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ダイズの育種選抜のためのDNAマーカーの開発

研究課題

研究課題/領域番号 09356001
研究種目

基盤研究(A)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 育種学
研究機関千葉大学

研究代表者

原田 久也  千葉大学, 園芸学部, 教授 (70011913)

研究分担者 高松 光生  長野県中信農業試験場, 畑作育種部, 研究員
石川 恵子  千葉大学, 大学院・自然科学研究科, 助手 (20212839)
木庭 卓人  千葉大学, 園芸学部, 助教授 (40170302)
紙谷 元一  北海道立中央農業試験場, 生物工学部, 科長
研究期間 (年度) 1997 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
26,500千円 (直接経費: 26,500千円)
2000年度: 2,500千円 (直接経費: 2,500千円)
1999年度: 3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
1998年度: 4,400千円 (直接経費: 4,400千円)
1997年度: 16,300千円 (直接経費: 16,300千円)
キーワードダイズ / マーカー選抜 / DNAマーカー / RFLP / マイクロサテライト / cDNA / QTL / recombinant inbred lines / RIL / PCR
研究概要

1.ダイズ品種「農林2号」の完全展開葉からcDNAライブラリーを作製し、無作為に選んだ約500のcDNAクローンを用いてRFLPマーカーを開発した。8種の6塩基認識酵素を用いて、6つの品種・ツルマメ系統の組み合わせでRFLPを解析した結果、多型頻度は34.4〜69.0%であり、多型性は従来報告されている結果よりもはるかに高かった。
2.ダイズ品種「農林2号」のゲノムDNAを用いて、ピペットによる物理的切断とDNaseI処理の後、電気泳動により300〜600bpの断片を回収して、T4DNA polymerase,T4polynucleotide kinaseを用いて、断片の平滑化、修復を行い、EcoRIアダプターを結合してLambda ZAPIIに導入してゲノムライブラリーを作製した。このライブラリーから(CT)10、(GAA)6,(GTG)6をプローブにして陽性クローンを単離した。CTとGAAについての陽性クローンを中心に塩基配列を決定、プライマーの設計を行い、約70のSSRマーカーを作出した。
3.「ミスズダイズ」と「秣食豆公503」を両親としたF2集団190個体を用いて、既知のマーカーと開発したcDNAクローンに基づくRFLPマーカー、SSRマーカーから成る連鎖地図を作製した。その結果503マーカー、21連鎖群、全長2,908.7cMの地図が得られ、主要連鎖群は染色体数20に一致した。
4.上記のF2集団を用いて開花期のQTL解析を行ったところ、4つの遺伝子座FT1、FT2、FT3、FT4が同定され、これらの遺伝子座により、開花期のほとんどの分散が説明できた。従って、ここで得られた連鎖地図はダイズゲノムの大部分を網羅していると推定された。
5.上記の集団の後代F8で156系統の組換え型近交系(recombinant inbred lines)を作製した。現在までにマーカー数232、連鎖群31の連鎖地図が得られ、F2で作製された地図と矛盾することはなかった。

報告書

(5件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (14件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (14件)

  • [文献書誌] Yamanaka,N.: "Quantitative trait locus analysis of flowering time in soybean using a RFLP linkage map."Breeding Science. 50. 109-115 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hossain,K.G.: "Characterization and identification of (CT)n microsatellites in soybean using sheared genomic libraries."DNA Research. 7. 103-110 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hayashi,M.: "Identification of AFLP markers tightly linked to the gene for deficiency of the 7S globulin in soybean seed and characterization of abnormal phenotypes involved in the mutation."Breeding Science. 50. 123-129 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamanaka,N.: "An informative linkage map of soybean reveals QTLs for flewering time, leaflet morphology and regions of segregation distortion."DNA Research. (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamanaka, N.et al.: "Quantitative trait locus analysis of flowering time in soybean using a RFLP linkage map."Breeding Science. 50. 109-115 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hossain, K.G.et al.: "Characterization and identification of(CT)n microsatellites in soybean using sheared genomic libraries."DNA Research. 7. 103-110 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Hayashi, M.et al.: "Identification of AFLP markers tightly linked to the gene for deficiency of the 7S globulin in soybean seed and characterization of abnormal phenotypes involved in the mutation."Breeding Science. 50. 123-129 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamanaka, N.et al.: "An informative linkage map of soybean reveals QTLs for flowering time, leaflet morphology and regions of segregation distortion."DNA Research. (in press). (2001)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamanaka,N.: "Quantitative treait locus analysis of flowering time in soybean using a RFLP linkage map."Breeding Science. 50・2. 109-115 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Hossain,K.G.: "Characterization and identification of (CT) n microsatellites in soybean using sheared genomic libraries."DNA Research. 7・2. 103-110 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] Yamanaka, N, et al.: "Quantitative trait locus analysis of flowering time in soybean using a RFLP linkage map"Breeding Science. 50・2. (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 紙谷元一: "ダイズわい化病抵抗性に関するDNAマーカーの探索 1.連鎖分析およびQTLマッピング" 日本育種学会・日本作物学会 北海道談話会会報. 第39号. 109-110 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 正木裕和: "ダイズゲノム中の(CT)をモチーフとしたマイクロサテライトとその周辺領域の構造解析" 育種学雑誌. 47巻別1号. 69- (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 山中直樹: "ダイズのcDNAクローンを用いたRFLP連鎖地図の作製" 育種学雑誌. 47巻別2号. 200- (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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