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新しいY染色体特異的STR多型マーカーの開発に関する研究

研究課題

研究課題/領域番号 09877091
研究種目

萌芽的研究

配分区分補助金
研究分野 法医学
研究機関福井医科大学

研究代表者

松木 孝澄  福井医科大学, 医学部, 助手 (10126617)

研究分担者 青山 正洋  福井医科大学, 医学部, 助手 (90283168)
飯田 礼子  福井医科大学, 医学部, 助手 (40139788)
研究期間 (年度) 1997
研究課題ステータス 完了 (1997年度)
配分額 *注記
2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
1997年度: 2,000千円 (直接経費: 2,000千円)
キーワードY染色体 / STR / microsatellite / 多型 / DYS19 / DYS390 / DYS395 / DYS384
研究概要

Genome Data Base(GDB)収載のDYS19,DYS390,DYS395,DYS384を対象に,福井県在住者のアレルの分布とその出現頻度を,変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動・SYBR GrcenI染色により調査し,主要なアレルの塩基配列の決定を行った。アレル数,PD値,PCR産物の大きさ,検査数は以下の様であった。DYS19:5個,0.72,186-202bp,n=131;DYS390:6個,0.75,216-236bp,n=129;DYS395:5個,0.58,116-132bp,n=128;DYS384:30個,0.95,350-440bp,n=181。この内,DYS384は男性で2本,女性で4本又は2本のバンドが検出されること,ヒトの染色体を一本含むハイブリッド株化細胞のDNAを使った実験では、ヒトX染色体を含む細胞から抽出したDNAでのみDYS384を検出できることから,DYS384はDXS^<***>と名称変更が必要なことを見出し,GDBに対して訂正を申し入れた。
一方,我々は大きさが200bp以下で,日本人集団においてより多型性に富む,Y染色体の4塩基繰り返し配列多型マーカーの新規開発をめざしている。Y染色体cosmid libraryより,12種類の4塩基繰り返し配列のprobeを用いて,繰り返し配列を含むcosmidをつりあげたところ,261個のクローンのうち12個にプローブとハイブリッドするものが得られた。今後はそれらのcosmidからplasmidを調製して,適当な制限酵素で切断し,subcloningする。再度probeで選択し,塩基配列の決定,PCR用プライマーの設計・合成,Y染色体特異性の検討をする。更に,allele頻度分布の調査,親子間の遺伝性の検討,変異体の検索などをおこなって,多型マーカーとして確立することをめざす。

報告書

(1件)
  • 1997 実績報告書
  • 研究成果

    (5件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (5件)

  • [文献書誌] Aoyama M,et al.: "DYS19 marker in Japanese populations" International Journal of Legal Medicine. 110. 112-113 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 松木孝澄,他: "Y染色体DNA多型マーカーの調査と開発" 日本法医学雑誌. 52(印刷中). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] 松木孝澄,他: "Y染色体STR3種のアレル頻度分布" 日本法医学雑誌. 52(印刷中). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Ikegami T, et al.: "Novel mutations of the peripheral myelin protein 22 gene in two pedigrees with Dejerine-Sottas disease" Human Genetics. (印刷中). (1998)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書
  • [文献書誌] Iida R,et al.: "The fifth allele of the human deoxyribonuclease I (DNase I) polymorphism" Electrophoresis. 18・11. 1936-1939 (1997)

    • 関連する報告書
      1997 実績報告書

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公開日: 1997-04-01   更新日: 2016-04-21  

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