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トゲネズミ三種の比較解析によるY染色体消失過程の推定

研究課題

研究課題/領域番号 09J01887
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 遺伝・ゲノム動態
研究機関北海道大学

研究代表者

村田 知慧  北海道大学, 大学院・生命科学院, 特別研究員(DC2)

研究期間 (年度) 2009 – 2010
研究課題ステータス 完了 (2010年度)
配分額 *注記
1,400千円 (直接経費: 1,400千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2009年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワードTokudaia / 性染色体 / SRY / 進化 / FISH / CGH / 分子系統解析 / Zoo-FISH解析
研究概要

トゲネズミ属3種のうち、アマミトゲネズミとトクノシマトゲネズミは、XO/XO型の性染色体構成をもち、Y染色体だけでなく性決定遺伝子SRYを消失した極めてめずらしい哺乳類である。一方、オキナワトゲネズミ(以下オキナワ)は、一般的なXX/XY型の性染色体をもつが、その性染色体は一対の常染色体の転座により大型化し、SRYは特異的なアミノ酸置換と重複により独自の進化を遂げている。トゲネズミ属のY染色体の進化過程を明らかにすることを目的とし、平成22年度はオキナワにおいて、性染色体のさらなる構造変化の有無の検出、祖先Y染色体領域の同定、SRYの機能性予測をおこなった。29のマウスのcDNAクローンを用いたFISH解析の結果、オキナワの祖先X染色体領域(Xq)および性染色体に転座した常染色体領域(Xp、Yp)は他のネズミ類の遺伝子オーダーと一致し、構造変化はみられなかった。ただし、アマミトゲネズミの性決定候補遺伝子であるCBX2が、オキナワにおいて常染色体の転座に伴い、性染色体に連鎖し、さらに他の染色体に重複していた。また、CGH解析の結果、オキナワのY染色体に性特異的な領域は検出されなかったが、単一のY連鎖遺伝子と同定されたDDX3YとUTYのcDNAクローンを用いたFISHの結果、両遺伝子はYpの動原体付近に存在し、祖先Y染色体領域がYp動原体付近に保持されていることをつきとめた。さらに、SOX9の精巣特異的エンハンサー領域にあるSRY結合配列の保存性を、マウス、ラット、ヒト、オキナワにおいて比較した結果、結合サイトの一つにオキナワ特異的な置換がみられ、保存性が失われていた。今回の結果から、トゲネズミ共通祖先はY染色体にいくつかのY連鎖遺伝子を保持していたことが明らかとなったが、SRYの機能はトゲネズミ共通祖先において、すでに低下もしくは消失していた可能性が考えられた。トゲネズミ属のY染色体進化を解明するために、オキナワは鍵となる重要な種であることが本研究によって強く示された。

報告書

(2件)
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (12件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (9件)

  • [雑誌論文] A primer set to determine sex in the small Indian mongoose, Herpestes auropunctatus.2011

    • 著者名/発表者名
      Chie Murata, Go Ogura, Asato Kuroiwa
    • 雑誌名

      Molecular Ecology Resources

      巻: VOL.11 ページ: 386-388

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Multiple copies of SRY genes on the large Y chromosome of the Okinawa spiny rat, Tokudaia muenninki.2010

    • 著者名/発表者名
      Chie Murata, Fumio Yamada, Norihiro Kawauchi, Yoichi Matsuda, Asato Kuroiwa
    • 雑誌名

      Chromosome Research

      巻: VOL.18 ページ: 623-634

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Rediscovery after thirty years since the last capture of the critically endangered Okinawa spiny rat Tokudaia muenninki in the northern part of Okinawa Island.2010

    • 著者名/発表者名
      Fumio Yamada, Norihiro Kawauchi, Katsushi Nakata, Shintaro Abe, Nobuhiko Kotaka, Atsushi Takashima, Chie Murata, Asato Kuroiwa
    • 雑誌名

      Mammal Study

      巻: VOL.35 ページ: 243-255

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Y染色体の運命-オキナワトゲネズミにおける新たな性染色体領域の獲得とSRY遺伝子の機能性-2010

    • 著者名/発表者名
      村田知慧, 山田文雄, 河内紀浩, 松田洋一, 黒岩麻里
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会合同大会
    • 発表場所
      兵庫県神戸市 神戸ポートアイランド
    • 年月日
      2010-12-07
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] トゲネズミのY染色体進化-Y染色体の消失と存続-2010

    • 著者名/発表者名
      村田知慧, 黒岩麻里
    • 学会等名
      日本遺伝学会第82回大会
    • 発表場所
      北海道札幌市 北海道大学(招待講演)
    • 年月日
      2010-09-20
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] トゲネズミの染色体進化と遺伝的多様性2010

    • 著者名/発表者名
      村田知慧, 黒岩麻里
    • 学会等名
      第16回野生生物保護学会・日本哺乳類学会2010年度合同大会
    • 発表場所
      岐阜県岐阜市 岐阜大学(招待講演)
    • 年月日
      2010-09-18
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] オキナワトゲネズミのSRYの機能性と新たな性染色体領域の構造2010

    • 著者名/発表者名
      村田知慧, 山田文雄, 河内紀浩, 松田洋一, 黒岩麻里
    • 学会等名
      第12回日本進化学会大会
    • 発表場所
      東京都目黒区 東京工業大学
    • 年月日
      2010-08-03
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Y染色体の運命~トゲネズミにみられるY染色体消失と存続~2009

    • 著者名/発表者名
      村田知慧
    • 学会等名
      第32回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜
    • 年月日
      2009-12-11
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] オキナワトゲネズミの性染色体の大型化2009

    • 著者名/発表者名
      村田知慧
    • 学会等名
      染色体学会第60回年会
    • 発表場所
      くにびきメッセ
    • 年月日
      2009-11-13
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] オキナワトゲネズミTokudaia muenninkiの性染色体進化2009

    • 著者名/発表者名
      村田知慧
    • 学会等名
      沖縄生物学会第46回大会
    • 発表場所
      名桜大学
    • 年月日
      2009-05-30
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] オキナワトゲネズミTokudaia muenninkiの性染色体とSRY遺伝子の進化2009

    • 著者名/発表者名
      村田知慧
    • 学会等名
      第11回日本進化学会大会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] オキナワトゲネズミのXおよびY染色体が大型したメカニズムの解明2009

    • 著者名/発表者名
      村田知慧
    • 学会等名
      日本哺乳類学会2009年度台北大会
    • 発表場所
      台湾大学 台湾
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2024-03-26  

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