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大腸菌核様体タンパク質H-NSによる新規な遺伝子発現調節機構の解析

研究課題

研究課題/領域番号 09680671
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 分子生物学
研究機関名古屋大学

研究代表者

上口 智治  名古屋大学, 農学部, 助手 (20232738)

研究期間 (年度) 1997 – 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
3,200千円 (直接経費: 3,200千円)
1998年度: 1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
1997年度: 1,800千円 (直接経費: 1,800千円)
キーワードH-NS / gene regulation / グローバルリプレッサー / 核様体 / サイレンシング / DNA結合タンパク質 / LeuO / シグマ因子 / ストレス応答
研究概要

本研究においてはまずH-NSによる転写制御の分子機構を探る目的で、H-NSの構造と機能の相関に焦点を当てて解析を行った。hns遺伝子の変異株を系統的に取得し、分子遺伝学的・生化学的解析を加えることで各変異の表現型を整理し、H-NSが少なくとも三つの機能ドメインから成ることを明らかにした。N末端側には転写抑制に直接関わるドメインが、C末端側約1/3にはDNA結合に関与するドメインが存在し、中央部はダイマー形成に関与する。これらの機能的重要性も同時に証明した。また共同研究によって明らかにされたC末端側ドメインの三次元構造と変異解析の結果を対照することで、DNA結合ドメイン内のループ構造がDNAの認識と結合に重要であることを明らかにした。またさらにH-NSが関与する複雑な遺伝子発現制御機構についての解析にも着手した。大腸菌bglオペロンは典型的なサイレント遺伝子であり、H-NS並びに真核生物におけるサイレンサー様のシスエレメントによって、通常条件下では転写されない遺伝子となっている。上記課題の遂行中に、この遺伝子サイレンシングが生じるためにはDNA結合能を失った変異H-NSタンパク質でも十分であることが判明し、サイレンシングにおけるH-NSの関わりについて興味深い側面が明らかにされた。また定常期特異的シグマ因子の発現制御にはH-NSが負の制御因子として機能するが、この関与は転写段階ではなく翻訳とシグマ因子の安定性の両段階であり、H-NSの機能がこれら転写以外の細胞機能にも密接な関わりを持つことを示唆している。本研究ではこれらの課題に対して予備的な結果しか得られなかったが、H-NSによる遺伝子発現の細胞レベルでの統御を知る上で重要な課題であるといえよう。

報告書

(3件)
  • 1998 実績報告書   研究成果報告書概要
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (31件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (31件)

  • [文献書誌] Ueguchi C.,Suzuki T.,Yoshida T.,Tanaka K.,Mizuno T.: "Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of Escherichia coli nucleoid protein H-NS." J.Mol.Biol.263. 149-162 (1996)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tabata K.,Kashiwagi S.,Mori H.,Ueguchi C.& Mizuno T.: "Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana." Biochim.Biophys.Acta. 1326. 1-6 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueguchi C.,Seto C.,Suzuki T.,Mizuno T.: "Clarification of the dimerization domain and its functional significance for the Escherichia coli nucleoid protein H-NS." J.Mol.Biol.274. 145-151 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueguchi C.,Ohta T.,Seto C.,Suzuki T.,Mizuno T.: "The leuO gene-product has a latent ability to relieve the bgl silencing in Escherichia coli." J.Bacteriol.180. 190-193 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Imamura A.,Hamaki N.,Umeda H.,Nakamura A.,Suzuki T.,Ueguchi C.,Mizuno T.: "Response regulators implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 2691-2696 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamashino T.,Isomura M.,Ueguchi C.,Mizuno T.: "The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein that is essential for the normal cell-growth of Escherichia coli." J.Bacteriol.180. 2257-2261 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Taniguchi M.,Kiba T.,Sakakibara H.,Ueguchi C.,Mizuno T.,Sugiyama T.: "Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate." FEBS Lett.429. 259-262 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada H.,Hamaki N.,Imamura A.,Ueguchi C.,Mizuno T.: "An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-inducible response regulator,ARR4,implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction." FEBS Lett.436. 76-80 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki T.,Imamura A.,Ueguchi C.,Mizuno T.: "Histidine-containing phosphotransfer(HPt)signal transducers implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in" Plant Cell Physiol.39. 1258-1268 (1998)

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  • [文献書誌] Mizuno T.&Ueguchi C.: "Molecular chaperone and protein-folding saguences" University Press, (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueguchi C., Suzuki T., Yoshida T., Tanaka K.and Mizuno T.: "Systematic mutational analysis revealing the functional domain organization of Escherichia coli nucleoid protein H-NS." J.Mol.Biol.263. 149-162 (1996)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Tabata K., Kashiwagi S., Mori H., Ueguchi C.and Mizuno T.: "Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana." Biochim.Biophys.Acta.1326. 1-6 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueguchi C., Seto C., Suzuki T.and Mizuno T.: "Clarification of the dimerization domain and its functional significance for the Escherichia coli nucleoid protein H-NS." J.Mol.Biol.274. 145-151 (1997)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueguchi C., Ohta T., Seto C., Suzuki T.and Mizuno T.: "The leuO gene-product has a latent ability to relieve the bg/silencing in Escherichia coli." J.Bacteriol.180. 190-193 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Imamura A., Hanaki N., Umeda H., Nakamura A., Suzuki T., Ueguchi C.and Mizuno T.: "Response regulators implicated in His-to-Asp Phosphotransfer signaling in Arabidopsis." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 2691-2696 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamashino T., Isomura M., Ueguchi C.and Mizuno T.: "The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein that is essential for the normal cell-growth of Escherichia coli." J.Bacteriol.180. 2257-2261 (1998)

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      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Taniguchi M., Kiba T., Sakakibara H., Ueguchi C., Mizuno T.and Sugiyama T.: "Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate." FEBS Lett.429. 259-262 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Yamada H., Hanaki N., Imamura A., Ueguchi C.and Mizuno T.: "An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-inducible response regulator, ARR4, implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction." FEBS Lett.436. 76-80 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Suzuki T., Imamura A., Ueguchi C.and Mizuno T.: "Histidine-containing phosphotransfer (HPt) signal transducers implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis." Plant Cell Physiol.39. 1258-1268 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Mizuno T.and Ueguchi C.: CbpA in Molecular chaperone and Protein-folding sequences. ed.Gething M.J.University Press, (1997)

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    • 関連する報告書
      1998 研究成果報告書概要
  • [文献書誌] Ueguchi, Ohta, Seto, Suzuki & Mizuno: "The leuO gene-product has a latent ability to relieve the bgl silencing in Escherichia coli." J.Bacteriol.180. 190-193 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Imamura, Hanaki, Umeda Nakamura, Suzuki, Ueguchi & Mizuno: "Response regulators implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 2691-2696 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Yamashiro, Isomura, Ueguchi & Mizuno: "The yhhP gene encoding a small ubiquitous protein that is essential for the normal cell-growth of Escherichia coli." J.Bacteriol.180. 2257-2261 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Taniguchi, Kiba, Sakakibara, Ueguchi, Mizuno & Sugiyama: "Expression of Arabidopsis response regulator homologs is induced by cytokinins and nitrate." FEBS Lett.429. 259-262 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Yamada, Haraki, Imamura, Ueguchi & Mizuno: "An Arabidopsis protein that interacts with the cytokinin-inducible response regulator,ARR4,implicated in the His-Asp phosphorylay signal transduction." FEBS Lett.436. 76-80 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Suzuki, Imamura, Ueguchi & Mizuno: "Histidine-containing phosphotransfer(HPt)signal transducers implicated in His-to-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis." Plant cell Physiol.39. 1258-1268 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Tabata T., Kashiwagi S., Mori. H., Ueguchi C & Mizuno T.: "Cloning of a cDNA encoding a putative metal-transporting P-type ATPase from Arabidopsis thaliana." Biochim. Biophys. Acta. 1326. 1-6 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Ueguchi C., Seto C., Suzuki T. & Mizuno T.: "Clarification of the dimerization domain and its functional significance for the Escherichia coli nucleoid protein H-NS." J.Mol.Biol.274. 145-151 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Ueguchi C., Ohta T., Seto C., Suzuki T. & Mizuno T.: "The leuO gene-product has a latent ability to relieve the bgl silencing in Escherichia coli" J.Bacteriol.180. 190-193 (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Inamura A., Hanaki N., Uweda H Nakamura, Suzuki, Ueguchi & Mizuno: "Occurrence of a group of response regulators implicated in the His-Asp phosphotransfer signaling in Arabidopsis." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. (in press). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Mizuro T & Ueguchi C: "Molecular Chaperone and Protein-Folding Sequences(Ed.Gething, M-J.)" University Press, (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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