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H^+-ATP合成酵素の溶液および個体多次元NMRによる構造・機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 09480173
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関横浜国立大学

研究代表者

阿久津 秀雄  横浜国立大学, 工学部, 教授 (60029965)

研究分担者 小澤 潔  横浜国立大学, 工学部, 助手 (20251770)
藤原 敏道  横浜国立大学, 工学部, 助教授 (20242381)
研究期間 (年度) 1997 – 1999
研究課題ステータス 完了 (1999年度)
配分額 *注記
12,600千円 (直接経費: 12,600千円)
1999年度: 3,500千円 (直接経費: 3,500千円)
1998年度: 4,100千円 (直接経費: 4,100千円)
1997年度: 5,000千円 (直接経費: 5,000千円)
キーワードH^+-ATP合成酵素 / F_1-ATPasa / NMR / 固体NMR / H^+-ATP合成酵素βサブユニット / H^+-ATP合成酵素cサブユニット / 化学合成 / F_1-ATPase / H^+-ATP合成酵素Cサブユニット / H^+-STPA式酵素Cサブユニット
研究概要

本研究においては溶液NMRを用いてβサブユニットの構造変化の解析を行い、固体NMRの方法論を開発しつつ、サブユニットcの合成と固体NMRによる解析に取り組んだ。溶液NMRでは、チロシンとヒスチジン残基に注目し、これらのプロトンシグナルをアミノ酸置き換えにより帰属し、ヌクレオチドの結合による構造変化を見いだした。この構造変化はF_1-ATPasaの回転の原動力の一つになると考えられる。さらに詳しい構造情報を得るために、重水素化βサブユニットを^<15>N標識し、2次元HSQCスペクトルを測定した。その結果、アミド領域のプロトンシグナルが^<15>Nによって分離にて観測された。またTROSYを測定することによって8割程度のアミドプロトンが分離して観測された。また、ATP-TF_1βサブユニット複合体を調製し、固体^<31>P-NMRによる解析を行った。ATPのリンのシグナルの帰属を行ったところ、ATPの結晶構造とはかなり異なることが明らかになった。さらに、固体NMRを用いて膜結合部分であるH^+-ATP合成酵素Foを研究することを目指して、サブユニットcの合成に取り組んだ。その結果、化学的な合成法と大腸菌を用いた生合成法を確立した。化学合成法によりアミノ酸の選択標識を行った[3-^<13>C[Ala-24,[4-^<13>C]Asp-61 subunit cを合成し、精製した。大腸菌による大量発現系では^<15>N-Glysubunit cの合成と精製を行った。さらに、^<15>N-Gly subunit cをDPPCの中に再構成し、固体NMR測定をCP-MAS法を用いて測定した。この測定でシグナルが観測されたことにより、今回のような精製法により得られた^<15>N-Gly subunit c試料で、固体NMR測定が可能であることが分かった。さらに、このシグナルの解析から、膜中においても有機溶媒でとっていたヘリックス構造をとっている可能性が高いことが明らかになった。

報告書

(4件)
  • 1999 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1998 実績報告書
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (34件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (34件)

  • [文献書誌] S. Kim: "Osmotic stability of muramyl dipeptide-bearing liposomes and molecular miscibility in their membranes"Bull. Chem. Soc. Jpn.. 72. 541-548 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Yagi: "Functional confomational changes in the TF, ATPase β subunit probed by twelve tyosine residues"biophys. J.. 77. 2175-2183 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Fukushima: "Structural analysis of mastoparan by solid-state nuclear magnetic resonance in "Peptide Science- Present and Future"(ed. Y. Shimonishi), PP."Kluwer Acad. Pub.. 294-296 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S. Yoshioka: "Molecular mobility of protein in lyophilized formulations linked to the molecular mobility of polymer excipients, as determined by high resolution solid-state ^<13>C NMR"Pharmaceutical Res.. 16. 1621-1625 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Ozawa: "Evidence for the presence of F-type ATPsynthase involved in sulfate-respiration in Desulfovibrio vulgaris"J. Bacteriol.. (in press).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Fujiwara: "Compound radio-frequency driven recoupling pulse sequences for efficient magnetization transfer by homonuclear dipolar interaction under magic angle spinning conditions"J. Magn. Reson.. (in press).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 阿久津秀雄、河野敬一: "多核NMR-自然を複眼で見る-"廣川書店. 147 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S. Kim, K. Shin, T. Fujiwara and H. Akutsu: "The interactions of ferric and ferrous cytochrome c with cardiolipin in phospholipid membranes studies by solid-state ィイD12ィエD1H and ィイD131ィエD1P NMR"J. Mol. Struct.. 441. 183-188 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Yagi, K. Tozawa, N. Sekino, T. Iwabuchi, M. Yoshida, and H. Akutsu: "Functional conformational changes in the TFィイD21ィエD2 ATPase βsubunit probed by twelve tyrosine residues"Biophys. J.. 77. 2175-2183 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S. Yoshioka, Y. Asao, S. Kojima, S. Sakurai, T. Fujiwara and H. Akutsu: "Molecular mobility of protein in lyophilized formulations linked to the molecular mobility of polymer excipients, as determined by high resolution solid-state ィイD113ィエD1C NMR"Pharmacutical Res.. 16. 1621-1625 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Fukushima, S. -M. Kim, T. Fujiwara, T. Kohno, K. Wakamatsu, S. -W. Kang, and H. Akutsu: "Structural analysis of mastoparan by solid-state nuclear magnetic resonance"in _Peptide Science-Present and Future_ (ed. Y. Shimonishi), pp. 294-296, Kluwer Acad. Pub., Dordrecht. (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K. Ozawa, T. Meikari, K. Motohashi, M. Yoshida, and H. Akutsu: "Evidence for the presence of F-type ATPsynthase involved in sulfate-respiration in Desulfovibrio vulgaris"J. Bacteriol.. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T. Fujiwara, P. Khandelwal, and H. Akutsu: "Compound radio-frequency driven recoupling pulse sequences for efficient magnetization transfer by homomuclear dipolar interaction under magic angle spinning conditions"J. Magn. Reson.. (in press).

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    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H. Akutsu and K. Kawano: "Nultinuclear NMR (in Japanese)"Hirokawashoten, Tokyo. (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Kim: "Osmotic stability of muramyl dipeptide-bearing liposomes and molecular miscibility in their membranes"Bull. Chem. Soc. Jpn.. 72. 541-548 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] H.Yagi: "Functional conformational changes in the TF_1 ATPase β subunit probed by twelve tyrosine residues"Biophys. J.. 77. 2175-2183 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K.Fukushima: "Structural analysis of mastoparan by solid-state nuclear magnetic resonance in "Peptide Science - Present and Future" (ed. Y. Shimonishi)"Kluwer Acad. Pub.. 294-296 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] S.Yoshioka: "Molecular mobility of protein in lyophilized formulations linked to the molecular mobility of polymer excipients, as determined by high resolution solid-state ^<13>C NMR"Pharmaceutical Res.. 16. 1621-1625 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ozawa: "Evidence for the presence of F-type ATPsynthase involved in sulfate-respiration in Desulfovibrio vulgaris"J. Bacteriol.. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] T.Fujiwara: "Compound radio-frequency driven recoupling pulse sequences for efficient magnetization transfer by homonuclear dipolar interaction under magic angle spinning conditions"J. Magn. Reson.. (in press).

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] 阿久津 秀雄,河野 敬一: "多核NMR 自然を複眼で見る"広川書店. 147 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] S.Kim: "The Interactions of ferric and ferrous cytochrome c with cardiolipin in phospholipid membranes studied by solid-state ^2H and ^<31>P NMR." J.Mol.Struct.441. 183-188 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Odahara: "Membrane dynamics in the intact PM2 phage and its host cells as monitored by T_1ρ(H)." Biochim.Biophys.Acta.1369. 240-246 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Ishida: "A primitive pathway of porphyrin biosynthesis and enzymology in Desulfovibrio vulgaris." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 4853-4858 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Ohmura: "Paramagnetic Inversion of the sign of the interference contribution to the transverse relaxation of the imido protons of the coordinated imidazoles in the uniformly ^<15>N labeled cytochrome c_3" J.Magn.Reson.131. 367-372 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Fujiwara: "Multidimensional solid-state NMR for determining dihedral angle from the correlation of ^<13>C-^1H and ^<13>C-^<13>C dipolar interactions under magic-angle spinning conditions." J.Chem.Phys.109. 2380-2393 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Ohmura: "Ionic-strength dependent physicochemical factors in cytochrome c_3 regulating the electron transfer rate." Biophys.J.75. 1483-1490 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 阿久津秀雄: "構造生物学とその解析法(分担)" 共立出版, 14 (1997)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] T.Fujiwara: "Multidimensional solid-state nuclear magnetic resonance for correlating anisotropic interactions under magic-angle spinning conditions." J.Magn.Reson.124. 147-153 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] M.Kitamura.: "Cloning and expression of the rubredoxin gene from Desulfovibrio vulgaris(Miyazaki F)-Comparison of the primary structure of desulfoferrodoxin-" Biochim.Biophys.Acta. 1351. 239-247 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Ozawa: "Membrane-bound cytochromes in a sulfate-reducing strict anaerobe Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F." Anaerobe. 3. 339-346 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] S.Kim: "The interactions of ferric and ferrous cytochrome c with cardiolipin in phospholipid membranes studied by solid-state ^2H and ^<31>PNMR." J.Mol.Struct.(印刷中).

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] T.Odahara: "Membrane dynamics in the intact PM2 phage and its host cells as monitored by T_1p(H)." Biochim.Biophys.Acta. (印刷中).

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] K.Noda: "Langmuir-Blodgett film of hydrogenase for electrochemical hydrogen production." Thin Solid Films. (印刷中).

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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