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多核多次元NMR法で見る生体超分子形成の機構-サイトカインレセプター複合体の動的構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 09307054
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 医薬分子機能学
研究機関大阪大学

研究代表者

小林 祐次  大阪大学, 薬学研究科, 教授 (20127228)

研究期間 (年度) 1997 – 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
24,800千円 (直接経費: 24,800千円)
1998年度: 9,800千円 (直接経費: 9,800千円)
1997年度: 15,000千円 (直接経費: 15,000千円)
キーワード複合体 / BMP / レセプター / NMR / 立体構造 / BMPレセプター / 構造活性相関 / 複合体形成 / 蛋白質複合体 / IGF
研究概要

生体分子には互いの立体構造を認識して、より高次の分子複合体(生体超分子)を形成し、活性部位の効果的配置などの結果初めて機能発現がなされるものが多い。特に情報伝達を担う生体分子群においては、分子複合体の形成がその機能そのものであるといえる。本研究では多核多次元NMR法を用いて、情報伝達を担う蛋白質-蛋白質複合体の構造や運動性を解析し、その伝達機構の理解を深めることを目指した。また複合体形成を沈降平衡法、熱測定といった物理化学的手法で解析し、その形成メカニズムや構造安定化機構などに関する知見を総合することを目標に研究を行い以下のような成果を得た。BMP、BMPレセプター(タイプI,II)の発現・精製系を確立した。結合活性の測定のためには分析用超遠心機を用いた沈降平衡法・沈降速度法によって結合定数を定量的に見積もる方法論を確立することができた。また表面プラズモン共鳴センサーを活用した速度論的な解析も行った。さらに構造活性相関について知見を得るため各種のアミノ酸置換変異体を作成し、複合体形成に寄与しているアミノ酸残基を特定することができた。BMPレセプターについては安定同位体ラベルした試料を調製し、多核多次元NMR法を用いることによってほとんど全ての核のケミカルシフトを帰属できた。さらにNOEなどの構造情報を収集し立体構造を決定することに成功した。また複合体形成の際のケミカルシフトの変化を観測することで、その様子を原子レベルでモニターすることが可能になった。

報告書

(3件)
  • 1998 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (21件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (21件)

  • [文献書誌] Chino, N.: "Topological Isomers of Human Uroguanylin : Interconversion between Biologically Active and Inactive Isomers." FEBS Lett.421. 27-31 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Aumelas, A.: "Formation of Native Disulfide Bonds in Endothelin-1 Structural Evidence for the Involvement of a Highly Specific Salt Bridge between the Prosequence and the Endothelin-1 Sequence." Biochemistry. 37. 5220-5230 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, J.: "Solution Structure of Thermostable Cytochrome c-552 from Hydrogenobacter thermophilus Determined by ^1H-NMR Spectroscopy." Biochemistry. 37. 9641-9649 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, S.: "The Role of Calcium-binding Sites in S-modulin Function" J.Biol.Chem.273. 20223-20227 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tamaoki, H.: "Folding Motifs Induced and Stabilized by Distinct Cystine Frameworks." Protein Engineering. 11. 649-659 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ogawa, K.: "Conformation analysis of eel Calcitonin Comparison with the Conformation of Elcatonin." Eur.J.Biochem.257. 331-336 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Chino, N.: "Topological Isomers of Human Uroguanylin : Interconversion between Biologically Active and Inactive Isomers" FEBS Lett.421. 27-31 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Aumelas, A.: "Formation of Native Disulfide Bonds in Endothelin-1. Structural Evidence for the Involvement of a Highly sp ecific salt Bridge between the Prosequence and the Endothelin-1 Sequence." Biochemistry. 37. 5220-5230 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hasegawa, J.: "Sokltion Structure of Thermostable Cytochrome c-552 from Hydrogenobacter thermophilus Determined by ^1H-NMR Spectroscopy." Biochemistry. 37. 9641-9649 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Matsuda, S.: "The Role of Calcium-binding Sites in S-modulin Function" J.Biol.Chem.273. 20223-20227 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tamaoki, H.: "Folding M otifs Induced and Stabilized by Distinct Cystine Frameworks." Protein Engineering. 11. 649-659 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ogawa, K.: "Conformation analysis of eel Calcitonin Comparison with the Conformation of Elcatonin" Eur.J.Biochem.257. 331-336 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Uchiyama,S.: "Measurement of Thermodynamic Quantities in the Heating-Rate Dependent Thermal Transitions of Sequenced Polytripeptides." Chem.Phys.Lett.281. 92-96 (1997)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Kai,T.: "NMR Observation of Ttwo States of Triple Helix in the Thermal transition of(Pro-Pro-Gly)10." Chem.Phys.Lett.281. 86-91 (1997)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Hasegawa,J.: "Solution Structure of Thermostable Cytochrome c-552 from Hydrogenobacter thermophilus Determined by H-NMR Spectroscopy." Biochemistry. 37. 9641-9649 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Tamaoki,H.: "Folding Motifs Induced and Stabilized by Distinet Cystine Frameworks." Protein Engineering. 11. 649-659 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Ogawa,K,: "Conformation analysis of eel Calcitonin Comparison with the Conformation of Elcatonin," Eur.J.Biochem. 257. 331-336 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroaki Gouda: "Solution structure of α-conotoxin MI determined by ^1H-NMR spectroscopy and molecular dynamics simulation with the explicit solvent water" BIOCHIMICA ET BIOPHYSICA ACTA. 1343. 327-334 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] H.TaKashima: "Solution Structure of Neocarzinostatin Determined by Homonuclear Two-Dimensional Nuclear Magnetic Resonance." Neocarzinostatin:The Past,Present,and Future Anticancer Drug. 83-107 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] S.Uchiyama: "Measurement of thermodynamic quantities in the heating-rate dependent thermal transitions of sequenced polytripeptides" Chemical.Physics Letters. 281. 92-96 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Naoyoshi Chino: "Topological isomers of human urogiuanylin:interconversion between biologcally active and inactive isomers" FEBS Letters. 421. 27-31 (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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