• 研究課題をさがす
  • 研究者をさがす
  • KAKENの使い方
  1. 前のページに戻る

インドール酢酸生合成酵素の分子機能解析

研究課題

研究課題/領域番号 09876025
研究種目

萌芽的研究

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学・応用生物化学
研究機関京都大学

研究代表者

清水 昌  京都大学, 農学研究科, 教授 (70093250)

研究分担者 小川 順  京都大学, 農学研究科, 助手 (70281102)
小林 達彦  京都大学, 農学研究科, 講師 (70221976)
研究期間 (年度) 1997 – 1998
研究課題ステータス 完了 (1998年度)
配分額 *注記
2,300千円 (直接経費: 2,300千円)
1998年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
1997年度: 1,700千円 (直接経費: 1,700千円)
キーワードインドール酢酸 / ニトリラーゼ / Alcaligenes faecalis / インドールアセトニトリル / キメラ酵素 / Rhodococcus rhodochrous
研究概要

Alcaligenes faccalisのインドール酢酸(IAA)合成に関わる(インドールアセトニトリルからLAAへの加水分解反応を触媒する酵素)ニトリラーゼの発現調節機構を解析した。既にクローン化している本菌のニトリラーゼ遺伝子nitAを含む種々のデリーションクローンのニトリラーゼ活性を測定した結果、nitAの上流約0.3kb、下流約1.5kbの領域がイソバレロニトリルによるニトリラーゼの誘導発現に必要であることが判明した。本領域には、一つのORF(nitR)が存在し、nitRから予想されるアミノ酸配列は、Pseudomonas putidaのキシレン代謝系遺伝子の誘導発現を正に調節するXylSおよび大腸菌のアラビノース代謝系遺伝子の誘導発現を調節するAraCと、特にタンパク質のC末端部分において相同性を示した。XylSやAraCは相同性のあまり高くないN末端部分でそれぞれのインデューサーとなる化合物を認識し、相同性の高いC末端部分に存在するhelix-turn-helixモチーフの領域で特定のDNA配列と結合して、転写を調節すると考えられている。一方、nitAをlacプロモーターの下流に連結し大腸菌で発現させた場合、nitRが存在しなくてもIPTGによりニトリラーゼが活性の有る状態で大量に発現したことから、上記の結果も考え併せると、NitRタンパク質はnitAの発現を転写レベルで正に調節するタンパク質であることが示唆された。このように、ニトリラーゼの発現調節機構モデルを提示することができた。

報告書

(2件)
  • 1998 実績報告書
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (12件)

  • [文献書誌] Kobayashi,M.& Shimizu,S.: "Metalloenzyme nitrile hydratase: Structure,regulation,and application to biotechnology" Nature Biotechnol.16. 733-736 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Kobayashi,M.et al.: "The catalytic mechanism of amidase also involves nitrile hydrolysis" FEBS Lett.439. 325-328 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Kobayashi,M.et al.: "Nitrilase catalyzes amide hydrolysis as well as nitrile hydrolysis" Biochem.Biophys.Res.Commun.253. 662-666 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] Kobayashi,M.et al.: "Lactone-ring-cleaving enzyme: Genetic analysis,novel RNA editing,and evolutionary implications" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 95. 12787-12792 (1998)

    • 関連する報告書
      1998 実績報告書
  • [文献書誌] M.Kobayashi et al.: "Characterization and distribution of IS1164 that exists in the high molecular mass nitrile hydratase gene cluster." Proc.Japan Acad.73B(6). 104-108 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] M.Kobayashi et al.: "Identification of active sites in amidase:Evolutionary relationship between amide bond-and peptide bond-cleaving enzymes." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94(22). 11986-11991 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] H.Komeda et al.: "A novel transporter in cobalt uptake." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94(1). 36-41 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 小林 達彦: "重金属コバルトによるスーパー酵素の誘導" バイオサイエンスとインダス-. 55(3). 208-209 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 小林 達彦: "ニトリル変換酵素の物質生産への機能開発" 農化誌. 71(12). 1243-1252 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 小林 達彦: "Rhodococcusのニトリルヒドラターゼとトランスポーター" 日本応用酵素協会誌. 32. 1-7 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] S.Shimizu et al.: "Advances in Biochemical Engineering/Biotechnology,vol.58" Springer-Verlag,Berlin, 42 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 清水 昌: "高純度化技術大系、第3巻" フジ・テクノシステム,東京, 11 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

URL: 

公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

サービス概要 検索マニュアル よくある質問 お知らせ 利用規程 科研費による研究の帰属

Powered by NII kakenhi