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日本産ササ類のゲノム進化学的解析とその情報を用いた分類体系の再構築

研究課題

研究課題/領域番号 09J05970
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 森林科学
研究機関東北大学

研究代表者

松尾 歩  東北大学, 大学院・農学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2009年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワード日本産ササ類 / DNAバーコーディング / 形態変異 / 遺伝的変異 / 地理的変異 / 葉緑体ゲノム / 分子系統 / 分類体系 / 核ゲノム / 系統地理学的解析 / 集団遺伝学的解析 / 交雑種 / 分子系統学的解析
研究概要

最終年度である今年度は、日本産ササ類のゲノム進化学的解析とその情報を用いた分類体系の再構築を行うことを目的とし、1)日本産主要ササ類5種(チシマザサ・チマキザサ・クマイザサ・ミヤコザサ・スズタケ)の22地域集団1260サンプルを対象とした形態変異に関する解析(連続的に変異する形質と特徴的な形質を抽出)、2)DNAバーコーディング領域(rbcL、matk、trnH-psbA)を対象とした日本産タケ・ササ類(13属47種64サンプル)の分子系統樹の構築、3)葉緑体ゲノムの多型領域を対象とした日本産主要ササ類5種(22地域集団、152サンプル)の種間・種内の遺伝的変異および地理的な変異に関する解析を行うことを計画した。
研究の成果は、次の通りである。1)日本産主要ササ類5種の全22地域集団1260サンプルを対象として形態変異に関する解析を行った結果、種によっては特徴的な形質を持つことが分かったが、同定基準となっている形質の多くが連続的に変異していることが認められた。2)DNAバーコーディング領域における分子系統解析を行った結果、形態が顕著に異なっているタケ・ササ類の種においてもDNAバーコーディング領域では種を明瞭に区別することが困難であることが分かった。3)日本産主要ササ類5種の種間・種内の遺伝的な変異および地理的な変異を葉緑体ゲノムの多型領域(約8000bp)を用いて解析した結果、葉緑体ゲノムの多型領域では日本産主要ササ類5種の種内・種間および地理的な変異に明瞭な傾向が認められないことが分かった。
上記の結果から、日本産ササ類の種は形態だけではなく遺伝的にも極めて似ている分類群である可能性が示唆された。

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (6件)

すべて 2011 2010 2009

すべて 雑誌論文 (1件) (うち査読あり 1件) 学会発表 (4件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] チュウゴクザサとチシマザサにおける地下茎の分枝・伸張様式とジェネットの空間分布構造2010

    • 著者名/発表者名
      松尾歩・陶山佳久・蒔田明史
    • 雑誌名

      日本生態学会誌 60

      ページ: 81-88

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] 日本産ササ類における地理的・形態的・遺伝的変異2011

    • 著者名/発表者名
      松尾歩・蒔田明史・陶山佳久
    • 学会等名
      第58回日本生態学会札幌大会
    • 発表場所
      北海道
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] 日本産ササ類における形態および葉緑体DNAの変異2010

    • 著者名/発表者名
      松尾歩・蒔田明史・陶山佳久
    • 学会等名
      第42回種生物学会
    • 発表場所
      京都
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] The relationship between reproductive success clonal structure in a simultaneous flowering population of the momocarpic dwarf bamboo, Sasa veitchii var. hirsuta.2009

    • 著者名/発表者名
      Matsuo A, Suyama Y, Shibata S, Makita A.
    • 学会等名
      7th International Symposium on Integrated Field Science
    • 発表場所
      Sendai (Miyagi)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] Effects of vegetative growth on reproductive success in a mass-flowering population of the monocarpic dowarf bamboo, Sasa veitchii var. hirsuta.2009

    • 著者名/発表者名
      Matsuo A, Suyama Y, Shibata S, Makita A.
    • 学会等名
      9th Clonal Plant Workshop
    • 発表場所
      Luven (Belgium)
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [図書] 社会的責任-環境機器時代に適応する7つの教養2011

    • 著者名/発表者名
      東北大学生態適応GCOEチームPEM
    • 出版者
      東北大学出版会
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2024-03-26  

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