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損傷特異的プローブ分子を用いたDNA損傷の高感度定量法の開発と応用

研究課題

研究課題/領域番号 09558070
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 環境影響評価(含放射線生物学)
研究機関広島大学

研究代表者

井出 博  広島大学, 理学部, 教授 (30223126)

研究分担者 久保 喜平  大阪府立大学, 農学部, 教授 (40117619)
寺東 宏明  広島大学, 理学部, 助手 (00243543)
大山 義彦  広島大学, 理学部, 助教授 (30169081)
佐々本 一美  株式会社同仁化学研究所, 研究部長
佐々木 一美  (株)同仁化学研究所, 研究部長
研究期間 (年度) 1997 – 1999
研究課題ステータス 完了 (1999年度)
配分額 *注記
8,100千円 (直接経費: 8,100千円)
1999年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
1998年度: 2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
1997年度: 4,300千円 (直接経費: 4,300千円)
キーワードDNA損傷 / 脱塩基部位 / ARP / 定量 / DNA修復 / MPG / アルキル化 / アベイシックサイト / デプリネーション / 脆弱部位 / ビオチン / ウラシル
研究概要

脱塩基部位(AP site)は,最も普遍的なDNA損傷であり,生物の遺伝情報変異機構を解明する上で極めて重要な損傷である.本研究では、プローブ分子(ARP)を用いたAP siteの高感度定量法の確立とDNA修復研究への応用を行った.
DNAの固相化に用いるプレートの検討では,従来のUV照射プレートに比べアミノプレートは約10倍のDNA結合能を有していること,さらに、プロタミンプレートでは固相化時間が短縮できることが明らかとなった。また,微量なAP siteを定量するために、スタンダードDNAを異なる濃度で固相化し,シグナルとの相関性を調べた結果,異なったDNA濃度で固相化しても測定値が比較可能であることが示された.
生存率に影響を与えない濃度のMMSで処理したRC355細胞のDNA中に生じるAP siteの定量を試みた結果,100%生存濃度(0.5mM)のMMS処理細胞のDNAにおいても,10^5ヌクレオチドあたり約0.5個のAP siteを検出した.
hMPGの損傷に対する活性を,ARP法および従来の酵素プローブ法を用いて比較検討した.酵素活性の測定は,3-mA,7-mG,Hx,εAを含むDNAとhMPGを反応後,AP siteをARPを用いて直接的に,あるいは,Endo IV処理により鎖切断に変換して定量した.その結果,メチルプリン(3-mAおよび7-mGを含む)に対するhMPG活性は,他の基質に村する活性の約5倍高いことが明らかとなった.
ARPの広範な応用を目指して基礎・応用研究を重ねた結果,本試薬は新製品としてDOJIN社より市販が開始され,その後,標準DNA及びDNA固相化プレートを組み合わせることによりキット化された.以上,本研究の結果,簡便かつ高感度なDNA損傷検出システムが確立され汎用されるに至った.

報告書

(4件)
  • 1999 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1998 実績報告書
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (38件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (38件)

  • [文献書誌] Ide,H.: "Antibodies to oxidative DNA damage:Characterization of antibodies to 8-oxopurines"Cell Biology and Toxicology.

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 井出 博: "酸化的損傷を特異的に含むDNA基質と生化学研究への応用"放射線生物研究. 32. 307-325 (1997)

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  • [文献書誌] Asaeda A.: "Repair kinetics of abasic sites in mammalian cells selectively monitored by the aldehyde reactive prove(ARP)"Nucleosides Nucleotides. 17. 503-513 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Asaeda A.: "Highly sensitive assay of abasic sites in mammalian cells.Optimization of aldehyde reactive prove(ARP)method"Analytica Chimica Acta. 365. 35-41 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kubo K.: "Induction of fragile sites by fluorodeoxyuridine and caffeine accompanieswith misincorpolation of endogenous uridine nucleotide into DNA of feline fibroblasts"Journal of Veterinary Medical Science. 60. 1293-1297 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki T.: "Misincorporation of 2'-deoxyoxanosine 5'-triphosphate by DNA polymreases and its implication to mutagenesis"Biochemistry. 37. 11592-11598 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Terato,H.: "Recognition of oxidative thymine damage by DNA repair enzymes"Nucleic Acids Symposium Series. 39. 237-238 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Terato,H.: "Formation of highly fluorescent adducts between 2'-deoxyguanosine and amino acids by ionizing radiation"Analytica Chimica Acta. 365. 183-191 (1998)

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  • [文献書誌] Oka,S.: "Flow cytometric analysis of thymocyte subpopulations in mice after whole-body Xirradiation"Journal of Veterinary Medical Science. 61. 709-712 (1999)

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  • [文献書誌] Suzuki,T.: "Formation of 2'-deoxyoxanosine from 2'-deoxyguanosine and nitrous acid:mechanism and intermediates"Nucleic Acids Research. 28. 544-551 (2000)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Asaeda,A.: "Substrate specificity of human methylpurine DNA N-glycosylase"Biochemistry. 39. 1959-1965 (2000)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide. H. et al.: "Antibodies to oxidative DNA damage : Characterization of antibodies to 8-oxopurines"Cell Biology and Toxicology. 13. 405-417 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ide. H.: "Preparation of DNA substrates containing specific oxidative damage and their application for biochemical research."Radiation Biology Research Communications. 32. 307-325 (1997)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Asaeda A. et al.: "Repair kinetics of abasic sites in mammalian cells selectively monitored by the aldehyde reactive prove (ARP)."Nucleosides Nucleotides. 17. 503-513 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Asaeda A. et al.: "Highly sensitive assay of abasic sites in mammalian cells. Optimization of aldehyde reactive prove (ARP) method."Analytica Chimica Acta. 365. 35-41 (1998)

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      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kubo K. et al.: "Induction of fragile sites by fluorodeoxyuridine and caffeine accompanieswith misincorpolation of endogenous uridine nucleotide, into DNA of feline fibroblasts."Journal of Veterinary Medical Science. 60. 1293-1297 (1998)

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    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki T. et al.: "Misincorporation of 2'-deoxyoxanosine 5'-triphosphate by DNA polymreases and its implication to mutagenesis."Biochemistry. 37. 11592-11598 (1998)

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    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Terato, H. et al.: "Recognition of oxidative thymine damage by DNA repair enzymes."Nucleic Acids Symposium Series. 237-238 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Terato, H. et al.: "Formation of highly fluorescent adducts between 2'-deoxyguanosine and amino acids by ionizing radiation."Analytica Chimica Acta. 365. 183-191 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Oka, S. et al.: "Flow cytometric analysis of thymocyte subpopulations in mice after whole-body X-irradiation."Journal of Veterinary Medical Science. 61. 709-712 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki, T. et a1.: "Formation of 2'-deoxyoxanosine from 2'-deoxyguanosine and nitrous acid : mechanism and intermediates."Nucleic Acids Research. 28. 544-551 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Asada A. et al.: "Substrate specificity of human methylpurine DNA N-glycosylase."Biochemistry. 39. 1959-1965 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1999 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki,T.: "Isolation and characterization of diazoate intermediate upon nitrous acid and nitric oxide treatment of 2'-deoxycytidine."Biochemistry. 38. 7151-7158 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Masaoka,A.: "Enzymatic repair of 5-formyluracil.I.Excision of 5-formyluracil site-specifically incorporated into oligonucleotide substrates by AIKA protein (Escherichia coli 3-methyladenine DNA glycosylase II)."Journal of Biological Chemistry. 274. 25136-25143 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Terato,H.: "Enzymatic repair of 5-formyluracil.II.Mismatch formation between 5-formyluracil and guanine during DNA replication and its recognition by two proteins involved in base excision repair(AIKA) and mismatch repair(MutS)."Journal of Biological Chemistry. 274. 25144-25150 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Oka,S.: "Flow cytometric analysis of thymocyte subpopulations in mice after whole-body X-irradiation."Journal of Veterinary Medical Science. 61. 709-712 (1999)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki,T.: "Formation of 2'-deoxyoxanosine from 2'-deoxyguanosine and nitrous acid:mechanism and intermediates."Nucleic Acids Research. 28. 544-551 (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Asaeda,A.: "Substrate specificity of human methylpurine DNA N-glycosylase."Biochemistry. 39(印刷中). (2000)

    • 関連する報告書
      1999 実績報告書
  • [文献書誌] Asaeda A: "Repair kinetics of abasic sites in mammalian cells selectively monitored by the aldehyde reactive prove(ARP)" Nucleosides Nucleotides. 17. 503-513 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Asaeda A: "Highly sensitive assay of abasic sites in mammalian cells.Optimization of aldehyde reactive prove(ARP)method." Analytica Chimica Acta. 365. 35-41 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Kubo K.: "Induction of fragile sites by flurodeoxyuridine and caffeine accompanieswith misincorpolation of endogenous uridine nucleotide into DNA of feline fibroblasts." Journal of Veterinary Medical Science. 60. 1293-1297 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki T.: "Misincorporation of 2'-deoxyoxanosine 5'-triphosphate by DNA polymreases and its implication to mutagenesis." Biochemistry. 37. 11592-11598 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Terato,H.: "Recognition of oxidative thymine damage by DNA repair enzymes." Nucleic Acids Symposium Series. 39. 237-238 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Terato,H.: "Formation of highly fluorescent adducts between 2'-deoxyguanosine and amino acids by ionizing radiation." Analytica Chimica Acta. 365. 183-191 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Hiroshi Ide: "Antibodies to oxidative DNA damage : Characterization of antibodies to 8-oxopurines" Cell Biology and Toxicology. 13. 405-417 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 井出 博: "酸化的損傷を特異的に含むDNA基質と生化学研究への応用" 放射線生物研究. 32. 307-325 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Ayumi Asaeda: "Highly sensitive assay of DNA abasic sites in mammalian cells-Optimization of the aldehyde reactive probe (ARP) method" Analytica Chimica Acta. (印刷中). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Ayumi Asaeda: "Repair kinetics of abasic sites in mammalian cells selectively monitored by the aldehyde reactive prove (ARP)" Nucleosides Nucleotides. (印刷中). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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