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塩橋の成立条件のファージディスプレイを利用した統計的解析

研究課題

研究課題/領域番号 09261219
研究種目

重点領域研究

配分区分補助金
研究機関大阪大学

研究代表者

片倉 啓雄  大阪大学, 工学部, 助手 (50263207)

研究期間 (年度) 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
1997年度: 1,900千円 (直接経費: 1,900千円)
キーワードファージディスプレイ / 塩橋 / ペプチドライブラリー
研究概要

従来、ファージライブラリーのスクリーニングはイオン強度約0.2の緩衝液を用いて行われていたが、我々は塩橋を強調するためにイオン強度約0.01の緩衝液を用いた。牛膵臓RNase Aに結合するペプチドを7残基の直鎖状ランダムペプチドを提示するライブラリーから5ラウンドのbiopanningによってスクリーニングした。その結果、従来の緩衝液では得ることができなかった、RNase Aに親和性を持つファージクローンが得られた。ファージの提示するアミノ酸配列はLDNLWMV、SPWDARL、SADKWHT、EISMHYR、STASYTR、ISFDYLI、DSHTPQR、GRPAWDAなどで、このうちLDNLWMV、SPWDARLを合成し、蛍光偏光解消法でRNase Aに対する親和定数を求めたところそれぞれ3×10^3及び5×10^3M^<-1>であった。また、少なくともLDNLWMVはRNase A(13.7k,pl=9.6)と同程度の分子量の塩基性蛋白質であるegg white lysozyme(14.3k,pl=11)には結合せず、非特異的な塩橋による結合ではないことが確認できた。得られたアミノ酸配列には、何れも荷電アミノ酸が含まれており、その両端には疎水性アミノ酸が存在する傾向が見られた。今後、得られたペプチドの特異性、イオン強度依存性を解析すると共に、更に条件を変えてスクリーニングし、統計的解析を行う。

報告書

(1件)
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (2件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (2件)

  • [文献書誌] Katakura,Y.et al.: "Fluorescence polarization study of a salt bridge between a single-chain Fv and its antigen ribonuclease A" Molecular Immunology. 34・10. 731-734 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Katakura,Y.et al.: "The importance of ionic strength as a parameter in screening peptide ligands from a phage display library." Journal of Fermentation and Bioengineering. 85・4(印刷中). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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