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主要型シグマ因子の生物機能と構造機能相関に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 09460046
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関東京大学

研究代表者

高橋 秀夫  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 教授 (90013333)

研究分担者 田中 寛  東京大学, 分子細胞生物学研究所, 助教授 (60222113)
研究期間 (年度) 1997 – 1999
研究課題ステータス 完了 (1999年度)
配分額 *注記
12,200千円 (直接経費: 12,200千円)
1999年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
1998年度: 4,500千円 (直接経費: 4,500千円)
1997年度: 6,000千円 (直接経費: 6,000千円)
キーワード主要型シグマ因子 / 定常期特異的転写開始因子 / σ^<38> / 大腸菌 / ラン藻 / シロイヌナズナ / プラスチド / 紅藻 / 定常期シグマ因子 / 葉緑体 / ホロ酵素 / rpoS / katE / sig遺伝子
研究概要

(1)大腸菌のrpoS^+およびrpoS欠損株(rpoS::Tn10)を用いることにより、rpoS依存性のkatEプロモーターは以前報告されていたものと異なる位置にあることを示し、更に転写開始点の7-8bp上流にσ^<70>およびσ^<38>依存性大腸菌プロモータと類似した配列が存在するが、明確な-35領域配列は確認できなかった。C末端領域(CTE)が高塩濃度に対応するためのσ^<38>特有の機能領域であることを突き止めた。(2)ラン藻Synechococcus PCC7942株のグループ2σ因子がin vitroでラン藻ならびに大腸菌の代表的プロモータの認識に関わることを明らかにした。また、既にゲノムの全塩基配列が決定されているSynechocystis sp.6803についてプロテオーム解析を行い、sigDおよびsigEの発現が窒素飢餓によって誘導されることを示した。(3)紅藻および高等植物(シロイヌナズナ、タバコ、イネ)について葉緑体(プラスチド)RNAポリメラーゼ・シグマ因子をコードする複数個の核遺伝子(sig)の存在を明らかにするとともに、それらの塩基配列(cDNA)を決定した。また、これらの遺伝子産物が大腸菌RNAポリメラーゼ・コア酵素に対してシグマ因子活性をもつことを示した。シロイヌナズナについてはsigA〜sigCの他、sigD,sigE,sigF遺伝子を新たに見い出した。それらの染色体上の位置を決定すると共にuid及びGFP融合遺伝子による形質転換体を用いることにより光誘導性、局在化、発生過程における発現制御について解析を行った。プラスチド(葉緑体)への局在化、発生過程における逐次的発現を確認した。

報告書

(4件)
  • 1999 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1998 実績報告書
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (26件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (26件)

  • [文献書誌] Y. Sugimoto et al.: "The rpoD1 gene of Synechococcus sp. Strain PCC7924 encodes the principal sigma factor of RNA polymerase"J. Geu. Appl. Microbiol. 43. 17-21 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Tauaka et al.: "Identification and analysis of the rpoSdepndent promoter of katE, encoding catalase HPII in Eschenchia coli."Biochim Biophys Acta. 1352. 161-166 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Shiba et al.: "Inroganic polyphosphate and the induction of rpoSexpression"Proc. Natl. Acad. Sci.. 94. 11210-11215 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Tanaka et al.: "Characterization of three cDNA species encoding plastid RNA polymerase sigma factors in Arabidopsis thaliana"FEBS Letters. 413. 309-313 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Y. Tozawa et al.: "Nuclear encoding of aplastid sigmafactorin rice and its tissue and light dependent expression"Nucleic Acids Res.. 15. 415-419 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Oikawa et al.: "Two types of differentiaty photo-regulated nudear genes that encodes factors forchloro plast RNA polymerase in the red alga Cyanidium Caldarium strain RK-1."Gene. 210. 277-285 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Goto-Seki et al.: "Specificity cross talk amon group 1 and group 2 sigma factors in the cyanobacterium Synechoococous sp. PCC7942"Mol Microbiol.. 34. 473-484 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] "Plastidic RNA polymerase factors in Arabidopsis"Plant Cell Physoil.. 40. 832-843 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sugimoto. Y., K. Tanaka, S. Masuda and H. Takahashi: "The rpoD1 gene of Synechococcus sp. Strain PCC7942 encodes the principal sigma factor of RNA polymerase"J. Gen. Appl. Microbiol.. 43. 17-21 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka, K., K. Handel, P.C. Lowen, and H. Takahashi: "Identification and analysis of the rpoS-dependent promoter of katE, encoding catalase HPII in Escherichia coli."Biochim. Biophys. Acta. 1352. 161-166 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Shiba, T., K. Tsutsumi, H. Yano, Y. Ihaia, A. Kameda, K. Tanaka, H. Takahashi, M. Munekata, N. N. Rao, and A. Kornberg: "Inorganic polyphosphate and the induction of rpoS expression"Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 94. 11210-11215 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka, K., Y. Tozawa, N. Mochizuki, K. Shinozaki, A. Nagatani, K. Wakasa, and H. Takahashi: "Characterization of three cDNA, species encoding plastid RNA polymerase sigma factors in Arabidopsis thaliana : Evidence for the sigma factor heterogeneity in higher plant plastids."FEBS Lett.. 413. 309-313 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tozawa, Y., K. Wakasa, K. Tanaka, and H. Takahashi: "Nuclear encoding of a plastid sigma factor in rice and its tissue-and light-dependent expression"Nucleic Acids Res.. 15. 415-419 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Oikawa, K., Tanaka, K., H. Takahashi: "Two types of differentially photo-regulated nuclear genes that encode s factors for chloroplast RNA polymerase in the red alga Cyanidium caldarium strain RK-1."Gene. 210. 277-285 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Takahashi, H.: "Transcriptional Control in Higher Plant Plastids (in Japanese)"Chemical Regulation in Plants (Shokubutsuno Kagaku Tyousetsu). 33. 169-181 (1998)

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    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Goto-Seki, M. Shirokane, S. Masuda, K. Tanaka and H. Takahashi: "Specificity crosstalk among group 1 and a phylogenetic analysis"Mol. Microbiol.. 34. 473-484 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Kanamaru, M. Fujiwara, M. Seki, T. Katagiri, M. Nakamura, N. Mochizuki, A. Nagatani, K. Shinozaki, K. Tanaka and H. Takahashi: "Plastidic RNA polymerase σ factors in Arabidopsis"Plant Cell Physiol.. 40. 832-842 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] A. Goto-Seki et al.: "Specificity crosstak among group 1 and group 2 sigma factors in the cyanobacterium Synodococcus PCC7942"Mol. Microbiol.. 34. 473-484 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K. Kanamaru et al.: "Plastidic RNA polymerase σ factors in Arabidopsis thaliana"Plant Cell Physiol.. 40. 832-842 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Tozawa, Y: "Nuclear encoding of a plastid sigma factor in rice and its tissde-and light-dependent expression" Nucleic Arids Res. 15. 415-419 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Oikawa, K.: "Two types of differentially photo-regulsted nuclear genes that encede sigma factors for clles oplast" Gene. 210. 277-285 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 高橋秀夫: "高等植物プラスチドにおける転写制御" 植物の化学調節. 33. 169-181 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Sugimoto: "The rpoD1 gene of synechococcus sp.PCC7942 encodes the principal sigma factor of RNA polymerase" J.Geu.Appl.Microbiol.43. 17-21 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Tanaka: "Identification and analysis of the rpoS-dependent promoter of katE encoding HPTL in Escherichia cobi" Biochem.Biophys.Acta. 1352. 161-166 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Shiba: "Inorganic pdyphosphate and the induction of rpoS expression" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94. 11210-11215 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Tanaka: "Characterization of three cDNA species encoding plastid RNA polymerase sigma factors in Arabidopsis thaliaua." FEBS Lett.413. 309-313 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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