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in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトコンドリア膜透過装置の解析

研究課題

研究課題/領域番号 09J08047
研究種目

特別研究員奨励費

配分区分補助金
応募区分国内
研究分野 分子生物学
研究機関名古屋大学

研究代表者

塩田 拓也  名古屋大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

研究期間 (年度) 2009 – 2011
研究課題ステータス 完了 (2011年度)
配分額 *注記
2,100千円 (直接経費: 2,100千円)
2011年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2010年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
2009年度: 700千円 (直接経費: 700千円)
キーワードミトコンドリア / 部位特異的光架橋法 / シャペロン / 質量分析 / 分子シャペロン
研究概要

私は、in vivo部位特異的光架橋法を用いて、ミトコンドリア外膜膜透過装置のTOM40複合体のサブユニットで、受容体など多様な機能をもつ、Tom22の相互作用解析を行っている。in vivo部位特異的光架橋法とは、解析対象のタンパク質にBPAという光架橋側鎖をもつ非天然アミノ酸を部位特異的に導入し、UV照射により架橋を行う方法で、アミノ酸残基レベルの空間分解能で相互作用解析が行える手法である。Tom22について,サイトゾルドメインとTOM40複合体のもうひとつの受容体サブユニットTom20との相互作用,膜間部ドメインと内膜膜透過装置TIM23複合体の受容体サブユニットTim50との相互作用について,基質プレ配列または基質前駆体の存在下と非存在下,in vivoおよびin organelloで部位特異的光架橋を用いて解析し,Tom22の機能時の動的なタンパク質間相互作用変化を解明した。得られた結果は,in vivo部位特異的光架橋法が細胞内における膜タンパク質複合体の機能と関連した相互作用及びその変化を十分な空間分解能で明らかにできる強力な手法であることを示すものであり,PANS誌に論文発表した。
さらに酵母細胞内で過剰発現したTom22がTOM40複合体に組み込まれる前に一過的に相互作用する因子として,サイトゾルのシャペロンに加えてミトコンドリア外膜タンパク質ポリン(Por1)を見出した。野生株、Por1破壊株、Por2破壊株におけるTom22の安定性をシクロヘキシミドチェイス実験により検討した。その結果、Por1破壊株ではTom22の安定性にわずかに影響が見られた。以上の結果から、Por1はTOM40複合体に含まれなかったTom22と一時的に相互作用し、分解から保護していることが示唆された

報告書

(3件)
  • 2011 実績報告書
  • 2010 実績報告書
  • 2009 実績報告書
  • 研究成果

    (18件)

すべて 2011 2010 2009 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (11件) 備考 (5件)

  • [雑誌論文] In vivo protein-interaction mapping of a mitochondrial translocator protein Tom22 at work2011

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 雑誌名

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      巻: 108 号: 37 ページ: 15179-15183

    • DOI

      10.1073/pnas.1105921108

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
    • 査読あり
  • [雑誌論文] Roles of Tom70 in import of presequence-containing mitochondrial proteins.2009

    • 著者名/発表者名
      山本林
    • 雑誌名

      THE JORNAL OF BIOROGICAL CHEMISTRY 284

      ページ: 31635-316416

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
    • 査読あり
  • [学会発表] Analysis of the protein interaction mapping of Tom22, a component of the mitochondrial outer membrane translocator, by using in vivo site-specific photocrosslinking2011

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      EMBO Conference Series PROTEIN TRANSPORT SYSTEMS
    • 発表場所
      カリアリ、イタリア
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法および質量分析をもちいたミトコンドリア外膜膜透過装置構成因子Tom22の相互作用解析2011

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      大阪、吹田市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法によるミトコンドリア膜透過装置の解析2011

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      「タンパク質の社会」主催第4回若手ワークショップ
    • 発表場所
      滋賀、高島市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] 構造モデリングとin vivo部位特異的光架橋法を用いたTOM40複合体の構造解析2011

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      2011年度特定領域「タンパク質の社会」全体班会議
    • 発表場所
      大分、別府市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法を用いた、ミトコンドリア外膜タンパク質Tom22の外膜挿入機構の解析2011

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      第34回日本分子生物学会年会
    • 発表場所
      神奈川、横浜市
    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトコンドリア外膜膜透過装置サブユニットTom22の解析2010

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      第74回日本生化学会中部支部例会・シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学大学院医学系研究科・中央診療棟3階講堂
    • 年月日
      2010-05-29
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法によるミトコンドリア外膜膜透過装置構成因子Tom22の解析2010

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      「タンパク質の社会」主催第3回若手ワークショップ
    • 発表場所
      グローバルアリーナ(福岡県宗像市)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] Analysis of the interaction mapping of Tom22, a component of the mit-ochondrial outer membrane translocator, by using in vivo site-specific photoctrosslinking2010

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      第3回タンパク質の社会に関する国際会議The 3rd International Symposiumon Protein Comunity
    • 発表場所
      ホテル日航奈良(奈良)
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法によるミトコンドリア外膜膜透過装置構成因子Tom22の機能解析2010

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会 第83回日本生化学会大会 合同大会
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド
    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトントリア外膜膜透過装置の解析2009

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      第9回日本蛋白質科学年会
    • 発表場所
      熊本全日空ホテルニュースカイ
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [学会発表] in vivo部位特異的光架橋法を用いたミトントリア外膜膜透過装置TOM40複合体解析2009

    • 著者名/発表者名
      塩田拓也
    • 学会等名
      「タンパク質の社会」主催第2回若手ワークショップ
    • 発表場所
      関西セミナーハウス
    • 関連する報告書
      2009 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.bio.nagoya-u.ac.jp/gcoe/purpose/shien/wakate/2011/shiota.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://www.protein.bio.titech.ac.jp/result/result_endo5.html

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://biochem.chem.nagoya-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2011 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://biochem.chem.nagoya-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2010 実績報告書
  • [備考]

    • URL

      http://biocem.chem.nagoya-u.ac.jp/

    • 関連する報告書
      2009 実績報告書

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公開日: 2009-04-01   更新日: 2024-03-26  

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