,POU2F1などのHLA領域に相同性遺伝子の存在が認められる遺伝子が座位していること、並びにこの領域にはSPTA1,FY1,IFI-16,FCERIA,APCS,LYAM,CD48,LY9,SCM,CD3Z,ATAC,ELAM1,LNHR,FASLのような免疫反応に重要な遺伝子が数多く位置することが明らかになった。
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