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新たに見つかった核酸の2重鎖-4重鎖スイッチングの分子的基盤の解明とその利用

研究課題

研究課題/領域番号 09680648
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 生物物理学
研究機関横浜国立大学

研究代表者

片平 正人  横浜国立大学, 工学部, 助教授 (70211844)

研究期間 (年度) 1997 – 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
3,300千円 (直接経費: 3,300千円)
1998年度: 1,100千円 (直接経費: 1,100千円)
1997年度: 2,200千円 (直接経費: 2,200千円)
キーワードDNA / RNA / NMR / 4重鎖 / 2重鎖 / テロメア / 抗ガン剤 / タンパク質 / 金属イオン / ドラッグ / リボザイム
研究概要

d(GGAGGA)がカリウムイオン存在化で形成する新規4重鎖構造、及び同DNAがカリウムイオン非存在下で形成する新規2重鎖構造を、NMRを用いて原子レベルの分解能で決定した。特に後者においては、非標準型塩基対であるG:G及びA:A塩基対のみからなるユニークな構造が明らかになった。
又4重鎖構造から他の構造へのスイッチングが、RNA結合蛋白質hnRNPD0によって引き起こされる事を、初めて見い出した。そしてこの蛋白質とホモロジーのあるもう1つの蛋白質Musashi1の立体構造、及びRNAとの相互作用をNMRにより決定した。その結果、4重鎖破壊活性とテロメアDNA維持機構との関連についても知見を得た。
さらに抗ガン剤UCH9とDNAの複合体の構造をNMRにより決定し、UCH9の結合によって引き起こされるB→Aの構造変化及びその生物学的意義を明らかにした。

報告書

(3件)
  • 1998 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (42件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (42件)

  • [文献書誌] Katahira他: "Structure and interactions with RNA of the N-terminal UUAG-specific domain of hnRNPD0"J. Mol. Biol.. 287. 221-237 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira他: "Structure backbone dynamics and interactions with RNA of the c-terminal RNA-binding domain of Musashi1"J. Mol. Biol.. 287. 314-330 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira他: "Two metal binding sites in a lead ribozyme bound to competitively by Pb^<2+> and Mg^<2+>"Eur. J. Biochem.. 255. 727-733 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira他: "Structural characterization of a DNA duplex modeled on the polypurine tract"Nucleosides & Nucleotides. 17. 831-841 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira他: "Solution structure of the novel antitumordrug,UCH9,complexed with d(TTGGCCAA)_2 by NMR"Nucleic Acids Res.. 26. 744-755 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira他: "Activation and repression of the activity of a lend ribozyme by the combination of Pb^<2+> and Mg^<2+>"J. Biochem. 122. 1062-1067 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakamoto.T.: "Properties of a hammerhead ribozyme with deletion of stemII"J. Biochem.. 121. 288-294 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakamoto,T.: "Properties of hepatitis delta virus ribozyme,which consists of three RNA oligomer stands"J. Biochem. 121. 1123-1128 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakamoto,T.: "Hairpin structure of an RNA 28-mer,which contains a sequence of the enzyme component of a hammerhead ribozyme system:evidence for tandem G:A pairs that are not of side-by-side type"J. Biochem. 122. 556-562 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kurihara.Y: "Structural properties and RNA-binding activities of two RNA recognition motifs of a mouse neural RNA-binding protein,mouse-Musashi-1"Gene. 186. 21-27 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Horiuchi,M: "Dimerization and DNA binding facilitate α-helix formation of Max in solution"J. Biochem. 122. 1062-1067 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka,Y.: "Structure-activity correlation for an HDV ribozyme composed of three RNA stands"Nucleic Acids symp.Ser.. 37. 309-310 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kobayashi,S: "The structures of nucleic acids composed exclusively of non-standard base pairs"Nucleic Acids Symp Ser.. 37. 103-104 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira,M.: "Duplex structure with asymmetric G:G base pairs"Nucleic Acids symp Ser. 39. 119-120 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka,Y.: "Structural investigation of HDV ribozymos by NMR spectroscopy"Nucleic Acids Symp Ser. 39. 147-148 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakamoto, T.: "Properties of a hammerhead ribozyme with delection of stem II" J.Biochem.121. 288-294 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakamoto, T.: "Properties of hepatitis dalta virus ribozyme, which consists of three RNA oligomer strands" J.Biochem.121. 1123-1128 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Sakamoto, T.: "Hairpin structure of an RNA 28-mer, which contains a sequence of the enzyme component of a hammerhead ribozyme system : evidence for tandem G : A pairs that are not of side-by-side type" J.Biochem.122. 556-562 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kurihara, Y.: "Structural properties and RNA-binding activities of two RNA recognition motifs of a mouse neural RNA-binding protein, mouse-Musashi-1" Gene. 186. 21-27 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Horiuchi, M.: "Dimerization and DNA binding facilitate alpha-helix formation of Max in solution" J.Biochem.122. 711-716 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kim, M.: "Activation and repression of the activity of a lead ribozyme by the combination of Pb2+ and Mg2+" J.Biochem.122. 1062-1067 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka, Y.: "Structure-activity correlation for an HDV ribozyme composed of three RNA strands" Nucleic Acids Symp.Ser.No.37. 309-310 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kobayashi, S.: "The structures of nucleic acids composed exclusively of non-standard base pairs" Nucleic Acids Symp.Ser.No.37. 103-104 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira, R.: "Solution structure of the novel antitumor drug, UCH9, complexed with d (TTGGCCAA) 2, as determined by NMR spectroscopy" Nucleic Acids Res.26. 744-755 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Kanagawa, M.: "Structural characterization of a DNA duplex modeled on a DNA : RNA hybrid of the polypurine tract recognized by a reverse transcriptase" Nucleosides & Nucleotides. 17. 831-841 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira, M.: "Two metal binding sites bound to competitively by Pb2+ and Mg2+, and induced structural change of a lead ribozyme, as revealed by NMR" Eur.J.Biochem.255. 727-733 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira, M.: "Duplex structure with asymmetric G : G basepairs" Nucleic Acids Symp.Ser.No.39. 119-120 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tanaka, Y.: "Structural investigation of HDV ribozymes by NMR spectroscopy" Nucleic Acids Symp.Ser.No.39. 147-148 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagata, T.: "Structure and interactions with RNA of the N-terminal UUAG-specific domain of hnRNP D0" J.Mol.Biol.287. 221-237 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Nagata, T.: "Structure backbone dynamics and interactions with RNA of the C-terminal RNA-binding domain of a mouse neural RNA-binding protein, Musashi1" J.Mol.Biol.287. 314-330 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Katahira 他: "Structure and interactions with RNA of the N-terminal UUAG-Specific domain of hnRNPDO" J.Mol.Biol.287. 221-237 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Katahira 他: "Structmre,backbone dynamics and interactions with RNA of the C-terminal RNA・binding domain of Musashi 1" J.Mal.Biol.287. 314-330 (1999)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Katahira 他: "Two metal binding sites in a leabd ribozyme bound to competitiuely by Pb^<2+> and Mg^<2+>" Eur.J.Biochem.255. 727-733 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Katahira 他: "Structural chara cterization of a DNA duplex modeled on the polypurine tract" Nucleosides & Nucleotides. 17. 831-841 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Katahira 他: "Solution Structure of the novel antitumor drug,VCHq,complexed with dCTTGGCC.AAI_2 by NMR" Nucleic Acids Res.26. 744-755 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Katahira 他: "Actiration and repression of the activity of a lead ribozyme by the combination of Pb^<2+> and Mg^<2+>" J.Biochem. 122. 1062-1067 (1997)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Sakamoto,T., Katahira,M.et al.: "HAIRPIN STRUCTURE OF AN RNA 28-MER, WHICH CONTAINS A SEQUENCE OF THE ENZYME COMPONENT OF A HAMMERHEAD RIBOZYME SYSTEM" J.Biochemistry. 122. 556-562 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Sakamoto,T., Katahira,M.et al.: "Properties of hepatitis δ Virus ribozyme, which consists of three RNA oligomer strands" J.Biochemistry. 121. 1123-1128 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Kim,M,H., Katahira,M.et al.: "Activation unel repression of the aitivity of a lead ribozyme by the combination of PD^<2+> and Mu^<2+>" J.Biochemistry. 122. 1062-1067 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Kurihara,Y., Katahira,M.et al.: "Structural properties of two RNA recognition motifs of a mouse neural RNA-binding protein, mouse-Musashi-1" Gene. 186. 21-27 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Sakamo,t,T., Katahira,M.et al.: "Properties of a hammerhead ribozyme with aeletion of stemII" J.Biochemistry. 121. 288-294 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Katahira,R., Katahira,M.et.al.: "Solution structure of the norel antitumer drug, UCHq, conplexed with d (TTGGCCAA) _2, as determined by NMR" Nucleic Acids Research. 26(in press). (1988)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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