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フリーラジカルを生成する金属フラビン酵素の構造と機能

研究課題

研究課題/領域番号 09480167
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 機能生物化学
研究機関日本医科大学

研究代表者

西野 武士  日本医科大学, 医学部, 教授 (40094312)

研究分担者 岡本 研  日本医科大学, 医学部, 助手 (60267143)
松村 智裕  日本医科大学, 医学部, 助手 (20297930)
岩崎 俊雄  日本医科大学, 医学部, 講師 (40277497)
堀 弘幸  日本医科大学, 医学部, 助手 (20256960)
永原 則之  日本医科大学, 医学部, 助教授 (10208043)
研究期間 (年度) 1997 – 2000
研究課題ステータス 完了 (2000年度)
配分額 *注記
12,200千円 (直接経費: 12,200千円)
2000年度: 2,800千円 (直接経費: 2,800千円)
1999年度: 2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
1998年度: 2,400千円 (直接経費: 2,400千円)
1997年度: 4,700千円 (直接経費: 4,700千円)
キーワード活性酸素 / キサンチン脱水素酵素 / キサンチン酸化酵素 / 金属タンパク質 / X線結晶解析 / 非ヘム鉄 / ペルオキシレドキシン / 鉄結合タンパク質 / NO合成酵素 / 金属フラビン酵素 / セロビオース脱水素酵素 / 電子スピン共鳴 / X線結晶構造 / フリーラジカル / EPR / nNOS / Xanthine Oxidase / Xanthine Dehydrogenase / Flavoprotein / metalloprotein / free radical / nitric oxide / super oxide anion
研究概要

1.キサンチン脱水素酵素・タンパク分解酵素による酸化酵素のそれぞれの2.1、2.5Å分解能のX線結晶構造の違いを解析し、コンフォメション変化の生ずる理由を解明した。X-線結晶解析で得た構造としては最長のアミノ酸配列である。蛋白は2量体でそれぞれ3つの大きなドメインからなり、モリブドプテリン、2つの非ヘム鉄、フラビンは一列をなし、電子伝達経路が確定した。脱水素酵素型、酸化酵素型ではフラビン周囲のコンフォメーションが異なった。この差は、タンパク質分解酵素作用によりフラビンドメインとモリブデンドメインを結ぶ長鎖リンカーの切断により、F549とR335、R429との水素結合ネットワークが断たれ、それに伴いW336とR427-D429の相互作用が切断され結果としてD429のフラビン環6位近傍からの遠ざかりとR427の接近が生ずる結果である。これらの電荷をもつ残基の置換とともにNADの接近のブロックが生ずる。またF337Lの変異体を作成し、この酵素が殆どスーパーオキシドのみを産生することを見い出した。その理由はセミキノンをより安定化させることによることを確認し、以前の我々の予想と一致した。
2.NO合成酵素の2量体形成およびヘム周囲のXAFS解析を行った。またNO合成酵素の阻害剤のアイソザイム特異性を検討した。
3.箱嶋らと共同でおこなったHBP23の立体構造の解析結果をもとに、活性中心のCys52,Cys173およびその周辺のアミノ酸残基の変異体を作成し、それぞれの役割を解析した。ヘム結合の様式を可視部吸収スペクトル、ラマン分光により解析しリガンドを予想した。ヘム結合により過酸化水素分解活性が阻害されることを見い出した。

報告書

(5件)
  • 2000 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1999 実績報告書
  • 1998 実績報告書
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (50件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (50件)

  • [文献書誌] T.Iwasaki,K.Okamoto,T.Nishino,J.Mizushima,H.Hori,and T.Nishino.: "Sequence Motif- specific Assignment of Two [2Fe-2S] Clusters in Rat Xanthine Oxidoreductase Studied by Site-directed Mutagenesis"J.Biochem. 127. 771-778 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Kitagawa,M.Morisima,T.Nishino,and E.Kimura.: "(Review) Progress on "Molecular Biometallics" as a Project of the Priority Areas for Research under the Auspices of Japanese Government"J.Biol.Inorg.Chem.. 5. 410-415 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Nishino and K.Okamoto.: "(Reveiew) The Role of the [2Fe-2S] Cluster Centers in Xanthine Oxidoreductase."J.Inorg.Biochem.. 82. 43-49 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] C.Enroth,B.T.Eger,K.Okamoto,T.Nishino,T.Nishino,and E.F.Pai.: "Crystal Structures of Bovine Milk Xanthine Dehydrogenase and Xanthine Oxidase : Structure-Based Mechanism of Conversion"Proc.Natle.Acad.Sci.,USA. 97. 10723-10728 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] B.T.Eger,K.Okamoto,C.Enroth,M.Sato,T.Nishino,E.F.Pai,and T.Nishino.: "Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of xanthine Dehydrogenase and xanthine Oxidase isolated from bovine milk."Acta Cryst.. D56. 1656-1658 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Park,T.Higuchi,K.Kikuchil,Y.Urano,H.Hori,T.Nishino,J.Aoki,K.Inoue & T.Nagano: "Selective inhibition of human inducible nitric oxide synthase by S-alkyl-L-isothiocitrulline-containing dipeptides."Brithish J.Pharm.. 274(in press).

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 広津晶子,阿部靖子,西野武士,箱嶋敏雄: "ペルオキシレドキシンの分子機能の構造的基盤"蛋白質・核酸・酵素. 45. 2463-2474 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Iwasaki,,H.Hori,Y,Hayashi, et al.(Nishino,T.): "Characterization of mouse nN0S2, a natural variant of neuronal nitric-oxide synthase produced in the central nervous system by selective alternative splicing."J.Biol.Chem.. 274. 17559-17566 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Nishino etcetera: "FLAVINS AND FLAVOPROTEINS"RUDOLF WEBER AGENCY FOR SCIENTIFIC PUBLICATIONS. 26 (1999)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Iwasaki, K.Okamoto, T.Nishino, J.Mizushima, H.Hori, and T.Nishino.: "Sequence Motif-specific Assignment of Two [2Fe-2S] Clusters in Rat Xanthine Oxidoreductase Studied by Site-directed Mutagenesis"J.Biochem.. 127. 771-778 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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  • [文献書誌] T.Kitagawa, M.Morisima, T.Nishino, and E.Kimura.: "(Review) Progress on "Molecular Biometallics" as a Project of the Priority Areas for Research under the Auspices of Japanese Government"J.Biol.Inorg.Chem.. 5. 410-415 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Nishino and K.Okamoto.: "(Reveiew) The Role of the [2Fe-2S] Cluster Centers in Xanthine Oxidoreductase."J.Inorg.Biochem.. 8243-49 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] C.Enroth, B.T.Eger, K.Okamoto, T.Nishino, T.Nishino, and E.F.Pai.: "Crystal Structures of Bovine Milk Xanthine Dehydrogenase and Xanthine Oxidase : Structure-Based Mechanism of Conversion"Proc.Natle.Acad.USA. 97. 10723-10728 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] B.T.Eger, K.Okamoto, C.Enroth, M.Sato, T.Nishino, E.F.Pai, and T.Nishino.: "Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of xanthine Dehydrogenase and xanthine Oxidase isolated from bovine milk."Acta Cryst.. D561656-1658 (2000)

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] J.Park, T.Higuchi, K.Kikuchi1, Y.Urano, H.Hori, T.Nishino, J.Aoki, K.Inoue & T.Nagano: "Selective inhibition of human inducible nitric oxide synthase by S-alkyl-L-isothiocitrulline-containing dipeptides."Brithish J.Pharm.. 274(in press).

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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Iwasaki, , H.Hori, Y,Hayashi, et al.(Nishino, T.): "Characterization of mouse nNOS2, a natural variant of neuronal nitric-oxide synthase produced in the central nervous system by selective alternative splicing."J.Biol.Chem.. 274. D561656-1658 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      2000 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Iwasaki,K.Okamoto,T.Nishino,J.Mizushima,H.Hori,and T.Nishino.: "Sequence Motif-specific Assignment of Two [2Fe-2S] Clusters in Rat Xanthine Oxidoreductase Studied by Site-directed Mutagnesis"J.Biochem.. 127. 771-778 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Kitagawa,M.Morisima,T.Nishino,and E.Kimura.: "(Review) Progress on "Molecular Biometallics" as a Project of the Priority Areas for Research under the Auspices of Japanese Government"J.Biol.Inorg.Chem.. 5. 410-415 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino and K.Okamoto.: "(Reveiew) The Role of the [2Fe-2S] Cluster Centers in Xanthine Oxidoreductase."J.Inorg.Biochem.. 82. 43-49 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] C.Enroth,B.T.Eger,K.Okamoto,T.Nishino,T.Nishino,and E.F.Pai.: "Crystal Structures of Bovine Milk Xanthine Dehydrogenase and Xanthine Oxidase : Structure-Based Mechanism of Conversion"Proc.Natle.Acad.Sci.,USA. 97. 10723-10728 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] B.T.Eger,K.Okamoto,C.Enroth,M.Sato,T.Nishino,E.F.Pai,and T.Nishino.: "Purification, crystallization and preliminary X-ray diffraction studies of xanthine Dehydrogenase and xanthine Oxidase isolated from bovine milk."Acta Cryst.. D56. 1656-1658 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] J.Park,T.Higuchi,K.Kikuchi1,Y.Urano,H.Hori,T.Nishino,J.Aoki,K.Inoue & T.Nagano: "Selective inhibition of human inducible nitric oxide synthase by S-alkyl-L-isothiocitrulline-containing dipeptides."Brithish J.Pharm.. 274(in press).

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] 広津晶子,阿部靖子,西野武士,箱嶋敏雄: "ペルオキシレドキシンの分子機能の構造的基盤"蛋白質・核酸・酵素. 45. 2463-2474 (2000)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino etcetera: "FLAVINS AND FLAVOPROTEINS"RUDOLF WEBER AGENCY FOR SCIENTIFIC PUBLICATIONS. 26 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] T.Iwasaki,,H.Hori,Y.Hayashi, et al. (Nishino,T.): "J.Biol.Chem."Characterization of mouse nNOS2, a natural variant of neuronal nitric-oxide synthase produced in the central nervous system by selective alternative splicing.. 17559-17566 (1999)

    • 関連する報告書
      2000 実績報告書
  • [文献書誌] H.Hori,T.Iwasaki,Y.Kurahashi, and T.Nishino: "Calcium Dependent Inactivation of Neuronal Nitric Oxide Synthase: Evidence for the Existence of Stabilization/Activation Factor."Biochem. Biophys. Res. Commun.. 234. 476-480 (1997)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino and T.Nishino: "Conversion of the dehydrogenase type to the oxidase type of rat liver xanthine dehydrogenase by midification of cysteine residues with fluorodinitrobenzene."J. Biol. Chem.. 272. 29859-29864 (1997)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K.Igarashi,M.Verhagen,M.Samejima,M.Schulein,K.L.Eriksson and T.Nishino: "Cellobiose dehydrogenase from the fungi Phanerochaete chrysoporium and Humicola insolens; A flavoprotein from Humicola insolens contains 6-hydroxy-FAD as the dominant active cofactor."J. Biol. Chem.. 274. 3338-3344 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ichimori,M.Fukahori,H.Nakazawa,K.Okamoto and T.Nishino: "Inhibition of xanthine oxidase and xanthine dehydrogenase by nitric oxide; nitric oxide converts reduced xanthine oxidizing enzymes into the desulfo-type inactive form."J. Biol. Chem.. 274. 7763-7768 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] T.Iwasaki,H.Hori,Y.Hayashi,T.Nishio,: "Modulation of the remote heme site geometry of recombinant mouse neuronal nitric oxide synthase by the N-terminal hook region."J. Biol. Chem.. 274. 7705-7713 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] T.Iwasaki,H.Hori,Y.Hayashi,T.Nishino,K.Tamura,S.Oogami,T.Iizuka,T.Ogura and H.Esumi: "Characterization of mouse nNOS2, a natural variant of neuronal nitric-oxide synthase produced in the central nervous system by selective altemative splicing."J. Biol. Chem.. 274. 17559-17566 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] S.Hirotsu,Y.Abe,S.Iwahashi,H.Hori,T.Nishino,K.Okada, and T.Hakoshima: "Crystallographic characterization of a stress-induced multifunctional protein, rat HBP23""J. Struct. Biol.. 126. 80-83 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] S.Hirotsu,Y.Abe,K.Okada,N.Nagahara,H.Hori,T.Nishino, and T.Hakoshima: "Crystal strucure of a multifunctional 2-Cys peroxiredoxin, HBP23/PAG"Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 96. 12333-12338 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Ichida K.Kamatani N.Nishino T.Saji M.Okabe H.Hosoya T.: "Mutations in xanthine dehydrogenase gene in subjects with hereditary xanthinuria" Adv.Exp.Med.Biol.431. 327-330 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] N.Nagahara, Ito T.Kitamura H.and T.Nishino: "Tissue and subcellular distribusion of mercaptopyruvate sulfur transferase in rat" Histochem.Cell Biol.10. 243-250 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Otsubo, Y., Hori, H., Nishino, T.and Araki, T.: "Comparison of nitric oxide synthase in normal human placenta from 37 to 41 weeks gestation" J.Maternal-fetal Inves.8. 139-144 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] K.Igarashi, M.Verhagen, M.Samejima, M.Schulein, K.L.Eriksson and T.Nishino: "Cellobiose dehydrogenase from the fungi Phanerochaete chrysoporium and Humicola insolens" J.Biol.Chem.274. 3338-3344 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ichimori, M.Fukahon, H.Nakazawa, K.Okamoto and T.Nishino: "Inhibition of xanthine oxidase and xanthine dehydrogenase by nitric oxide" J.Biol.Chem.274. 7763-7768 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Iwasaki, H.Hori,Y.Hayashi, T.Nishino: "Modulation of the remote heme site geometry of recombinant mouse neuronal nitric oxide synthase by the N-terminal hook region" J.Biol.Chem.274 in press.

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Iwasaki, H.Hori, Y.Hayashi, T.Nishino, K.Tamura, S.Oogami, T.Iizuka, T.Ogura and H.Esumi: "Characterization of nNOS, a natural valiant of neuronal nitric oxide synthase constitutively produced in mouse brain by selective alternative splicing" J.Biol.Chem.274 in press.

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino,T.Nishino,K.Okamoto,S.Nakanishi,H.Hori,T.Iwasaki,Y.Ichimori,H.Nakazawa: "Conversion of xanthine dehydrogenase to oxidase and role of reperfusion injury." Biochem.Trans.25,. 783-786 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ichida,Y.Amaya,N.Kamatani,T.Nishino,T.Hosoya,O.Sakai: "Identification of two mutations in human xanthine dehydrogenase gene responsible for classical type I xanthinuria." J.Clin.Inves.99,. 2391-2397 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino and T.Nishino: "Conversion of the dehydrogenase type to the oxidase type of rat liver xanthine dehydrogenase by midification of cysteine residues with fluorodinitrobenzene." J.Biol.Chem.272,. 29859-29864 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] H.Hori,T.Iwasaki,Y.Kurahashi,T.Nishino: "Calcium Dependent Inactivation of Neuronal Nitric Oxide Synthase:Evidence for the Existence of Stabilization / Activation Factor." Biochem.Biophys.Res.Commun.234,. 476-480 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Otsubo,H.Hori,R.Sawa,S.Susumi,T.Nishino T.Araki.: "Activity and isoform of Nitric oxide Synthase in Human Placenta." J.Jpn.Soc.Women Nutr.Metab.3,. 16-18 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] H.Hori,T.Iwasaki,Y.Kurahashi,Y.Hayashi,M.Umeda,T.Nishino.: "Effect of phospholipids on calcium-dependent inactivation of neuronal nitric oxide synthase." Jpn.J.Pharmacol.75,. 26 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino,Y.Kashima,K.Okamoto,T.Iwasaki,T.Nishino: "Favins and Flavoproteins,Calgary Press," K.Stevenson,CH.Williams and V.Massey eds., 843-846 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Y.Niimura,K.Ohnishi,et al.,T.Nishino: "Favins and Flavoproteins,Calgary Press," K.Stevenson,CH.Williams and V.Massey eds., 741-750 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Okamoto,T.Nishino: "Favins and Flavoproteins,Calgary Press," K.Stevenson,CH.Williams and V.Massey eds., 839-842 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Nishino,K.Okamoto,H.Hori and T.Nishino S.Nakanishi,: "Oxygen homeostasis and its dynamic,Springer-Verlag," Y.Ishimura et al.eds., 333-339 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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