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岩塩/好塩性古細菌分布データベース作成

研究課題

研究課題/領域番号 09214207
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関名古屋大学

研究代表者

井原 邦夫  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助手 (90223297)

研究期間 (年度) 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1997年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
キーワード古細菌 / 好塩菌 / 岩塩 / プロテオリピッド / ロドプシン
研究概要

種々の場所から集めた(古い時代のものだけでなく新しい時代のものを含めた)岩塩を用いて、注意深く滅菌操作を行い、(1)好塩性古細菌の培養と,(2)PCR法による16SrRNA遺伝子の増幅を試みた。その結果、各地から集めた12の試料の内、3つの岩塩から好塩菌の増殖に成功し、脂質分析から確かに古細菌であることは確認できた。さらに、その16SrRNA遺伝子の塩基配列を、現存する種々の好塩菌と比較した結果、Haloferax属、Haloarcula属、Halococcus属に近いことは判断できたが、系統樹上で明らかに古いものとはならなかった。手に入った岩塩の中で、古い地質時代(カンブリア紀やペルム紀)からのものと思われる試料からは、まったく増殖が観察できなかった。また、抽出試料の直接PCRも、まったく増幅が観察されなかった。岩塩中での好塩菌の生存曲線は明らかではなく、ある一定期間以前の試料からの再生は望めないのかもしれないが、まだ分析した試料の量が少ないので、好塩菌の岩塩中での局在化の問題も含め、検討の余地はある。現存する好塩菌については、そのレチナ-ルタンパクのアミノ酸配列から分子系統樹を作成し、遺伝子重複によって増えたと思える4種類の同族体の関係を明らかにした(投稿中)。この遺伝子重複の時点は進化の時間軸において一つのマーカーとなり、分化時期の推定を確かなものにできるかもしれない。さらに、ATPaseやシトクロームオキシダーゼのような重要なタンパクにも重複が見られることがわかった。この中には、好塩菌の種分化以降に重複を起こしているものがあり、生物間の分岐順序を決めるのにも役立つものと考えられる。

報告書

(1件)
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (2件)

  • [文献書誌] Kunio Ihara: "Haloarcula argentinesis sp.nov.and Haloarcula mukohataei sp.nov.,Two new splecies of extremely halophilic archaea collected in Argentina." International Journal of Systematic Bacteriology. 47. 73-77 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Kunio Ihara: "Identification of proteolipid from an extremely halophilic archaeon Halobacterium salinarum as an N,N'-dicyclohexyl-carbodiimide binding subunit of ATP synthase" Archives of Biochemistry and Biophysics. 341・2. 267-272 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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