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微生物由来新規カルボキシルプロテアーゼの構造機能解析と分子進化

研究課題

研究課題/領域番号 09660089
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関京都工芸繊維大学

研究代表者

小田 耕平  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 教授 (50081584)

研究分担者 平賀 和三  京都工芸繊維大学, 繊維学部, 助手 (50252549)
研究期間 (年度) 1997 – 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
1998年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
1997年度: 2,600千円 (直接経費: 2,600千円)
キーワード微生物 / カルボキシルプロテアーゼ / アスパルティックプロテアーゼ / 構造と機能 / 分子進化 / 触媒残基 / ペプスタチン / 酸性プロテアーゼ / 酵性プロテアーゼ
研究概要

原核生物由来の最初のカルボキシルプロテアーゼ(CP)であり,且つ,ペプスタチン非感受性CPであるPseudomonas sp.(PCP)とXanthomonas sp.(XCP)の酵素を始め,Bacillus coagulans J-4酵素,高温細菌由来CP,クマモリシンの合計4種類の酵素を対象に,これらCPの構造と機能を総合的に考察する。更に,CPの進化を考察すると共に,CPの全体像を探る。
1. 触媒残基の同定(部位特異的改変体)
PCPとXCPの両酵素に保存されている8ケのAsp又はGlu残基を触媒残基の候補として,これらのAla改変体(合計16種)について検討した結果,PCPの触媒残基はAsp 170とAsp 328,XCPのそれはAsp 169とAsp 348と同定した。
2. 触媒残基の同定(スチレンオキシド)
スチレンオキシドの^<14>C標識化合物を用いて検討し,PCPのGlu 80,XCPのGlu 75とAsp 110は基質結合部位として重要であることを明らかにした。
3. 触媒残基の同定(カルボジイミド)
特異的阻害剤チロスタチンと^<14>C-N,N‘-ジシクロヘキシル力ルボジイミドの併用によるDifferential Labelingを行い,PCPのAsp 140とGlu 222,XCPのGlu 235は触媒残基としてではなく,基質結合部位として重要であることを明らかにした。
4. Bacillus sp.J-4CP遺伝子のクローニング
ペブスタチン非感受性で,且つ,アルコール耐性の本酵素について遺伝子のクローニングを行い,ほぼ全領域の遺伝子の取得に成功した。
5. クマモリシンの高発現系の確立
耐熱性酵素クマモリシンの大腸菌での高発現系の構築に成功した。

報告書

(3件)
  • 1998 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (29件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (29件)

  • [文献書誌] S.Narutaki: "Subsite preferences of pepstatin-insensitive carboxyl proteinases from bacteria" J.Biochem.125・1. 75-81 (1999)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Ito: "Identification of carboxyl residues in pepstatin-insensi-tive carboxyl proteinase from Pseudomonas sp. 101 that participate in catalysis and substrate binding" J.Biochem.125・1. 210-216 (1999)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] 小田耕平: "LINCL病の原因遺伝子はシュードモナスのプロテアーゼ・ホモログ" バイオサイエンスとインダストリー. 156・12. 31-32 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Shibata: "Substrate specificity of pepstatin-insensitive carboxyl proteinase from Bacillus coagulans J-4" J.Biochem. 124・3. 642-647 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Kondo: "Substrate specificities and kinetic properties of protei-nase A from Yeast Saccharomyces cerevisiae and the development of a novel substrate" J.Biochem. 124・1. 141-147 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] N.Oda: "Nucleotide Sequence of the gene encoding the precursor protein of pepstatin-insensitive acid protease B, Scytali-dopepsin B, from Scytalidium lignicolum" Biosci.Biotech.Biochem.62・8. 1637-1639 (1998)

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  • [文献書誌] K.Oda: "Handbook of Proteolytic Enzymes" A.J.Barrett et al., ed. Academic Press, 4 (1998)

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  • [文献書誌] K.Oda: "Aspartic Proteinases" M.James ed., Plenum Press, New York, 5 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Narutaki et al.: "Subsite preferences of pepstatin-insensitive carboxyl proteinases from bacteria" J.Biochem.125. 75-81 (1999)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Ito et al.: "Identification of carboxyl residues in pepstatin-insensitive carboxyl proteinase from Pseudomonas sp.101 that participates in catalysis and sustrate binding" J.Biochem.125. 210-216 (1999)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] M.Shibata et al.: "Substrate specificity of pepstatin-insensitive carboxyl proteinase from Bacillus coagulans J-4" J.Biochem.124. 642-647 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] H.Kondo et al.: "Substrate specificities and kinetic properties of proteinase A from yeast Saccharomyces cerevisiae and the development of a novel substrate" J.Biochem.124. 141-147 (1998)

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  • [文献書誌] N.Oda et al.: "Nucleotide sequence of the gene encoding the precursor protein of pepstatin-insensitive acid protease B,Scytalidopepsin B,from Scytalidium lignicolum" Biosci.Biotech.Biochem.62. 1637-1639 (1996)

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  • [文献書誌] M.Ito et al.: "Substrate specificities of pepstatin-insensitive carboxyl proteinases from Gram-negative bacteria" J.Biochem.120. 845-850 (1996)

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  • [文献書誌] K.Oda et al.: "Cloning and expression of an isovaleryl pepstatin-insensitive carboxyl proteinase gene from Xanthomonas sp.T-22" J.Biochem.120. 564-572 (1996)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] T.Kakimori et al.: "Nucleotide sequence of the gene encoding pepstatin-insensitive acid protease B,Scytalidopepsin B,of Scytalidium lginicolum" Biosci.Biotech.Biochem.60. 1210-1211 (1996)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Oda: "Scytalidopepsin B" In : Handbook of Proteolytic Enzymes (ed.A.J.Barret et al.). Academic Press., 2 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Oda: "Xanthomonapepsin" In : Handbook of Proteolytic Enzymes (ed.A.J.Barret et al.). Academic Press., 2 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] K.Oda et al.: "Pepstatin-insensitive Carboxyl Proteinases from Prokaryotes Catalytic Residues and Substrate Specificities" In : Aspartic Proteinases (ed.by M.N.G.James). Plenum Press.New York, 5 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] B.M.Dunn et al.: "Comparison of the Specificity of the Aspartic Proteinases towards Internally Consistent Sets of oligopeptide Substrates" In : Aspartic Proteinases (ed.by M.N.G.James). Plenum Press.New York, 6 (1998)

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    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] S.Narutaki: "Subsite preferences of pepstatin-insensitive carboxyl proteinases from bacteria" J.Biochem.,. 125・1. 75-81 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.Ito: "Identification of carboxyl residues in pepstatin-insensi-tive carboxyl proteinase from Pseudomonas sp.101 that participate in catalysis and substrate binding" J.Biochem.125・1. 210-216 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] 小田耕平: "LINCL病の原因遺伝子はシュードモナスのプロテアーゼ・ホモログ" バイオサイエンスとインダストリー. 156・12. 31-32 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.Shibata,: "Substrate specificity of pepstatin-insensitive carboxyl proteinase from Bacillus coagulans J-4" J.Biochem.,. 124・3. 642-647 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] H.Kondo,: "Substrate specificities and kinetic properties of protei-nase A from Yeast Saccharomyces cerevisiae and the development of a novel substrate" J.Biochem.,. 124・1. 141-147 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] N.Oda,: "Nucleotide Sequence of the gene encoding the precursor protein of pepstatin-insensitive acid protease B, Scytali-dopepsin B, from Scytalidium lignicolum" Biosci.Biotech.Biochem.,. 62・8. 1637-1639 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] K.Oda: "Handbook of Proteolytic Enzymes" A.J.Barrett et al., ed. Academic Press, 4 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] K.Oda: "Aspartic Proteinases" M.James ed., Plenum Press, New York, 5 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.N.G.James, ed: "Structure and Functions of Aspartic Proteinases:Retroviral and Cellular Enzymes,K.Oda et al.,Pepstatin-insensitive Carboxyl Proteinases from Prokaryote:Substrate Specificities and Catalytic Residues" Plenum Publishing Corporation, (5) (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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