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デング由来エンベロープ糖タンパク質におけるエピトープ領域の新規解析法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 09F09096
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分外国
研究分野 生物分子科学
研究機関東京農工大学

研究代表者

黒田 裕  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 准教授

研究分担者 ISLAM MonirulMohammad  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 外国人特別研究員
ISLAM Monirul Mohammad  東京農工大学, 大学院・工学研究院, 外国人特別研究員
研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2011年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
2010年度: 900千円 (直接経費: 900千円)
2009年度: 600千円 (直接経費: 600千円)
キーワード分子構造 / 分子認識 / 変異体解析 / 生物物理
研究概要

現在のところワクチンもないデング熱は、東南アジアの広い地域で公衆衛生上の問題となっている。デングウイルスは、DEN1~4の4種類の型に大別され、それらのエピトープ領域とウイルス型に対する抗体の特異性を解明する事は重要な研究課題である。本計画では、抗体認識の特異性に直接関わる可能性が高いデングウイルスのエンベロープ糖タンパク質(以下、Eタンパク質)の第3ドメイン(以下、E3D;96残基)に注目し、その変異体解析を行い、抗体認識機構(及び部位)を分子レベルで解明する。
平成23年度では、デングウイルス3型及び4型由来のE3Dを、pET発現系を用いて大腸菌で発現し、通常の精製法(ニッケルレジン、HPLC)で、高純度に精製した(培地1L当たり30mgの収量)。高純度に精製した3型E3D及び4型E3DのX線結晶構造をそれぞれ、1.8Åと2.2Åの分解能で決定し、座標をPDBに仮登録した。さらに、3型E3D、4型E3Dに対するポリクロナル抗体を作製した。また、3型E3D及び4型E3Dの抗体認識部位の数残基を互いに入れ替えた変異体(Epitope Grafted Mutant; EGM)を8種類構築し、大量発現し、精製した。現在、EGM変異体とE3Dを型特異的に識別する抗体の相互作用をElisa法で解析中である。これらの相互作用解析の結果を上記の高分解能X線結晶構造と比較することで、抗体のウイルス型特異性の物理化学的な解明が期待される。

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (20件)

すべて 2012 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (18件)

  • [雑誌論文] Thermodynamic and structural analysis of highly stabilizing single and double mutations in BPTI variants2009

    • 著者名/発表者名
      Mohammad Monirul Islam, Shihori Sohya, Keiichi Noguchi, Shunich i Kidokoro, Masafumi Yohda, Yuta ka Kuroda
    • 雑誌名

      PROTEINS 77

      ページ: 962-970

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] 蛋白質の構造形成に必要な最小情報とは-単純化ウシ膵臓トリプシン阻害蛋白質変異体構造と熱力学-2009

    • 著者名/発表者名
      加藤淳、イスラム M モハマド、黒田裕
    • 雑誌名

      蛋白質 核酸 酵素 54(5)

      ページ: 643-648

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] High resolution Crystal structure of Dengue 3 envelope protein domain III (ED3)2012

    • 著者名/発表者名
      Montasir Elahi, Mohammad M Islam, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      生物物理関東地区研究会
    • 発表場所
      東京農工大学(東京都)
    • 年月日
      2012-03-05
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Host Guest Analysis of Amino Acids contribution to Protein Solubility Using Short SET-Tags Fused to a Simplified BPTI2012

    • 著者名/発表者名
      Mohammad M.Islam, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第5回公開シンポジウム
    • 発表場所
      東大寺文化センター(奈良県)(招待講演)
    • 年月日
      2012-01-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Effects of short solubility controlling peptide tags on protein's solubility, thermodynamics, structure and function2012

    • 著者名/発表者名
      Mohammad M Islam, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      Conference of the Bangladesh Society for Biochemistry and Molecular Biology
    • 発表場所
      University of Rajshahi (Rajshahi, Bangladesh)
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Crystal structure of Dengue 3 envelope protein domain III2011

    • 著者名/発表者名
      Montasir Elahi, Mohammad Monirul Islam, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • 年月日
      2011-12-14
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 難結晶化タンパク質変異体に対するヘテロシーディング法2011

    • 著者名/発表者名
      小林慶、Mohammad Islam、野口恵一、養王田正文、黒田裕
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      阪急エキスポパーク(大阪府)
    • 年月日
      2011-06-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Amino Acids Contribution to Polypeptides Solubility Analyzed Using Short Poly-Amino Acid Tags2011

    • 著者名/発表者名
      黒田裕、加藤淳、Mohammad Islam
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      阪急エキスポパーク(大阪府)
    • 年月日
      2011-06-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Effects of short solubility controlling peptide tags on protein solubility, thermodynamics, structure and function2011

    • 著者名/発表者名
      Mohammad M Islam, Atsushi Kato, Shihori Sohya, Mohammed Khan, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Shun-ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      阪急エキスポパーク(大阪府)
    • 年月日
      2011-06-07
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] Stabilization of BPTI-[5,55] through decrease of local backbone fluctuations and development of hetero-microseeding for crystallizing low-stability proteins2010

    • 著者名/発表者名
      Yutaka Kuroda, Mohamed M Islam, Kei Kobayashi
    • 学会等名
      揺らぎが機能を決める生命分子の科学第4回公開シンポジウム
    • 発表場所
      滋賀県立県民交流センターピアザ淡海(滋賀県)
    • 年月日
      2010-11-30
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 1及び2残基置換によって熱安定化したBPTI変異体の実験的解析2010

    • 著者名/発表者名
      小林慶、イスラムモニルモハマド、野口恵一、城所俊一、養王田正文、黒田裕
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県)
    • 年月日
      2010-09-22
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 短いペプチドの新しい溶解度測定法の開発2010

    • 著者名/発表者名
      島田広海、モハマドモニルイスラム、モンスルアラムカーン、辻良太郎、黒田裕
    • 学会等名
      第48回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      東北大学(宮城県)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Effect of Short Peptide Tags On Protein Solubility, Function, Structure Studied in the context of BPTI2010

    • 著者名/発表者名
      Mohammad Monirul Islam, Keiichi Noguchi, Hasafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • 年月日
      2010-06-16
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Effect of short tags on protein solubility, function and structure2010

    • 著者名/発表者名
      Mohammad Monirul Islam, Keiichi Noguchi, Hasafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      The Role of Biochemists in Health and Environment, Graduate Biochemists Association
    • 発表場所
      University of Dhaka (Dhaka, Bangladesh)
    • 年月日
      2010-05-21
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] X-Ray Crystal Structures of Extensively Simplified BPTI Variants Deter mined Using the KEK Photon Factory Facility2010

    • 著者名/発表者名
      Mohammad Monirul Islam, Shihori Sohya, Keiichi Noguchi, Masafumi Yohda, Yutaka Kuroda
    • 学会等名
      First Asia-Europe Physics Summit
    • 発表場所
      エポカルつくば(茨城県)
    • 年月日
      2010-03-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Further Simplification of the BPTI Sequence : Minimum Information for Specifying a Native Protein Structure2009

    • 著者名/発表者名
      Yutaka Kuroda, Mohammad Monirul Islam, Shihori Sohya, Keiichi No guchi, Masafumi Yohda
    • 学会等名
      第2回日韓生体分子科学セミナー「実験とシミュレーション」
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2009-12-22
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 超単純化BPTIに於ける揺らぎ~X線結晶構造解析を用いた分子レベルでの解明~(Molecular Fluctuations in Extensively Simplified BPTI Variants Examined by X-ray Crystallography)2009

    • 著者名/発表者名
      黒田裕、イスラム M モハマド
    • 学会等名
      新学術領域研究「揺らぎと生体機能」第3回公開シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
    • 年月日
      2009-12-20
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] 点変異によって13度熱安定化したBPTI変異体の構造及び熱安定性の解析2009

    • 著者名/発表者名
      イスラム M モハマド、惣谷志保里、野口恵一、城所俊一、養王田正文、黒田裕
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アクティとくしま(徳島県)
    • 年月日
      2009-11-01
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] BPTI変異体の熱安定性とタンパク質間相互作用の共進化的視点からの解析シンポジウム2009

    • 著者名/発表者名
      黒田裕
    • 学会等名
      第47回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      アクティとくしま(徳島県)
    • 年月日
      2009-10-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] アミノ酸配列単純化法を用いたBPTI蛋白質の構造形成及び熱安定性の解析2009

    • 著者名/発表者名
      黒田裕、イスラム M モハマド
    • 学会等名
      第82回日本生化学会年会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県)
    • 年月日
      2009-10-24
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2024-03-26  

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